1 第十一章 基因表达与调控 浙江大学 遗传学第十一章 2 * 1.基因概念及其发展。 2.原核生物基因调控:操纵元模型。 3.真核生物基因调控: 复制、转录和翻译三个水平。 本章重点 第一节 基因的概念 浙江大学 遗传学第十一章 4 ㈠、经典遗传学关于基因的概念: 一、基因的概念及其发展: ①.孟德尔: 把控制性状的因子称为遗传因子。 如:豌豆红花(C)、白花(c)、植株高(H)、矮(h)。 ②.约翰生: 提出基因(gene) 取代遗传因子。 ③.摩尔根: 对果蝇、玉米等的大量遗传研究,建立了以基因和 染色体为主体的经典遗传学。 基因是化学实体,以念珠状直线排列在染色体上。 浙江大学 遗传学第十一章 5 基因共性(按照经典遗传学关于基因的概念): ♣ 基因具有染色体的主要特性:自我复制和相对稳定性, 在分裂时有规律地进行分配。 ♣ 交换单位:基因间能进重组,而且是交换的最小单位。 ♣ 突变单位:一个基因能突变为另一个基因。 ♣ 功能单位:控制有机体的性状。 ∴ 经典遗传学认为:基因是一个最小的单位,不能分割; 既是结构单位,又是功能单位。 浙江大学 遗传学第十一章 6 ⑴.揭示遗传密码的秘密:基因 Î 具体物质。 一个基因 Î DNA分子上一定区段,携带有特殊遗传 信息 Î 转录成RNA Î 翻译成多肽链,或对其它基因的 活动起调控作用 ( 如调节基因、启动基因、操纵基因)。 ⑵.基因不是最小遗传单位 Î 更复杂的遗传和变异单位: 例如:在一个基因区域内,仍可以划分出若干起作用 的小单位。 ㈡、分子遗传学关于基因的概念:
1 第十一章 基因表达与调控 浙江大学 遗传学第十一章 2 * 1.基因概念及其发展。 2.原核生物基因调控:操纵元模型。 3.真核生物基因调控: 复制、转录和翻译三个水平。 本章重点 第一节 基因的概念 浙江大学 遗传学第十一章 4 ㈠、经典遗传学关于基因的概念: 一、基因的概念及其发展: ①.孟德尔: 把控制性状的因子称为遗传因子。 如:豌豆红花(C)、白花(c)、植株高(H)、矮(h)。 ②.约翰生: 提出基因(gene) 取代遗传因子。 ③.摩尔根: 对果蝇、玉米等的大量遗传研究,建立了以基因和 染色体为主体的经典遗传学。 基因是化学实体,以念珠状直线排列在染色体上。 浙江大学 遗传学第十一章 5 基因共性(按照经典遗传学关于基因的概念): ♣ 基因具有染色体的主要特性:自我复制和相对稳定性, 在分裂时有规律地进行分配。 ♣ 交换单位:基因间能进重组,而且是交换的最小单位。 ♣ 突变单位:一个基因能突变为另一个基因。 ♣ 功能单位:控制有机体的性状。 ∴ 经典遗传学认为:基因是一个最小的单位,不能分割; 既是结构单位,又是功能单位。 浙江大学 遗传学第十一章 6 ⑴.揭示遗传密码的秘密:基因 Î 具体物质。 一个基因 Î DNA分子上一定区段,携带有特殊遗传 信息 Î 转录成RNA Î 翻译成多肽链,或对其它基因的 活动起调控作用 ( 如调节基因、启动基因、操纵基因)。 ⑵.基因不是最小遗传单位 Î 更复杂的遗传和变异单位: 例如:在一个基因区域内,仍可以划分出若干起作用 的小单位。 ㈡、分子遗传学关于基因的概念:
