刘奇大,鱼给化象蜂轮 第十二章 RNA生物合成 RNA transcription
刘新文,生物化学绪论 第十二章 RNA生物合成 RNA transcription
[概述]:DNA转录RNA前体加工成熟RNA的过程 RNA合成的两种方式: 1、DNA指导的RNA合成。 2、RNA指导的RNA合成。 第一节转录作用 一、转录作用及特点 由DNA指导的RNA合成,DNA以碱基互补原则, 决 定合成RNA的全部碱基成分及排列顺序,将DNA模 板 上的遗传信息传递到RNA分子的过程为转录作用。 1、反应体系:DNA模板,NTP,酶,Mg2+,Mn2+, 合成
[概述]:DNA转录RNA前体 加工成熟RNA的过程 RNA合成的两种方式: 1、 DNA指导的 RNA合成。 2、 RNA指导的 RNA合成。 第一节 转录作用 一、转录作用及特点 由DNA指导的RNA合成, DNA以碱基互补原则, 决 定合成RNA的全部碱基成分及排列顺序,将DNA模 板 上的遗传信息传递到RNA分子的过程为转录作用。 1、反应体系: DNA模板,NTP,酶,Mg2+,Mn2+, 合成 方向5’3’。连接方式- 3’ , 5’磷酸二酯键
DNA片段转录时,双链DNA中只有一条链作为转 录 的模板,这种转录方式称作不对称转录。(图12 1 模板链及反意义链:(template strand) 指导RNA合成的DNA模板链。 编码链及有意义链:(coding strand) 不作为转录的另一条DNA链。(图12-2) 由于基因分布于不同的DNA单链中,即某条DNA 单 链对某个基因是模板链,而对另一个基因则是编 码链。 原料: 四种磷酸核苷NTP,DNA中的A在RNA中 变为U
DNA片段转录时,双链DNA中只有一条链作为转 录 的模板,这种转录方式称作不对称转录。(图12- 1 模板链及反意义链:(template strand) 指导RNA合成的DNA模板链。 编码链及有意义链:(coding strand) 不作为转录的另一条DNA链。 (图12-2) 由于基因分布于不同的DNA单链中,即某条DNA 单 链对某个基因是模板链,而对另一个基因则是编 码链。 原料:四种磷酸核苷NTP,DNA中的A在RNA中 变为U
[组成]:5个亚基,c2BB’o为全酶,2BB'为核 心酶。 [作用]: 识别DNA分子中转录的起始部位。 促进与模板链结合,并使DNA双链打开17bp.。 催化NTP的聚合,完成一条RNA链的聚合反应。 识别转录终止信号,停止聚合反应,参与转录 水平的调控。(图123) [特点:聚合速率慢,3085NTP/秒。 缺乏外切酶活性,无校对功能,错误率106。 不同的σ识别不同的启动子。例:σ32识别热休 克启动子。 可被药物抑制(利福平)。人的RNA聚合酶对 利 方
[组成]:5个亚基,2 ’ 为全酶, 2 ’为核 心酶。 [作用]: 识别DNA分子中转录的起始部位。 促进与模板链结合,并使DNA双链打开17bp.。 催化NTP的聚合,完成一条RNA链的聚合反应。 识别转录终止信号,停止聚合反应,参与转录 水平的调控。(图12-3) [特点]: 聚合速率慢,30~85NTP/秒。 缺乏外切酶活性,无校对功能,错误率10-6 。 不同的识别不同的启动子。例:32识别热休 克启动子。 可被药物抑制(利福平)。人的RNA聚合酶对 利 福平不敏感。利用此特点可研制杀菌药物
真核较原核的酶复杂,已清楚的有I,Ⅱ,Ⅲ及Mt 4 型。(表12-1) [组成]:均由多亚基构成,聚合酶Ⅱ中的某个亚 基与原核聚合酶的β亚基高度同源。 四、启动子及终止子(promoter,terminator,stop signal) (一)启动子 1、原核启动子:[结构约55bp,分为起始点 (start site)、结合部位、识别部位。 [功能] 起始点:转录起始部位以+1表示,转录的 第1个核苷酸常为嘌呤-G,A。 壮△立倍.的hn阳式旦立:但字又比右应
真核较原核的酶复杂,已清楚的有Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ及Mt 4 型。(表12-1) [组成]:均由多亚基构成,聚合酶Ⅱ中的某个亚 基与原核聚合酶的亚基高度同源。 四、启动子及终止子(promoter,terminator,stop signal) (一)启动子 1、原核启动子:[结构]约55bp,分为起始点 (start site)、结合部位、识别部位。 [功能] 起始点:转录起始部位以+1表示,转录的 第1个核苷酸常为嘌呤-G,A。 结合部位:约6bp组成,是高度保守区,共有序列
易解开双链,为RNA聚合酶提供场所。 识别部位:约6bp组成,在-35处,为高度保守区, 序 列5’-TTGACA-3',σ因子识别此部位。(图124) 2、真核启动子结构(以RNA polⅡ为例) 于-25处含AT富集区,共有序列TATAA(TATA box) -70处含共有序列CAAT,还含许多其它box,例如 GC b0x,E-b0x等。(图12-5) 含增强子[enhancer]和静息子[silencsr] RNA pol I和RNA polIⅢ与聚合酶Ⅱ所识别的启 动 子差异较大
