微生物的分类和鉴定 定义：按微生物的亲缘把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分 类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名
微生物的分类和鉴定 定义：按微生物的亲缘把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分 类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名
第一节 通用分类单元 ➢ 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species
第一节 通用分类单元 ➢ 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species
种的概念 ➢ 定义：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高 度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显 差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种 内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式 种。 ➢ 新种： sp.nov.或nov. sp.，新被鉴定的种发表时应在其 学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌 株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许 人们从中取得
种的概念 ➢ 定义：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高 度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显 差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种 内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式 种。 ➢ 新种： sp.nov.或nov. sp.，新被鉴定的种发表时应在其 学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌 株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许 人们从中取得
微生物的学名 ➢ 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细 菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 ➢ 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人和鲜 明定名年份 ➢ 规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以组合外 而成。种的加词代表一个种的次要特征，首字小写
微生物的学名 ➢ 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细 菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 ➢ 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人和鲜 明定名年份 ➢ 规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以组合外 而成。种的加词代表一个种的次要特征，首字小写
亚种以下的分类单元 ➢ 亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指其某一 民而稳定的特征与模式中不同的种常在种名、署名的 加词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词； ➢ 变种（ variety）：容易引起混乱； ➢ 型 form：使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现已 作废； ➢ 类群（group）：没有分类地位非正式地指定一组具有 某些共同性状的生物； ➢ 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁 殖而成的纯种群体极其一切后代；实际上是一个微生 物达到遗传性纯的标志。 ➢ 小种（race）：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵 义； ➢ 相（phase）：自然界存在的微生物交互变异的一定阶 段； ➢ 态（state）：通常指微生物的菌落变异状态
亚种以下的分类单元 ➢ 亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指其某一 民而稳定的特征与模式中不同的种常在种名、署名的 加词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词； ➢ 变种（ variety）：容易引起混乱； ➢ 型 form：使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现已 作废； ➢ 类群（group）：没有分类地位非正式地指定一组具有 某些共同性状的生物； ➢ 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁 殖而成的纯种群体极其一切后代；实际上是一个微生 物达到遗传性纯的标志。 ➢ 小种（race）：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵 义； ➢ 相（phase）：自然界存在的微生物交互变异的一定阶 段； ➢ 态（state）：通常指微生物的菌落变异状态
第二节 微生物在自然界的地位 ➢ 生物的界级分类学说：是在认识发展过程中存在的对 生物分类的不同阶段的不同观点。 ➢ 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六 界系统和三原界系统 ➢ 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出 的。 ➢所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路线， 就形成了三个原界：古细菌原界（Archaebacter）、 真细菌原界、真核生物原界 ➢提出了内共生学说，主要是Margulis的贡献
第二节 微生物在自然界的地位 ➢ 生物的界级分类学说：是在认识发展过程中存在的对 生物分类的不同阶段的不同观点。 ➢ 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六 界系统和三原界系统 ➢ 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出 的。 ➢所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路线， 就形成了三个原界：古细菌原界（Archaebacter）、 真细菌原界、真核生物原界 ➢提出了内共生学说，主要是Margulis的贡献
三原界系统示意图
三原界系统示意图
第三节 各大类微生物的分类系统纲要 ➢ 原核生物分类系统纲要——伯杰氏系统细菌学手册 ➢ 真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混 乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要
第三节 各大类微生物的分类系统纲要 ➢ 原核生物分类系统纲要——伯杰氏系统细菌学手册 ➢ 真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混 乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要
第四节 微生物的鉴定 ➢ 主要步骤：纯化、测定一系列必要的指标、查找权威 性鉴定手册 ➢ 鉴定技术的不同水平： ➢细胞的形态和习性：形态特征、运动、酶反应、营 养要求及生长条件等 ➢细胞组分水平：细胞壁成分、氨基酸库、脂类、醌 类、光合色素等的分析 ➢蛋白质水平：氨基酸序列分析、凝胶电泳和血清学 反应等 ➢基因或DNA水平：核酸分子杂交、（G+C）mol%、 转化和转导、16SrRNA寡核苷酸族分分析、DNA或 RNA核苷酸序列分析等
第四节 微生物的鉴定 ➢ 主要步骤：纯化、测定一系列必要的指标、查找权威 性鉴定手册 ➢ 鉴定技术的不同水平： ➢细胞的形态和习性：形态特征、运动、酶反应、营 养要求及生长条件等 ➢细胞组分水平：细胞壁成分、氨基酸库、脂类、醌 类、光合色素等的分析 ➢蛋白质水平：氨基酸序列分析、凝胶电泳和血清学 反应等 ➢基因或DNA水平：核酸分子杂交、（G+C）mol%、 转化和转导、16SrRNA寡核苷酸族分分析、DNA或 RNA核苷酸序列分析等
数值分类法 ➢ 即统计分类法，在200年前M. Adanson（1727~1806， 法国植物学家）发表的分类原理基础上结合现代计算 机技术发展而来的。 ➢ 主要观点： ➢在一个分类群中，其所含信息量越大，即分类所依 据的性状越多，其分类效果也越好； ➢顺序建立自然分类单元时，每个性状都是等权的； ➢任何两分类实体间的整体相似性，都是由每一对的 相似性计算而来的；能够由类群间相似性的差异识 别不同的分类实体； ➢如果给予有关进化途径和机制的某些假定，可以从 组群的分类学结构或从性状相关上作出种系发生的 推论； ➢分类学应作为一门经验科学来看待和实践； ➢数值分类学是以表象相似性为基础的
数值分类法 ➢ 即统计分类法，在200年前M. Adanson（1727~1806， 法国植物学家）发表的分类原理基础上结合现代计算 机技术发展而来的。 ➢ 主要观点： ➢在一个分类群中，其所含信息量越大，即分类所依 据的性状越多，其分类效果也越好； ➢顺序建立自然分类单元时，每个性状都是等权的； ➢任何两分类实体间的整体相似性，都是由每一对的 相似性计算而来的；能够由类群间相似性的差异识 别不同的分类实体； ➢如果给予有关进化途径和机制的某些假定，可以从 组群的分类学结构或从性状相关上作出种系发生的 推论； ➢分类学应作为一门经验科学来看待和实践； ➢数值分类学是以表象相似性为基础的