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安徽医科大学:《生殖医学基础与临床》课程教学资源(电子教案)生殖医学相关的分子生物技术

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教案首页 第1次课 授课时间2016.11 教案完成时间:2016.11 课程名称 生殖医学相关的 分子生物技术 年级 2016 专业、层次 研究生 助理 授课教师 刘雅静 专业技术 授课方式 职务 研究员 (大、小班) 小班 学时 2 第1章、生殖医学相关的分子生物技术 授课题目(章,节) 第一节、转染技术 第二节、RNA干扰技术 基本教材或主要参考书 1. 《医学分子生物学技术》(第3版)药立波主编 2. 《医学分子生物学》武军驻主编 教学目的与要求: 1、 熟练掌握转染技术的基本概念以及几种转染方式的优缺点。 2、 掌握影响细胞转染效率的各种因素。 3、 熟练掌握RNA干扰技术的概念

教案首页 第 1 次课 授课时间 2016.11 教案完成时间:2016.11 课程名称 生殖医学相关的 分子生物技术 年 级 2016 专业、层次 研究生 授课教师 刘雅静 专业技术 职务 助理 研究员 授课方式 (大、小班) 小班 学时 2 授课题目(章,节) 第 1 章、生殖医学相关的分子生物技术 第一节、转染技术 第二节、RNA 干扰技术 基本教材或主要参考书 1. 《医学分子生物学技术》 (第 3 版) 药立波 主编 2. 《医学分子生物学》 武军驻 主编 教学目的与要求: 1、 熟练掌握转染技术的基本概念以及几种转染方式的优缺点。 2、 掌握影响细胞转染效率的各种因素。 3、 熟练掌握 RNA 干扰技术的概念

(教案续页) 辅助手段和 基本内容 时间分配 概述 分子生物学是一门从分子水平研究生命现象、生命的本质、生命活动及其规律 的科学。 第一节、转染技术 (一)医学分子生物学的基本概念 医学分子生物学是分子生物学的一个重要分支,是从分子水平研究人体在 正常和疾病状态下生命活动及其规律的一门科学。 医学分子生物学主要研究人体生物大分子(基因,蛋白质)和大分子体系 的结构、功能、相互作用及其同疾病发生、发展的关系。 与生殖相关的分子生物学技术主要包括转染技术、PCR技术、RNA干扰技 术、DNA序列分析技术、Souther印迹技术、Northem印迹技术、Westem印 迹技术、免疫组织化学技术等。 (二)转染技术的基本概念 转染技术是指将外源分子如DNA,RNA等导入真核细胞的技术,它是研究 基因表达调控,突变分析等的常规工具。 转染途径主要包括以下几种: 冬物理介导:电穿孔法、显微注射、基因枪 冬化学介导:磷酸钙共沉淀法、脂质体转染方法 冬生物介导:原生质体转染、病毒介导的转染 (三)各种转染方法的原理与特点 1、电穿孔法 电穿孔靠脉冲电流在细胞膜上打孔而将核酸导入细胞内。 本法需用特殊仪器(电穿孔仪),把悬浮状态的受体细胞和供体DNA共同放入皿 中,再施以高压电脉冲,能够促进DNA通过细胞膜而进入细胞内, 并可整合到细胞的DNA中,使细胞发生转化。 优点:转染效率较高 冬缺点: >需要昂贵的仪器(电穿孔仪)。 >对细胞的损伤较大,每次转染需要更多的细胞和DNA。 每种细胞电转的条件都需要进行多次优化