2 浙江大学 遗传学第十一章 7 ⑶. 现代遗传学上认为: ①.突变子(muton):性状突变时产生突变的最小单位。 一个突变子可以小到只有一个碱基对;如移码突变。 ②.重组子(recon):性状重组时,可交换的最小单位。 一个交换子可以只包含一个碱基对。 ③.顺反子(cistron):表示一个作用的单位,基本符合 通常所述基因的大小或略小。所包括的一段 DNA与 一个多肽链合成相对应;平均为500~1500个碱基对。 浙江大学 遗传学第十一章 8 ⑷.基因概念: ①.可转录一条完整的RNA分子或编码一个多肽链; ②.功能上被顺反测验或互补测验所规定。分子遗传学 保留功能单位的解释,而抛弃最小结构单位说法。 基因:相当于一个顺反子, 包含许多突变子和 重组子。 紫外灯下的DNA 浙江大学 遗传学第十一章 9 ⑴.结构基因(structural gene): 指可编码RNA或蛋白质的一段DNA序列。 ㈢、分子遗传学对基因概念的新发展: rRNA基因 浙江大学 遗传学第十一章 10 ⑵.调控基因(regulator gene): 指其表达产物参与调控其它基因表达的基因。 lac 调控基因 浙江大学 遗传学第十一章 11 ⑶.重叠基因(overlapping gene): 指在同一段DNA顺序上,由于阅读框架不同或终止 早晚不同,同时编码两个以上基因的现象。 A BC D E F extron ⑷.隔裂基因(split gene): 指基因内部被一个或更多不翻译的编码顺序即内含子所 隔裂。 内含子(intron):DNA序列中不出现在成熟mRNA的片段; 外显子(extron):DNA序列中出现在成熟mRNA中的片段。 卵清蛋 白基因
2 浙江大学 遗传学第十一章 7 ⑶. 现代遗传学上认为: ①.突变子(muton):性状突变时产生突变的最小单位。 一个突变子可以小到只有一个碱基对;如移码突变。 ②.重组子(recon):性状重组时,可交换的最小单位。 一个交换子可以只包含一个碱基对。 ③.顺反子(cistron):表示一个作用的单位,基本符合 通常所述基因的大小或略小。所包括的一段 DNA与 一个多肽链合成相对应;平均为500~1500个碱基对。 浙江大学 遗传学第十一章 8 ⑷.基因概念: ①.可转录一条完整的RNA分子或编码一个多肽链; ②.功能上被顺反测验或互补测验所规定。分子遗传学 保留功能单位的解释,而抛弃最小结构单位说法。 基因:相当于一个顺反子, 包含许多突变子和 重组子。 紫外灯下的DNA 浙江大学 遗传学第十一章 9 ⑴.结构基因(structural gene): 指可编码RNA或蛋白质的一段DNA序列。 ㈢、分子遗传学对基因概念的新发展: rRNA基因 浙江大学 遗传学第十一章 10 ⑵.调控基因(regulator gene): 指其表达产物参与调控其它基因表达的基因。 lac 调控基因 浙江大学 遗传学第十一章 11 ⑶.重叠基因(overlapping gene): 指在同一段DNA顺序上,由于阅读框架不同或终止 早晚不同,同时编码两个以上基因的现象。 A BC D E F extron ⑷.隔裂基因(split gene): 指基因内部被一个或更多不翻译的编码顺序即内含子所 隔裂。 内含子(intron):DNA序列中不出现在成熟mRNA的片段; 外显子(extron):DNA序列中出现在成熟mRNA中的片段。 卵清蛋 白基因
