实验25 重组质粒
目的 1.放大某一基因片段,用于探针、基因功能检测、报 道基因研究等。方法是:把某一DNA片段插入到相应的载 体(比如质粒、噬菌体、哺乳类细胞表达载体等),给予扩 增,用以标记探针、测序、cDNA库建立、基因功能检测等 多种分子生物学实验。因此重组质粒就成为中医药实验研 究中最为常规的实验。 通常,扩增目的DNA主要借助两类方法,即PCR技术 和载体重组技术,鉴于PC技术受到酶的性能和方法学等 多方面的限制,某些DNA和超过一定长度DNA的扩增会有 困难,所以载体重组技术倍受青睐
2.DDPCR产物的克隆和测序。 3.RACE PCR产物的克隆和测序。 4.构建基因库、cDNA库,等。 5.纯化基因片段 关于载体一 质粒 质粒是一类双链、闭环的DNA分子,存在于细菌体 中,独立于细菌染色体之外进行复制和遗传的辅助性遗 传单位。通过改造,实验室常用质粒被赋予了以下几种 特性:
1.含有多克隆位点区域,可方便地插入目的DNA片 段。 2.对细菌的可转移性,即在实验中,可将质粒诱导 入细菌。 3.选择标记。常用的有抗生素抗性基因。这样,一 旦质粒进入细菌,便可使该细菌对相应的抗生素产生抵 抗能力,在含这一抗生素的琼脂平板上传代。 4.在细菌体内可获得较高的拷贝数,例如一种叫pUC 的质粒,在单一细菌体中的拷贝数可达500-700个。因 此,质粒已成为分子生物学中使用最为广泛的载体。 本实验所用的质粒是pUC19,全长2686个碱基对 (bp),在质粒的10-110bp段为多克隆位点区域,含有 PstI、EcoR I、KpnI、SmaI、Hind I11、BamH I、Sac !等多种限制性内切酶的位点
EC001092674PHo46 BstAPI 179 Aatll 2617 Ndel 183 Sspl 2501 Ehel 235 Pdml 2294 Bcgl 2215 2486 146/ 236 MCS Scal 2177 lacZ 469. pUC18/19 BsaXI 659 Sapl 683 2686bp 852. Aflll,Pscl 806 Gsul 1784 1626 Cfr10l1779 1466 Ec03111766 Eam11051694, ep (pMB1) BseYl 1110 Cail 1217
pON-1MC5 reading frame1非· 常用载体 ens话amre时 面A工安g4因底单心A44 1、质粒 p0NB2 MCS (reading有am82头” PDNR-1.23 面山比(宜A或ET匹C立.电妙G1A5A 2、λ噬菌体 DN情-3 MCS irading frame3款· 3、哺乳动物 4些元5A上AA政的4AT点GAA 可 细胞载体 B-Galactosidase. 4、酵母载体 0 pug a 950 ImW ss'sIn 的sg83始总8 5、穿梭载体 8 房三关 cd857(nin月 FiGURE 2 Map of the Uni-ZAD XR insertion vector
常 用 载 体 1、质粒 2、λ噬菌体 3、哺乳动物 细胞载体 4、酵母载体 5、穿梭载体
半乳糖苷酶的蓝/白斑 筛选系统 Unpurified PCR product Ligate into pT-Adv 在质粒中含有LacZ基因的 a-肽的序列,当无外源DNA片段 插入时,质粒表达α-肽,它与 Col El 宿主菌的Lac ZM15基因的产物互 pT-Adv on 补,产生有活性的B-半乳糖苷 3.9kb Kan 酶,在含有指示剂X-ga|和诱导 剂IPTG存在的情况下,菌落呈蓝 Transform TOP10F cells plate on 色(质粒自身环化);外源基因 LB/X-gal/PTG with amp or kan 插入后,肽基因阅读框架被破坏 细菌内无半乳糖苷酶活性存在 菌落呈白色(阳性克隆)
半乳糖苷酶的蓝/白斑 筛选系统 在质粒中含有LacZ基因的 α-肽的序列,当无外源DNA片段 插入时,质粒表达α-肽,它与 宿主菌的Lac ZM15基因的产物互 补,产生有活性的β-半乳糖苷 酶,在含有指示剂X-gal和诱导 剂IPTG存在的情况下,菌落呈蓝 色(质粒自身环化);外源基因 插入后,肽基因阅读框架被破坏 ,细菌内无半乳糖苷酶活性存在 ,菌落呈白色(阳性克隆)
原 理 采用由Hind I1I切割开的pUC19质粒,以及由Hind III切割PCR片段,用T4噬菌体DNA连接酶将PCR片段 与切割开质粒DNA片段重新连接成一个环状的DNA分子, 即把目的基因DNA插入质粒DNA,实现质粒重组
三种不同的酶切方式 EcoR I ↓ 5'..GAATTC..3'→ 5'..G AATTC...3' 3'...CTTAAG...5' 3.. CTTAA G...5 Pst I ↓ 5'..CTGCAG...3'→ 5'...CTGCA G..3 3'...GACGTC...5' 3..G ACGTC...5' Sma I ↓ 5'...CCCGGG...3'→ 5'...CC0 GGG...3' 3'...GGGCCC..5' 3'...GGG CCC..5
实准备 (参考教材)