(教案续页) 基 本 内 容 辅助手段和 时间分配 概述 分子生物学是一门从分子水平研究生命现象、生命的本质、生命活动及其规律 的科学。 第一节、转染技术 (一) 医学分子生物学的基本概念 医学分子生物学是分子生物学的一个重要分支,是从分子水平研究人体在 正常和疾病状态下生命活动及其规律的一门科学。 医学分子生物学主要研究人体生物大分子(基因,蛋白质)和大分子体系 的结构、功能、相互作用及其同疾病发生、发展的关系。 与生殖相关的分子生物学技术主要包括转染技术、PCR 技术、RNA 干扰技 术、DNA 序列分析技术、Souther 印迹技术、Northern 印迹技术、Western 印 迹技术、免疫组织化学技术等。 (二) 转染技术的基本概念 转染技术是指将外源分子如 DNA,RNA 等导入真核细胞的技术,它是研究 基因表达调控,突变分析等的常规工具。 转染途径主要包括以下几种: ❖ 物理介导:电穿孔法、显微注射、基因枪 ❖ 化学介导:磷酸钙共沉淀法、脂质体转染方法 ❖ 生物介导:原生质体转染 、病毒介导的转染 (三) 各种转染方法的原理与特点 1、 电穿孔法 电穿孔靠脉冲电流在细胞膜上打孔而将核酸导入细胞内。 本法需用特殊仪器(电穿孔仪),把悬浮状态的受体细胞和供体 DNA 共同放入皿 中,再施以高压电脉冲,能够促进 DNA 通过细胞膜而进入细胞内, 并可整合到细胞的 DNA 中,使细胞发生转化。 ❖ 优点:转染效率较高 ❖ 缺点: ➢ 需要昂贵的仪器 (电穿孔仪)。 ➢ 对细胞的损伤较大,每次转染需要更多的细胞和 DNA。 ➢ 每种细胞电转的条件都需要进行多次优化

2、显微注射 优点:转染效率较高,可用于稳定转染和瞬时转染。 ÷缺点:在导入DNA时需要一个细胞一个细胞地注射,不适合大量转染细 胞研究的需要。 3、磷酸钙共沉淀法 原理:磷酸钙被认为有利于促进外源DNA与靶细胞表面的结合。氯化钙+DNA+ 磷酸缓冲液按一定的比例混和,形成极小的磷酸钙-DNA复合物沉淀黏附在细 胞膜表面,借助内吞作用进入细胞质。 优点:能用于任何DNA导入哺乳类动物,瞬时转染和稳定转染都可以。 缺点: 1)转染效率低:进入细胞的DNA只有1%一5%可以进入细胞核,其中只有 不到1%的DNA可以与细胞DNA整合,在细胞中进行稳定表达。 2)重复性不佳:pH值、钙离子浓度、DNA浓度、沉淀反应时间、细胞孵育 时间乃至各组分加入顺序和混合的方式都可能对结果产生影响。 4、脂质体介导的转染 原理:中性脂质体是利用脂质膜包裹DNA,借助脂质膜将DNA导入细胞膜内。 带正电的阳离子脂质体则不同,DNA并没有预先包埋在脂质体中,而是带负电 的DNA自动结合到带正电的脂质体上,形成DNA-阳离子脂质体复合物,从而 吸附到带负电的细胞膜表面,经过内吞被导入细胞。 特点: ◆适用于把DNA转染入悬浮或贴壁培养细胞,可用于瞬时转染和稳定转染。 ◆转染效率高,比磷酸钙法高5-100倍。 ◆能够把DNA和RNA转染到各种细胞。 ◆转染的稳定性好,可重复性高。 5、病毒介导的转染 冬优点:整和效率高,可使外源基因在宿主细胞中长期表达。 冬缺点:存在潜在的安全危险性。 (四)影响细胞转染效率的主要因素 1、细胞培养物 健康的细胞培养物是成功转染的基础。 不同细胞有不同的培养基,血清和添加物。 高的转染效率需要一定的细胞密度。一般推荐在转染前24小时将细胞传代, 这样可提供正常细胞代谢,增加对外源DNA摄入的可能。 2、血清 ◆血清质量的变化直接影响转染效率。 ◆脂质体转染在有血清存在情况下效率较低,因为血清会影响复合物的形成。 有些对血清敏感的细胞如原代细胞会受到损伤,甚至死亡,导致转染效率 极低