3 浙江大学 遗传学第十一章 13 ⑸.跳跃基因(jumping gene): 即转座因子,指染色体组上可以转移的基因。 实质:能够转移位置的DNA片断。 功能:在同一染色体内或不同染色体之间移动 Î 引起 插入突变、DNA结构变异(如重复、缺失、畸变)Î 通过 表现型变异得到鉴别。 遗传工程:转座子标签法。 玉米转座子现象 玉米转座子系统 Ac转座酶活性没有被激活,无转座发生 Ac转座酶活性被激活,转座发生Ä性状发生改变 浙江大学 遗传学第十一章 15 * 金鱼草转座子系统: 金鱼草中最少含有四种转座子(Tam),含有12或13bp的 插入重复顺序。其中Tam1、Tam2和Tam3转座子分别为15kb、 5kb和3.6kb长度。 Tam转座子¨用于控制花的生物合成基因研究。 ∵突变结果很容易通过表现型变异加以鉴定。 浙江大学 遗传学第十一章 16 ⑹. 假基因(pseudogene): 同已知的基因相似,处于不同的位点,因缺失或突变 而不能转录或翻译,是没有功能的基因。 真核生物中的血红素蛋白基因 家族中就存在假基因现象。 血红蛋白分子 的四条多肽链 浙江大学 遗传学第十一章 17 二、基因的微细结构: 浙江大学 遗传学第十一章 18 设有两个独立起源的隐性突变,具有类似的表现型。 判断是属于同一个基因突变,还是属于两个基因突变? 即判断是否属于等位基因? ①.建立双突变杂合二倍体; ②.测定突变间有无互补作用。 ㈠、互补作用:
3 浙江大学 遗传学第十一章 13 ⑸.跳跃基因(jumping gene): 即转座因子,指染色体组上可以转移的基因。 实质:能够转移位置的DNA片断。 功能:在同一染色体内或不同染色体之间移动 Î 引起 插入突变、DNA结构变异(如重复、缺失、畸变)Î 通过 表现型变异得到鉴别。 遗传工程:转座子标签法。 玉米转座子现象 玉米转座子系统 Ac转座酶活性没有被激活,无转座发生 Ac转座酶活性被激活,转座发生Ä性状发生改变 浙江大学 遗传学第十一章 15 * 金鱼草转座子系统: 金鱼草中最少含有四种转座子(Tam),含有12或13bp的 插入重复顺序。其中Tam1、Tam2和Tam3转座子分别为15kb、 5kb和3.6kb长度。 Tam转座子¨用于控制花的生物合成基因研究。 ∵突变结果很容易通过表现型变异加以鉴定。 浙江大学 遗传学第十一章 16 ⑹. 假基因(pseudogene): 同已知的基因相似,处于不同的位点,因缺失或突变 而不能转录或翻译,是没有功能的基因。 真核生物中的血红素蛋白基因 家族中就存在假基因现象。 血红蛋白分子 的四条多肽链 浙江大学 遗传学第十一章 17 二、基因的微细结构: 浙江大学 遗传学第十一章 18 设有两个独立起源的隐性突变,具有类似的表现型。 判断是属于同一个基因突变,还是属于两个基因突变? 即判断是否属于等位基因? ①.建立双突变杂合二倍体; ②.测定突变间有无互补作用。 ㈠、互补作用:
4 1.无互补作用:则个体表现为突变型,突变来自同一个基因, 只能产生突变的mRNA ¨形成突变酶和个体, 显示突变的表现型。 2.有互补作用: 突变来自不同的基因,则每个突变的相对位点上都有一 个正常野生型基因¨最终可产生正常mRNA,其个体表现型 为野生型。 本泽尔:提出顺反子, 表示功能的最小单位和顺 反的位置效应。 3.互补测验(顺反测验):根据功能确定等位基因的测验。 顺反测验:根据顺式表现型和反式表现型来确定两个突变体 是否属于同一个基因(顺反子)。 顺式排列为对照(是两个突变座位位于同一条染色体上), 其表现型 Î 野生型。 实质上是进行反式测验(反式排列:是两个突变座位位于不 同的染色体上)。 ① 反式排列为野生型:突变分属于两个基因位点; ② 反式排列为突变型:突变分属于同一基因位点。 浙江大学 遗传学第十一章 22 ㈡、基因的微细结构: 本泽尔利用经典的噬菌体突变和重组技术 Î 分析T4 噬菌体rⅡ区基因的微细结构。 ⑴.原理: r+ 野生型T4噬菌体:侵染E.coli B株和K12株; rⅡ突变型T4噬菌体:只侵染B株,不能侵染K12(λ)株。 利用上述特点: 让两个rⅡ突变型杂交 Î侵染K12(λ) 株,选择重组体r +Î 计算出两个r +突变 座位间的重组频率。 ⑵.方法: 两种rⅡ突变类型:r x、r y r +r x × r y r + ↓混合感染 E.coli B株 接种 B株 K12(λ)株 计数 r+ ry、rxr+ r+ r+ r+ r+、rxry 仅生长一 四种基因型 种重组型 均能生长 浙江大学 遗传学第十一章 24 r47 r104 r101 r106 r31 r107 ⑶.结果: ①.重组值计算: rxry的数量与r+r+ 相同,计算时r+r+ 噬菌体数×2。 可以获得小到0.001%,即十万分之一的重组值。 利用大量rⅡ区内二点杂交结果,绘制出rⅡ区座位间 微细的遗传图: 1.3 1.0 1.6 1.9 1.6 100% B 2 K ( ) 100% 2 r r 12 × × = × × = + + 株上生长的噬菌斑总数 株上生长的噬菌斑数 总噬菌体数 噬菌体数 重组值 λ
4 1.无互补作用:则个体表现为突变型,突变来自同一个基因, 只能产生突变的mRNA ¨形成突变酶和个体, 显示突变的表现型。 2.有互补作用: 突变来自不同的基因,则每个突变的相对位点上都有一 个正常野生型基因¨最终可产生正常mRNA,其个体表现型 为野生型。 本泽尔:提出顺反子, 表示功能的最小单位和顺 反的位置效应。 3.互补测验(顺反测验):根据功能确定等位基因的测验。 顺反测验:根据顺式表现型和反式表现型来确定两个突变体 是否属于同一个基因(顺反子)。 顺式排列为对照(是两个突变座位位于同一条染色体上), 其表现型 Î 野生型。 实质上是进行反式测验(反式排列:是两个突变座位位于不 同的染色体上)。 ① 反式排列为野生型:突变分属于两个基因位点; ② 反式排列为突变型:突变分属于同一基因位点。 浙江大学 遗传学第十一章 22 ㈡、基因的微细结构: 本泽尔利用经典的噬菌体突变和重组技术 Î 分析T4 噬菌体rⅡ区基因的微细结构。 ⑴.原理: r+ 野生型T4噬菌体:侵染E.coli B株和K12株; rⅡ突变型T4噬菌体:只侵染B株,不能侵染K12(λ)株。 利用上述特点: 让两个rⅡ突变型杂交 Î侵染K12(λ) 株,选择重组体r +Î 计算出两个r +突变 座位间的重组频率。 ⑵.方法: 两种rⅡ突变类型:r x、r y r +r x × r y r + ↓混合感染 E.coli B株 接种 B株 K12(λ)株 计数 r+ ry、rxr+ r+ r+ r+ r+、rxry 仅生长一 四种基因型 种重组型 均能生长 浙江大学 遗传学第十一章 24 r47 r104 r101 r106 r31 r107 ⑶.结果: ①.重组值计算: rxry的数量与r+r+ 相同,计算时r+r+ 噬菌体数×2。 可以获得小到0.001%,即十万分之一的重组值。 利用大量rⅡ区内二点杂交结果,绘制出rⅡ区座位间 微细的遗传图: 1.3 1.0 1.6 1.9 1.6 100% B 2 K ( ) 100% 2 r r 12 × × = × × = + + 株上生长的噬菌斑总数 株上生长的噬菌斑数 总噬菌体数 噬菌体数 重组值 λ
