重组DNA技术 Recombinant DNA Technology 刘新文 nd 北京大学医学部生物化学与分子生物学系
重组DNA技术 刘新文 北京大学医学部生物化学与分子生物学系
刘新文,重组DNA技术 第一节概述 超 ■DNA克隆(DNA cloning):应用酶学的方法,在 体外将目的基因与载体DNA结合成一具有自我复 制能力的DNA分子一复制子,继而通过转化或转 染宿主细胞、筛选出含有目的基因的转化子细胞, 再进行扩增、提取获得大量同一DNA分子的过程。 DNA克隆又称基因克隆(gene cloning) I基因工程(genetic engineering):实现基因克 隆所采用的方法及相关的工作。又称重组DNA技 术(recombinant DNA technology)
刘新文,重组DNA技术 第一节 概述 DNA克隆(DNA cloning):应用酶学的方法,在 体外将目的基因与载体DNA结合成一具有自我复 制能力的DNA分子—复制子,继而通过转化或转 染宿主细胞、筛选出含有目的基因的转化子细胞, 再进行扩增、提取获得大量同一DNA分子的过程。 DNA克隆又称基因克隆(gene cloning)。 基因工程(genetic engineering):实现基因克 隆所采用的方法及相关的工作。又称重组DNA技 术(recombinant DNA technology)
刘新文, 重组DNA技术 一、】 克隆体系:目的基因、载体DNA、工具酶、宿 主细胞等 l、目的基因(target gene):cDNA或基因组DNA >CDNA (complementary DNA):指体外经反转录 合成的,与RNA(常指mRNA)互补的单链DNA, 单链cDNA进而合成双链cDNA。 >基因组DNA(genomic DNA):代表一个细胞或生 物体整套遗传信息的所有DNA序列,称为基因组 DNA。 2、载体(vector):质粒、 噬菌体、柯斯质粒载体、 病毒和人工染色体等
刘新文,重组DNA技术 一、克隆体系:目的基因、载体DNA、工具酶、宿 主细胞等 1、目的基因(target gene):cDNA或基因组DNA 2、载体(vector):质粒、噬菌体、柯斯质粒载体、 病毒和人工染色体等 cDNA (complementary DNA):指体外经反转录 合成的,与RNA (常指mRNA)互补的单链DNA, 单链cDNA进而合成双链cDNA。 基因组DNA(genomic DNA):代表一个细胞或生 物体整套遗传信息的所有DNA序列,称为基因组 DNA
刘新文,重组DNA技术 >质粒(plasmid):存在于细菌染色体外的小型环 状双链DNA分子,在细胞中可以独立进行复制并在 细胞分裂时恒定地传给子代细胞。 3、工具酶:限制性核酸内切酶、连接酶、DNA聚 合酶、逆转录酶、碱性磷酸酶、末端聚合酶、RNA 酶、DNA酶,等 3.1限制性核酸内切酶restriction endonuclease):存在 于细菌体内,能够识别和切割双链DNA内部特定核 苷酸序列的一类核酸酶。 >常用的是II类限制性内切酶 >许多限制性核酸内切酶II的识别序列属于回文结构
刘新文,重组DNA技术 质粒(plasmid):存在于细菌染色体外的小型环 状双链DNA分子,在细胞中可以独立进行复制并在 细胞分裂时恒定地传给子代细胞。 3.1 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease): 存在 于细菌体内,能够识别和切割双链DNA内部特定核 苷酸序列的一类核酸酶。 3、工具酶:限制性核酸内切酶、连接酶、DNA聚 合酶、逆转录酶、碱性磷酸酶、末端聚合酶、RNA 酶、DNA酶,等 常用的是II类限制性内切酶 许多限制性核酸内切酶II的识别序列属于回文结构
刘新文,重组DNA技术 >配伍末端(compatible end):不同限制性内切酶产 生的相同粘性末端 3.2DNA聚合酶:大肠杆菌DNA聚合酶I(全酶) Klenow/片段(KIenow酶)、T4DNA聚合酶以及Taq酶等 3.3DNA连接酶 >T4连接酶:可用于粘端与平端的连接 4、宿主细胞:大肠杆菌、酵母、动物细胞
刘新文,重组DNA技术 配伍末端(compatible end):不同限制性内切酶产 生的相同粘性末端 3.2 DNA聚合酶:大肠杆菌DNA聚合酶I(全酶)、 Klenow片段 (Klenow 酶)、T4 DNA聚合酶以及Taq酶等 3.3 DNA连接酶 T4 连接酶:可用于粘端与平端的连接 4、宿主细胞:大肠杆菌、酵母、动物细胞
刘新文,重组DNA技术 第二节DNA克隆的基本过程 ■分、切、接、转、筛、表达 “分”:目的基因及载体的制备 1、分离基因的方法:化学合成、PCR、基因组文库 cDNA文库 日¥ >聚合酶链反应(polymerase chain reaction,.PCR) 在反应体系中加入模板DNA、dNTP、特别设计的特 异引物及耐热的DNA聚合酶(常用Taq酶),经多次 变性、退火、延伸循环反应,使目的DNA呈指数合 成的过程