2、显微注射 ❖ 优点:转染效率较高,可用于稳定转染和瞬时转染。 ❖ 缺点:在导入 DNA 时需要一个细胞一个细胞地注射,不适合大量转染细 胞研究的需要。 3、磷酸钙共沉淀法 原理:磷酸钙被认为有利于促进外源 DNA 与靶细胞表面的结合。氯化钙+DNA+ 磷酸缓冲液按一定的比例混和,形成极小的磷酸钙-DNA 复合物沉淀黏附在细 胞膜表面,借助内吞作用进入细胞质。 优点:能用于任何 DNA 导入哺乳类动物,瞬时转染和稳定转染都可以。 缺点: 1)转染效率低:进入细胞的 DNA 只有1%-5%可以进入细胞核,其中只有 不到1%的 DNA 可以与细胞 DNA 整合,在细胞中进行稳定表达。 2)重复性不佳: pH 值、钙离子浓度、DNA 浓度、沉淀反应时间、细胞孵育 时间乃至各组分加入顺序和混合的方式都可能对结果产生影响。 4、脂质体介导的转染 原理:中性脂质体是利用脂质膜包裹 DNA,借助脂质膜将 DNA 导入细胞膜内。 带正电的阳离子脂质体则不同,DNA 并没有预先包埋在脂质体中,而是带负电 的 DNA 自动结合到带正电的脂质体上,形成 DNA-阳离子脂质体复合物,从而 吸附到带负电的细胞膜表面,经过内吞被导入细胞。 特点: ◆ 适用于把DNA转染入悬浮或贴壁培养细胞,可用于瞬时转染和稳定转染。 ◆ 转染效率高,比磷酸钙法高 5-100 倍。 ◆ 能够把DNA和RNA转染到各种细胞。 ◆ 转染的稳定性好,可重复性高。 5、病毒介导的转染 ❖ 优点:整和效率高, 可使外源基因在宿主细胞中长期表达。 ❖ 缺点:存在潜在的安全危险性。 (四) 影响细胞转染效率的主要因素 1、细胞培养物 ➢ 健康的细胞培养物是成功转染的基础。 ➢ 不同细胞有不同的培养基,血清和添加物。 ➢ 高的转染效率需要一定的细胞密度。一般推荐在转染前24 小时将细胞传代, 这样可提供正常细胞代谢,增加对外源 DNA 摄入的可能。 2、血清 ◆ 血清质量的变化直接影响转染效率。 ◆ 脂质体转染在有血清存在情况下效率较低,因为血清会影响复合物的形成。 ◆ 有些对血清敏感的细胞如原代细胞会受到损伤,甚至死亡,导致转染效率 极低

(教案续页) 辅助手段和 基本内容 时间分配 3、载体构建 ÷转染载体的构建(病毒载体,质粒DNA、RNA、PCR产物、寡核苷酸 等)也影响转染结果。 冬同时做空载体对照可排除毒性影响的干扰。 4、DNA质量 ÷DNA质量对转染效率影响非常大(0D260/OD280)。 冬一般的转染技术(如脂质体等)基于电荷吸引原理,如果DM不纯, 带少量的盐离子、蛋白、代谢物污染都会显著影响转染复合物的有 效形成及转染的进行。 5、转染技术 转染技术的选择对转染结果影响也很大,许多转染方法需要优化DA与转染 试剂比例,细胞数量,培养及检测时间等。 (五)细胞转染注意事项 1、如为贴壁生长的细胞,最好在转染前一日接种细胞,转染当日的细胞密度 以70-90%(贴壁细胞)或2×106一4×10细胞/m1(悬浮细胞)为 宜,最好在转染前4小时换一次新鲜培养液。 2、用于转染的质粒DNM必须无蛋白质,无RNA和其它化学物质的污染, 0D260/280比值应在1.8左右。(若>1.9,表明有NA污染;若<1.6,表明有蛋 白质、酚等污染)。 3、在开始准备DNA和阳离子脂质体试剂稀释液时要使用无血清的培养基,因 为血清会影响复合物的形成。 4、阳离子脂质体和DNA的最佳量在使用血清时会有所不同,因此如果你想在 转染培养基中加入血清需要对条件进行优化。 5、抗生素,比如青霉素和链霉素,是影响转染的培养基添加物。这些抗生素 一般对于真核细胞无毒,但阳离子脂质体试剂增加了细胞的通透性,使抗生素 可以进入细胞。这降低了细胞的活性,导致转染效率降低。所以,在转染培养 基中不能使用抗生素。 6、一般在转染后24-48小时,靶基因即在细胞内表达。根据不同的实验目的, 24-48小时后即可进行靶基因表达的检测等实验