5 ②. rⅡ突变体类型: rⅡA、 rⅡB: 两个rⅡA 突变体混合 K12 无噬菌体繁殖 两个rⅡB 突变体混合 K12 无噬菌体繁殖 rⅡA + rⅡB突变体 K12 噬菌体繁殖 ∴ rⅡA与rⅡB区段可以互补,分属于不同基因座位。 浙江大学 遗传学第十一章 26 三、顺式与反式调控: 1. 顺式调控: 如基因启动子发生突变,使调控蛋白不能识别启动子 结构,基因不能表达,这种只影响基因本身表达、不影响 其它等位基因调控的突变Î称顺式调控。 2. 反式调控: 调控蛋白发生突变,不能与这个基因的启动子结合, 将可影响到与该调控蛋白结合有关的所有等位基因位点 表达Î这种突变称为反式调控。 浙江大学 遗传学第十一章 27 浙江大学 遗传学第十一章 28 rRNA 如发生致死突变,不能形成核糖体,易死亡。 转录 tRNA 发生突变后, 多肽链改变。 翻 译 蛋白质 结构蛋白 生物酶 直接 间接 某 段 DNA mRNA 性 状 四、基因的作用与性状的表现: 基因变异 Î 直接影响蛋白质 特性,表现出不同遗传性状。 例如人的镰形红血球贫血症。 红血球碟形 HbA 突变 HbS HbC 红血球镰刀形 血红蛋白分子有四条多肽链: 两条α链(141个氨基酸/条); 两条β链(146个氨基酸/条)。 HbA、Hbs 、Hbc 氨基酸组成的差 异在于β链上第6位上氨基酸: HbA第6位为谷氨酸(GAA、GAG); HbS第6位为缬氨酸(GUA、GUG); HbC第6位为赖氨酸(AAA、AAG)。 1.结构蛋白: S Hbβ 产生贫血症的原因: 单个碱基的突变Î引起氨基酸的改变Î导致蛋白质性质发生 变化,直接产生性状变化。 正常碟形红血球转变为镰刀形红血球Î缺氧时表现贫血症。 HbA HbS HbC
5 ②. rⅡ突变体类型: rⅡA、 rⅡB: 两个rⅡA 突变体混合 K12 无噬菌体繁殖 两个rⅡB 突变体混合 K12 无噬菌体繁殖 rⅡA + rⅡB突变体 K12 噬菌体繁殖 ∴ rⅡA与rⅡB区段可以互补,分属于不同基因座位。 浙江大学 遗传学第十一章 26 三、顺式与反式调控: 1. 顺式调控: 如基因启动子发生突变,使调控蛋白不能识别启动子 结构,基因不能表达,这种只影响基因本身表达、不影响 其它等位基因调控的突变Î称顺式调控。 2. 反式调控: 调控蛋白发生突变,不能与这个基因的启动子结合, 将可影响到与该调控蛋白结合有关的所有等位基因位点 表达Î这种突变称为反式调控。 浙江大学 遗传学第十一章 27 浙江大学 遗传学第十一章 28 rRNA 如发生致死突变,不能形成核糖体,易死亡。 转录 tRNA 发生突变后, 多肽链改变。 翻 译 蛋白质 结构蛋白 生物酶 直接 间接 某 段 DNA mRNA 性 状 四、基因的作用与性状的表现: 基因变异 Î 直接影响蛋白质 特性,表现出不同遗传性状。 例如人的镰形红血球贫血症。 红血球碟形 HbA 突变 HbS HbC 红血球镰刀形 血红蛋白分子有四条多肽链: 两条α链(141个氨基酸/条); 两条β链(146个氨基酸/条)。 HbA、Hbs 、Hbc 氨基酸组成的差 异在于β链上第6位上氨基酸: HbA第6位为谷氨酸(GAA、GAG); HbS第6位为缬氨酸(GUA、GUG); HbC第6位为赖氨酸(AAA、AAG)。 1.结构蛋白: S Hbβ 产生贫血症的原因: 单个碱基的突变Î引起氨基酸的改变Î导致蛋白质性质发生 变化,直接产生性状变化。 正常碟形红血球转变为镰刀形红血球Î缺氧时表现贫血症。 HbA HbS HbC