刘新文,重组DNA技术 第二节 DNA克隆的基本过程 分、切、接、转、筛、表达 一、“分”:目的基因及载体的制备 1、分离基因的方法:化学合成、PCR、基因组文库、 cDNA文库 聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR): 在反应体系中加入模板DNA、dNTP、特别设计的特 异引物及耐热的DNA聚合酶(常用Taq酶),经多次 变性、退火、延伸循环反应,使目的DNA呈指数合 成的过程
刘新文,重组DNA技术 >cDNA文库(cDNA library):以mRNA为模板,利用 反转录酶合成与mRNA互补的DNA,再复制成双链 CDNA片段,与适当载体连接后转入受体菌,这些受 体菌包含了所有cDNA信息,总称cDNA文库。常用 于筛选编码蛋白质的结构基因。 >基因组DNA文库(genomic DNA library):利用限制 性核酸内切酶将组织或细胞染色体DNA切割后,与 适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所 有基因组DNA信息,总称基因组DNA文库
刘新文,重组DNA技术 cDNA文库(cDNA library):以mRNA为模板,利用 反转录酶合成与mRNA互补的DNA,再复制成双链 cDNA片段,与适当载体连接后转入受体菌,这些受 体菌包含了所有cDNA信息,总称cDNA文库 。常用 于筛选编码蛋白质的结构基因。 基因组DNA文库(genomic DNA library):利用限制 性核酸内切酶将组织或细胞染色体DNA切割后,与 适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所 有基因组DNA信息,总称基因组DNA文库
刘新文,重组DNA技术 2、常用载体:质粒、噬菌体、病毒DNA >克隆载体(cloning vector).:用于目的基因的克隆、 扩增、序列分析和体外定点突变等 >表达载体(expression vector):用于在宿主细胞中表达 外源目的基因,获得大量表达产物 二、“切”:限制性内切酶切割目的基因和载体 NA“接”:重组体的构建 四、 “转”:重组DNA分子导入受体细胞f 1、转化(transformation):将质粒或其它外源DNA 导入宿主细胞(常用大肠杆菌),并使其获得新的表型 的过程
刘新文,重组DNA技术 2、常用载体:质粒、噬菌体、病毒DNA 克隆载体(cloning vector):用于目的基因的克隆、 扩增、序列分析和体外定点突变等 表达载体(expression vector):用于在宿主细胞中表达 外源目的基因,获得大量表达产物 二、“切”:限制性内切酶切割目的基因和载体 DNA 三、“接”:重组体的构建 四、“转”:重组DNA分子导入受体细胞 1、转化(transformation):将质粒或其它外源DNA 导入宿主细胞(常用大肠杆菌),并使其获得新的表型 的过程
刘新文,重组DNA技术 2、转染( transfection):将外源DNA导入真核细胞 的过程 3、感染(transfection):以)噬菌体、柯斯质粒和 病毒为载体的重组DNA分子,在体外经过包装成具 有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,才能感染适当的 细胞,并在细胞内扩增。也称为转导(transduction). 五、“筛”:筛选出含重组DNA的受体细胞R 1、直接选择法:遗传标记【抗药性标志选择、营 养缺陷型的互补筛选法及分子标记(PC、分子杂 交)】 2、非直接选择法:免疫化学法、酶联免疫检测法
刘新文,重组DNA技术 2、转染(transfection):将外源DNA导入真核细胞 的过程 3、感染(transfection):以噬菌体、柯斯质粒和 病毒为载体的重组DNA分子,在体外经过包装成具 有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,才能感染适当的 细胞,并在细胞内扩增。也称为转导(transduction) 五、“筛”:筛选出含重组DNA的受体细胞 1、直接选择法:遗传标记【抗药性标志选择、营 养缺陷型的互补筛选法及分子标记(PCR、分子杂 交)】 2、非直接选择法:免疫化学法、酶联免疫检测法
刘新文,重组DNA技术 六、 “表达”:使克隆基因在宿主细胞中复制、表 、 外源基因在原核细胞的表达 >大肠杆菌是最常用的原核表达体系 >真核基因在原核细胞中表达的蛋白质常常形成不溶 性的包涵体 2、真核表达体系:酵母、昆虫及哺乳动物细胞等
刘新文,重组DNA技术 六、“表达”:使克隆基因在宿主细胞中复制、表 达1、外源基因在原核细胞的表达 大肠杆菌是最常用的原核表达体系 真核基因在原核细胞中表达的蛋白质常常形成不溶 性的包涵体 2、真核表达体系:酵母、昆虫及哺乳动物细胞等