易解开双链,为RNA聚合酶提供场所。 识别部位:约6bp组成,在-35处,为高度保守区, 序 列5’-TTGACA-3’, 因子识别此部位。(图12-4) 2、真核启动子结构(以RNA polⅡ为例) 于-25处含AT富集区, 共有序列TATAA(TATA box) -70处含共有序列CAAT ,还含许多其它box ,例如 GC box,E-box等。(图12-5) 含增强子[enhancer]和静息子[silencsr] RNA polⅠ和 RNA polⅢ与聚合酶Ⅱ所识别的启 动 子差异较大
蛋白ρ因子辅助识别终止信号,参与终止。 五、转录过程 (以原核为例) (一)起始 RNA聚合酶-O识别起始位点 ↓ 核心酶与DNA结合 E 以核心酶 DNA构象改变→局部双链打开I7bp→NTP形成3’,5’二酯键→ 形式 沿 DNA滑动 σ因子可再次与核心酶结合,循环使用。 (二)延长 形成转录泡-由DNA双链,RNA聚合酶与新合成的 转录本RNA局部形成的结构,它贯穿于延长过程的 始终。 2E -niA共 0 厂,米治一出油口左 △共=凸E
蛋白因子辅助识别终止信号,参与终止。 五、转录过程 (以原核为例) (一)起始 RNA聚合酶-σ识别起始位点 ↓ 核心酶与DNA结合 ↓ E 以核心酶 DNA构象改变→局部双链打开17bp→NTP形成3’,5’二酯键 形式 沿 DNA滑动 因子可再次与核心酶结合,循环使用。 (二)延长 形成转录泡-由DNA双链,RNA聚合酶与新合成的 转录本RNA局部形成的结构,它贯穿于延长过程的 始终。 E 与DNA模板 3’ ,5’磷酸二酯键相连 合成方向5’ 3’
合成出的RNA与DNA形成杂交分子,约12bp,因 结 合不紧很易脱离。(图12-7) (三)终止 合成移到终止信号时,酶不滑动,聚合停止,转录完成。 [特点]p参与的终止:p与RNA产物中富含C的部 位 结合,并诱使RNA聚合酶构象改变停止滑动;p因子 的 解螺旋酶活性,利于RNA产物的释放。(图12-8) 其它终止方式:GC区形成发卡结构,聚U区使 配 对不稳定,RNA产物的释放。(图12-9 (四)真核生物转录特点
合成出的RNA与DNA形成杂交分子,约12bp,因 结 合不紧很易脱离。(图12-7) (三)终止 合成移到终止信号时,酶不滑动,聚合停止,转录完成。 [特点] 参与的终止:与RNA产物中富含C的部 位 结合,并诱使RNA聚合酶构象改变停止滑动; 因子 的 解螺旋酶活性,利于RNA产物的释放。(图12-8) 其它终止方式:GC区形成发卡结构,聚U区使 配 对不稳定, RNA产物的释放。(图12-9) (四)真核生物转录特点
形成转录起始复合物,需多种蛋白因子参与。 转录因子[[transcription factor]与反式作用因子 [[trans-acting factor小:(表12-2) 调节基因表达的蛋白为转录因子;它们与特异的 顺式作用元件相互作用,并激活另一基因的转录。 起始前复合物的形成[pre-initiation complex,PIC] TATATFIID TF II A TF II B RNAPOI II /TF II FTF II E PIC (图 12-10) 转录终止序列,在3’端之后有共同序列 AATAAA及 多个GT序列,mRNA在转录终止序列处被切断。 第二节真核生物转录后的加工 意义:转录生成的前体RNA,无生物学活性,需加
形成转录起始复合物,需多种蛋白因子参与。 转录因子[transcription factor]与反式作用因子 [trans-acting factor]:(表12-2) 调节基因表达的蛋白为转录因子;它们与特异的 顺式作用元件相互作用,并激活另一基因的转录。 起始前复合物的形成 [pre-initiation complex,PIC] TATATFⅡD TF Ⅱ A TF Ⅱ B RNAPol Ⅱ /TF Ⅱ F TF Ⅱ E PIC (图 12-10) 转录终止序列,在3’端之后有共同序列 AATAAA及 多个GT序列,mRNA在转录终止序列处被切断。 第二节 真核生物转录后的加工 意义:转录生成的前体RNA,无生物学活性,需加
末端添加核苷酸(terminal additing) 修饰(modification):在碱基和核糖上进行 化 学修饰。 RNA编辑(RNA editing) 、 mRNA前体的加工 (一)生成特点:[原核]: mRNA是多顺反子 (polycistronic],每分子RNA中含几种蛋白质信息, RNA寿命短,转录没完时翻译即开始。 例乳糖操纵子,含Z,Y,A三个基因,分别编码半乳 糖 苷酶、透过酶及乙酰基转移酶。 [真核]:单顺反子[monocistronic],一个mRNA仅 编
末端添加核苷酸(terminal additing) 修饰(modification):在碱基和核糖上进行 化 学修饰。 RNA编辑( RNA editing) 一、mRNA前体的加工 (一)生成特点:[原核] : mRNA是多顺反子 (polycistronic],每分子RNA中含几种蛋白质信息, RNA寿命短,转录没完时翻译即开始。 例:乳糖操纵子,含Z,Y,A三个基因,分别编码半乳 糖 苷酶、透过酶及乙酰基转移酶。 [真核]:单顺反子[monocistronic],一个mRNA仅 编