西安交通大学XIANJIAOTUNIVERSITY肿瘤免疫麦通大学病原生物学与免疫学系2022年10月
病原生物学与免疫学系 2022年10月 肿瘤免疫
第一节肿瘤抗原肿瘤有抗原吗？免疫缺陷的患者容易罹患肿瘤肿瘤组织中有淋巴细胞漫润肿瘤患者体内有抗肿瘤细胞抗体切除肉瘤后的小鼠正常同系小鼠免疫的同系小鼠
第一节 肿瘤抗原 • 免疫缺陷的患者容易罹患肿瘤 • 肿瘤组织中有淋巴细胞浸润 • 肿瘤患者体内有抗肿瘤细胞抗体 切除肉瘤后的小鼠 正常同系小鼠 免疫的同系小鼠 肿瘤有抗原吗？
肿瘤抗原是细胞癌变过程中出现的新抗原及过度表达的抗原总称
肿瘤抗原是细胞癌变过程中出现的新抗原及过度 表达的抗原总称
肿瘤抗原的分类根据抗原的特异性分类肿瘤特异性抗原（TumorspecificantigenTSA)：只存在于某种肿疮细胞，正常组织不表达。是良好的肿瘤标记物和肿瘤特异性治疗的靶点。目前所发现的TSA极少，MAGE-1（黑色素瘤）肿瘤相关性抗原（tumorassociatedantigenTAA）肿痛细脆和正常细胞均有衰达，肿疮发生时会量异常增高。目前发现的肿瘤抗原多属于此。AFPCEA，HER-2
肿瘤抗原的分类 一 根据抗原的特异性分类 肿瘤特异性抗原(Tumor specific antigen TSA)： 只存在于某种肿瘤细胞，正常组织不表达。是良好的肿瘤标记物和肿瘤特异 性治疗的靶点。目前所发现的TSA极少, MAGE-1(黑色素瘤） 肿瘤相关性抗原（tumor associated antigen TAA) ： 肿瘤细胞和正常细胞均有表达，肿瘤发生时含量异常增高。目前发现的肿瘤 抗原多属于此。AFP CEA，HER-2
肿瘤抗原的分类·二根据肿瘤抗原发生的机制突变基因表达的细胞蛋白致癌病毒表达的肿瘤抗原正常基因异常表达的细胞蛋白
肿瘤抗原的分类 • 二 根据肿瘤抗原发生的机制 突变基因表达的细胞蛋白 致癌病毒表达的肿瘤抗原 正常基因异常表达的细胞蛋白
1突变基因表达的细胞蛋白自发的基因突变肿瘤抗原明确2)理化因素诱导的突变肿瘤抗原随机Penetration of UvIntothe SkinBeforeincomingUVPhoton
1 . 突变基因表达的细胞蛋白 1 ） 自发的基因突变 2） 理化因素诱导的突变 肿瘤抗原明确 肿瘤抗原随机
肿瘤突变负荷(Tumor mutation burden,TMB)：每百万个bp中非同义突变的数量。低（<10mutation/Mb）中（1019mutation/Mb）高（≥20mutation/Mb）与患者对检查点治疗的有效性相关。高TMB与较好的反应性相关产生新的肿瘤抗原肿瘤新抗原负荷tumorneuantigenburdon,TNB
• 每百万个bp中非同义突变的数量。 低（<10mutation/Mb） 中（10`19mutation/Mb） 高（≥20mutation/Mb） • 与患者对检查点治疗的有效性相关。 高TMB与较好的反应性相关 • 产生新的肿瘤抗原 肿瘤新抗原负荷 tumor neuantigen burdon，TNB 肿瘤突变负荷 （Tumor mutation burden，TMB）
TMB的检测方法：1.全外显子测序对全基因组的外显子测序，发现非同义突变。是TMB检测的金标准2.靶基因群测序对某段基因组测序（>1Mb），发现非同义突变各公司产品平台所测区域不同
TMB的检测方法： 1. 全外显子测序 对全基因组的外显子测序，发现非同义突变。是TMB检测的金标准。 2. 靶基因群测序 对某段基因组测序（>1Mb），发现非同义突变 各公司产品平台所测区域不同
LaboratoryTypeofexonicPanel nameNumberofTotalregionTMBregioncovered (Mb)covered(Mbmutationsgenesincluded inTMBestimationACT4401.121.80Non-ACTOnco+GenomicssynonymoussynonymousCaris1.601.40SureSelectXT592Non-synonymous2.200.80FoundationFoundationo324Non-neCDx?Medicinesynonymous,synonymousGuardant5002.151.00GuardantoMNon-NIHealthsynonymous,synonymous5231.97IlluminaTSO5001.33Non-(TruSightsynonymous,Oncologysynonymous500)1.531.14MemorialMSK-IMPACT468Non-SloansynonymousshKettering J.Kuck,StenzingerA SinicropeFABiomarkerinSolidTumo12):1808-1825orMutafinnalBurdenasaEfs.CancerDiscov.2020Dec;10
Laboratory Panel name Number of genes Total region covered (Mb) TMB region covered * (Mb ) Type of exonic mutations included in TMB estimation ACT Genomics ACTOnco+ 440 1.80 1.12 Nonsynonymous † , synonymous Caris SureSelect XT 592 1.60 1.40 Nonsynonymous † Foundation Medicine FoundationO ne CDx®‡ 324 2.20 0.80 Nonsynonymous, synonymous Guardant Health GuardantOM NI§ 500 2.15 1.00 Nonsynonymous, synonymous Illumina TSO500 (TruSight Oncology 500) 523 1.97 1.33 Nonsynonymous, synonymous Memorial Sloan Kettering Cancer Center MSK-IMPACT¶ 468 1.53 1.14 Nonsynonymous Sha D, Jin Z, Budczies J, Kluck K, StenzingerA, Sinicrope FA. Tumor Mutational Burden as a Predictive Biomarker in Solid Tumors. Cancer Discov. 2020 Dec;10(12):1808-1825
肿瘤新抗原的预测是基于肽与MHC的结合能力HLA-IBHLA-IISideviewpeptide肿瘤抗原肽被与MHC分Sideviewpeptideβ,M子呈递结合呈递给T细胞。能与MHC结合的分子被TopviewTopview认定为抗原肽a.chainPeptidebindinggrooveβchain
• 肿瘤抗原肽被与MHC分 子诶呈递结合呈递给T 细胞。 • 能与MHC结合的分子被 认定为抗原肽 肿瘤新抗原的预测是基于肽与MHC的结合能力