(教案续页) 基 本 内 容 辅助手段和 时间分配 3、载体构建 ❖ 转染载体的构建(病毒载体,质粒 DNA、RNA、PCR 产物、寡核苷酸 等)也影响转染结果。 ❖ 同时做空载体对照可排除毒性影响的干扰。 4、DNA 质量 ❖ DNA 质量对转染效率影响非常大(OD260/OD280)。 ❖ 一般的转染技术(如脂质体等)基于电荷吸引原理,如果 DNA 不纯, 带少量的盐离子、蛋白、代谢物污染都会显著影响转染复合物的有 效形成及转染的进行。 5、转染技术 转染技术的选择对转染结果影响也很大,许多转染方法需要优化 DNA 与转染 试剂比例,细胞数量,培养及检测时间等。 (五)细胞转染注意事项 1、如为贴壁生长的细胞,最好在转染前一日接种细胞,转染当日的细胞密度 以 70-90%(贴壁细胞)或2×106-4×106细胞/ml(悬浮细胞 )为 宜,最好在转染前 4 小时换一次新鲜培养液。 2、用于转染的质粒 DNA 必须无蛋白质,无 RNA 和其它化学物质的污染, OD260/280 比值应在 1.8 左右。(若>1.9,表明有 RNA 污染; 若<1.6,表明有蛋 白质、酚等污染)。 3、在开始准备 DNA 和阳离子脂质体试剂稀释液时要使用无血清的培养基,因 为血清会影响复合物的形成。 4、阳离子脂质体和 DNA 的最佳量在使用血清时会有所不同,因此如果你想在 转染培养基中加入血清需要对条件进行优化。 5、抗生素,比如青霉素和链霉素,是影响转染的培养基添加物。这些抗生素 一般对于真核细胞无毒,但阳离子脂质体试剂增加了细胞的通透性,使抗生素 可以进入细胞。这降低了细胞的活性,导致转染效率降低。所以,在转染培养 基中不能使用抗生素。 6、一般在转染后 24-48 小时,靶基因即在细胞内表达。根据不同的实验目的, 24-48 小时后即可进行靶基因表达的检测等实验

(教案续页) 辅助手段和时 基本内容 间分配 第二节、RNA干扰技术 (一)RNA干扰的概念 RNA干扰(RNA interference,简称RNAi):是正常生物体内抑制特定基因表达 的一种现象,它是指当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNAs时, 该mRWA发生降解而导致基因表达沉默的现象,它发生在转录后水平,又称为转 录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing,PTGS)。 (二)RNA干扰的机制 dsRNA被特异的核酸酶降解,产生干扰小RNA(siRNA),这些siRN A与同源的靶NA互补结合,特异性酶降解靶RNA,从而抑制、下调相应基因的 表达。 (三)RNA干扰的应用 RNAi主要通过在转录后(post-transcriptional)水平阻断基因的表达, 导致蛋白无法合成,出现“基因沉默”。 冬比如,我们可以按拟定的方式来关闭(shutting off)非必需或致病基因的 功能。从理论上说,若能关闭致病基因的表达则很多疾病将被治愈。 RNAi临床治疗的前景有赖于疾病的发生发展与特定基因的关系研究。 课后小结及课堂讨论等师生互动环节: 课后小结: 1.医学分子生物学主要研究人体生物大分子(基因,蛋白质)和大分子体系的 结构、功能、相互作用及其同疾病发生、发展的关系。 2.与生殖相关的分子生物学技术主要包括转染技术、PCR技术、RNA千扰技术、 DNA序列分析技术、Souther印迹技术、Northern印迹技术、Western印迹技 术、免疫组织化学技术等。 课堂讨论: 1.与生殖相关的分子生物学技术主要包括哪些? 2.影响细胞转染效率的主要因素是什么?

