第十一讲生物测序技术概述 转录组测序
第十一讲 生物测序技术概述 转录组测序
转录本 All DNA DNA methy lation transcripts Pre-rRNA↓ Pre-mRNA rasi/shRNA snoRNA TRNAs Pre-miRNA snoRNP subunits Nuclear Nucleus membrane mIRNA miRNP All mRNAS mRNAS Inhibition of Noncoding RNA protein sy nthesis (one class) Eh som EA? RISC SiRNA o mRNA degradation
转录本 All transcripts All mRNAs
、转录组测序简介
一、转录组测序简介
转录组 o转录组概念由 Velculescu等在1995年首次提出 o转录组:广义上指一个细胞内基因组DNA转录得到的 所有转录产物以及转录物在细胞特定发育时期或特定 生理条件下的表达水平,包括编码RNA(mRNA)和非 编码RNA(如tRNA、rRNA、 SnRNA、 mirnas等),狭义 上指所有mRNA的集合。 o转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点 ,是解读基因组功能原件和揭示细胞及组织分子组 成所必需的
转录组 转录组概念由Velculescu等在1995年首次提出。 转录组：广义上指一个细胞内基因组DNA转录得到的 所有转录产物以及转录物在细胞特定发育时期或特定 生理条件下的表达水平，包括编码RNA（mRNA）和非 编码RNA（如tRNA、rRNA、snRNA、miRNA等），狭义 上指所有mRNA的集合。 转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点 ，是解读基因组功能原件和揭示细胞及组织分子组 成所必需的
什么是转录组测序 RNA测序又称转录组测序,就是把 mRNA, smalIRNAA non-coding RNA ( ncRNA)全部或者其中一些用高通量 测序技术进行测序分析的技术
什么是转录组测序 RNA测序又称转录组测序，就是把 mRNA，smallRNA和 non-coding RNA （ncRNA）全部或者其中一些用高通量 测序技术进行测序分析的技术
什么是转录组测序 o RNA_ Seq的重要分支 RNA-Seq是指针对转录产物RNA的测序技术,主要有以下分支 转录组分析 1 表达谱分析 DNA 0小RNA分析 ATGCTAG GG o降解组测序 UACGA U mRNA 针对mRNA的测序 转录组测序是针对特定样品特定时期的转录mRNA的测序技术, 重点在对翻译蛋白的mRNA的测序研究
什么是转录组测序 RNA_Seq的重要分支 RNA_Seq是指针对转录产物RNA的测序技术，主要有以下分支： 转录组分析 表达谱分析 小RNA分析 降解组测序 针对mRNA的测序 转录组测序是针对特定样品特定时期的转录mRNA的测序技术， 重点在对翻译蛋白的mRNA的测序研究
Enhancers Promoter DNA-Seq DNA Transcription pre-mRNA EXon Exon Exon Exon Exon Splicing RNA-seq Open reading mRNA 5′UTR frame 3 UTR Translatio rotein The Central dogma of molecular Biology The genome is only a source of information. In order to function, it must be expressed. The transcription of genes to produce rNa is the first stage of gene expression. The transcriptome is the complete set of rna transcripts produced by the genome at any one time
The Central Dogma of Molecular Biology • The genome is only a source of information. In order to function, it must be expressed. The transcription of genes to produce RNA is the first stage of gene expression . The transcriptome is the complete set of RNA transcripts produced by the genome at any one time. DNA-seq RNA-seq 7
转录组测序兴起的背景 o生物信息学的大发展 自从人类基因组测序完成,宣布后基因组时代的研究到 来,基于测序的生物信息学发展空前爆发
转录组测序兴起的背景 生物信息学的大发展 自从人类基因组测序完成，宣布后基因组时代的研究到 来，基于测序的生物信息学发展空前爆发
转录组测序的特点 应用对象灵活广泛 针对不同物种,不同个体,不同时期,都可以在mRNA水平 准确的分析性状或功能差异,结构变异等信息 ◎研究范围多样化 从未知基因组物种,到研究成熟的人体病变组织,小鼠组织 等特异组织,均可通过转录组分析进行研究。 ◎研究深度多样化 从大规模功能转录本发掘到特定基因的可变剪接的不同功能 分析,都可以定位研究
转录组测序的特点 应用对象灵活广泛 针对不同物种，不同个体，不同时期，都可以在mRNA水平 准确的分析性状或功能差异，结构变异等信息。 研究范围多样化 从未知基因组物种，到研究成熟的人体病变组织，小鼠组织 等特异组织，均可通过转录组分析进行研究。 研究深度多样化 从大规模功能转录本发掘到特定基因的可变剪接的不同功能 分析，都可以定位研究
基因注释和注释库简
二、基因注释和注释库简介