第三章酶与生物催化剂 刘新文 Enzyme 北京大学医学部生化与分子生物学系
第三章 酶与生物催化剂 刘新文 北京大学医学部生化与分子生物学系
刘新文,酶 第一节一般概述 SUULEUULUUULELEELLUUUUULLULUUULELUULLUUUUUUUULLELE
刘新文,酶 第一节 一般概述
刘新文,酶 目前将生物催化剂分为两类:酶、非酶 生物催化剂(核酶,脱氧核酶等) 酶是一类由活细胞产生的,对其特异底物 具有高效催化作用的蛋白质。 酶的化学本质:蛋白质
刘新文,酶 酶的化学本质:蛋白质 酶是一类由活细胞产生的,对其特异底物 具有高效催化作用的蛋白质。 目前将生物催化剂分为两类: 酶 、 非酶 生物催化剂 (核酶,脱氧核酶等)
刘新文,酶 第二节酶分子的结构特点 SUULEUUUUUUUUUULELUUUUULLULUUULEULLUUUUUUUUULLULL
刘新文,酶 第二节 酶分子的结构特点
刘新文,酶 分子组成 1、酶的分类 ■单体酶:只有一条多肽链 ■寡聚酶:具有多条多肽链 ■多功能酶(串联酶):一个酶分子具有多种生 物催化活性,由多酶体系在进化中基因融合形成 ■单纯酶、结合酶
刘新文,酶 一、分子组成 1、酶的分类 单体酶:只有一条多肽链 寡聚酶:具有多条多肽链 多功能酶(串联酶):一个酶分子具有多种生 物催化活性,由多酶体系在进化中基因融合形成 单纯酶、结合酶
刘新文,酶 2、结合酶的组成成分 2 酶蛋白(apoenzyme):多肽;决定 全酶 特异性、高效性 (holoenzyme) 辅助因子(cofactor):非蛋白组分; 递氢、电子、基团;决定反应类型、 性质 ■辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合牢固,不 能用透析等简单方法与酶蛋白分离的有机小分子 ■辅酶(coenzyme)::与酶蛋白结合不牢固,能用 透析等简单方法与酶蛋白分离的有机小分子
刘新文,酶 酶蛋白 (apoenzyme) :多肽;决定 特异性、高效性 辅助因子(cofactor):非蛋白组分; 递氢、电子、基团;决定反应类型、 性质 全酶 (holoenzyme) 2、结合酶的组成成分 辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合牢固,不 能用透析等简单方法与酶蛋白分离的有机小分子 辅酶(coenzyme): :与酶蛋白结合不牢固,能用 透析等简单方法与酶蛋白分离的有机小分子
刘新文,酶 辅酶辅基与维生素及核苷酸的关系 辅助成分 作 用 维生素组分 苷酸组 分 NAD+(辅酶I) 递氢(脱氢酶) 尼克酰胺 NADP+(辅酶I) (Vpp,Bs) AMP CoA-SH(辅酶A) 转移酰基 泛酸(B3) FH(四氢叶酸) 转移一碳单位 叶酸(B11) 转移氨基(转 磷酸吡哆醛/胺 氨酶)、羧基 吡哆醛/胺 (脱羧酶) (B6) 焦磷酸硫胺素TPP 转移醛基 硫胺素(B,) 黄素腺嘌呤二核苷酸FAD AMP 递氢(脱氢酶) 核黄素(B2) FMN(黄素单核苷酸)
刘新文,酶 辅酶辅基与维生素及核苷酸的关系 核苷酸组 分 作 用 维生素组分 辅助成分 AMP 尼克酰胺 (Vpp, B5 ) 递氢(脱氢酶) NAD+ (辅酶Ⅰ) NADP+ (辅酶Ⅱ) CoA-SH(辅酶A) 转移酰基 泛酸(B3 ) FH4 (四氢叶酸) 转移一碳单位 叶酸(B11) 吡哆醛/胺 (B6 ) 转移氨基(转 氨酶)、羧基 (脱羧酶) 磷酸吡哆醛/胺 焦磷酸硫胺素TPP 转移醛基 硫胺素(B1 ) AMP 递氢(脱氢酶)核黄素(B2 ) 黄素腺嘌呤二核苷酸FAD FMN(黄素单核苷酸)
刘新文,酶 二、 活性中心(active site)A >必需基团:活性中心的必需基团、活性中心以 外的必需基团 >活性中心:底物结合部位十催化部位 活性中心是酶与底物结合并表现催化作用的空 间区域,大多由肽链上远隔的氨基酸残基提供必需 基团,经肽链盘绕折叠,使之在三维空间相互接近, 构成特定的空间构象,起催化中心作用。在结合酶 中,辅基与辅酶也参与活性中心的组成
刘新文,酶 二、活性中心(active site) 必需基团:活性中心的必需基团、活性中心以 外的必需基团 活性中心:底物结合部位+催化部位 活性中心是酶与底物结合并表现催化作用的空 间区域,大多由肽链上远隔的氨基酸残基提供必需 基团,经肽链盘绕折叠,使之在三维空间相互接近, 构成特定的空间构象,起催化中心作用。在结合酶 中,辅基与辅酶也参与活性中心的组成
刘新文,酶 三、空间结构的灵活性与调节酶 1、别构酶与别构调节 2、共价调节酶与化学修饰调节 3、同工酶(isoenzyme) 4、酶原激活
刘新文,酶 三、空间结构的灵活性与调节酶 1、别构酶与别构调节 2、共价调节酶与化学修饰调节 3、同工酶(isoenzyme) 4、酶原激活
刘新文,酶 第三节酶促反应的 特点及机理 SUULSUULUUUUULLUUUUULLULUUULEUUULLUUUUULLUUUULLLL
刘新文,酶 第三节 酶促反应的 特点及机理