(教案续页) 基 本 内 容 辅助手段和时 间分配 第二节、RNA 干扰技术 (一)RNA 干扰的概念 RNA 干扰(RNA interference ,简称 RNAi):是正常生物体内抑制特定基因表达 的一种现象,它是指当细胞中导入与内源性 mRNA 编码区同源的双链 RNAs 时, 该 mRNA 发生降解而导致基因表达沉默的现象,它发生在转录后水平,又称为转 录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS)。 (二)RNA 干扰的机制 dsRNA 被特异的核酸酶降解,产生干扰小RNA(siRNA),这些siRN A与同源的靶 RNA 互补结合, 特异性酶降解靶 RNA,从而抑制、下调相应基因的 表达。 (三)RNA 干扰的应用 ❖ RNAi 主要通过在转录后(post-transcriptional)水平阻断基因的表达, 导致蛋白无法合成,出现“基因沉默”。 ❖ 比如,我们可以按拟定的方式来关闭(shutting off)非必需或致病基因的 功能。从理论上说,若能关闭致病基因的表达则很多疾病将被治愈。 ❖ RNAi 临床治疗的前景有赖于疾病的发生发展与特定基因的关系研究。 课后小结及课堂讨论等师生互动环节: 课后小结: 1. 医学分子生物学主要研究人体生物大分子(基因,蛋白质)和大分子体系的 结构、功能、相互作用及其同疾病发生、发展的关系。 2. 与生殖相关的分子生物学技术主要包括转染技术、PCR 技术、RNA 干扰技术、 DNA 序列分析技术、Souther 印迹技术、Northern 印迹技术、Western 印迹技 术、免疫组织化学技术等。 课堂讨论: 1. 与生殖相关的分子生物学技术主要包括哪些? 2. 影响细胞转染效率的主要因素是什么?

(教案末页) 通过这两节的学习,应熟练掌握转染技术的基本概念以 及几种转染方式的优缺点:熟练掌握影响细胞转染效率的各 总结 种因素和细胞转染注意事项;了解NA干扰技术的概念: 了解RNA干扰技术的机制:了解RNA干扰技术的应用。 这两节的学习为以后科研课题的顺利开展奠定了基础。 1.与生殖相关的分子生物学技术主要包括哪些? 2.影响细胞转染效率的主要因素是什么? 复习思考题 3.细胞转染过程中有哪些注意事项? 4.RNA干扰技术的概念? 教学内容充实,逻辑结构安排合理。教学深度适中,时间安 实施情况及分析 排合理,理论和临床结合恰当

(教案末页) 总结 通过这两节的学习,应熟练掌握转染技术的基本概念以 及几种转染方式的优缺点;熟练掌握影响细胞转染效率的各 种因素和细胞转染注意事项;了解 RNA 干扰技术的概念; 了解 RNA 干扰技术的机制;了解 RNA 干扰技术的应用。 这两节的学习为以后科研课题的顺利开展奠定了基础。 复习思考题 1. 与生殖相关的分子生物学技术主要包括哪些? 2. 影响细胞转染效率的主要因素是什么? 3. 细胞转染过程中有哪些注意事项? 4. RNA 干扰技术的概念? 实施情况及分析 教学内容充实,逻辑结构安排合理。教学深度适中,时间安 排合理,理论和临床结合恰当

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