6 2. 酶蛋白: 例如:豌豆 圆粒(RR) × 皱粒(rr)Î F1 圆粒(Rr) Î F21/4皱粒。 R 基 因 酶蛋白 淀粉 分枝酶 正常合 成淀粉 r 基 因 不合成酶 无功能酶 缺少一 种淀粉 分枝酶 积累蔗糖 和大量的 水分 产生多肽,有表型; ∴基因 产生tRNA、rRNA,无表型; 不转录mRNA,但对其它基因起调控作用。 第二节 基因的调控 浙江大学 遗传学第十一章 33 一种生物的整套遗传密码可以比作一本密码字典 Î 该种生物的每个细胞中都有这本字典。 为什么基因只有在它应该发挥作用的细胞内和应该 发挥作用的时间才能呈现活化状态? 结论:必然有一个基因调控系统在发挥作用。 基因调控主要在三个水平上进行: ①. DNA水平; ②. 转录水平; ③. 翻译水平。 浙江大学 遗传学第十一章 34 一、原核生物的基因调控: 浙江大学 遗传学第十一章 35 ㈠、转录水平的调控: 负调控:细胞中阻遏物阻止基因转录过程的调控机制。 阻遏物与DNA分子结合Î阻碍RNA聚合酶转录Î使基因处于 关闭状态; 正调控:经诱导物诱导转录的调控机制。 诱导物通常与蛋白质 结合 Î 形成一种激活子 复合物 Î 与基因启动子 DNA 序列结合Î 激活基 因起始转录 Î 使基因处 于表达的状态。 浙江大学 遗传学第十一章 36 正调控与负调控并非互相排斥的两种机制,而是生物体 适应环境的需要,有的系统既有正调控又有负调控; 原核生物以负调控为主,真核生物以正调控为主; 降解代谢途径中既有正调控又有负调控;合成代谢途径 中一般以负调控来控制产物自身的合成
6 2. 酶蛋白: 例如:豌豆 圆粒(RR) × 皱粒(rr)Î F1 圆粒(Rr) Î F21/4皱粒。 R 基 因 酶蛋白 淀粉 分枝酶 正常合 成淀粉 r 基 因 不合成酶 无功能酶 缺少一 种淀粉 分枝酶 积累蔗糖 和大量的 水分 产生多肽,有表型; ∴基因 产生tRNA、rRNA,无表型; 不转录mRNA,但对其它基因起调控作用。 第二节 基因的调控 浙江大学 遗传学第十一章 33 一种生物的整套遗传密码可以比作一本密码字典 Î 该种生物的每个细胞中都有这本字典。 为什么基因只有在它应该发挥作用的细胞内和应该 发挥作用的时间才能呈现活化状态? 结论:必然有一个基因调控系统在发挥作用。 基因调控主要在三个水平上进行: ①. DNA水平; ②. 转录水平; ③. 翻译水平。 浙江大学 遗传学第十一章 34 一、原核生物的基因调控: 浙江大学 遗传学第十一章 35 ㈠、转录水平的调控: 负调控:细胞中阻遏物阻止基因转录过程的调控机制。 阻遏物与DNA分子结合Î阻碍RNA聚合酶转录Î使基因处于 关闭状态; 正调控:经诱导物诱导转录的调控机制。 诱导物通常与蛋白质 结合 Î 形成一种激活子 复合物 Î 与基因启动子 DNA 序列结合Î 激活基 因起始转录 Î 使基因处 于表达的状态。 浙江大学 遗传学第十一章 36 正调控与负调控并非互相排斥的两种机制,而是生物体 适应环境的需要,有的系统既有正调控又有负调控; 原核生物以负调控为主,真核生物以正调控为主; 降解代谢途径中既有正调控又有负调控;合成代谢途径 中一般以负调控来控制产物自身的合成
7 浙江大学 遗传学第十一章 37 ㈡、乳糖操纵元(操纵子): 1.乳糖操纵元模型: 1961年,雅各布(Jacob F.)和莫诺(Monod J.) 的操纵元模型: 操纵元:细菌的主要基因调控单位,也就是转录单位。 如:大肠杆菌乳糖代谢的调控需要三种酶参加: ①. β-半乳糖酶:将乳糖分解成半乳糖和葡萄糖; ②. 渗透酶:增加糖的渗透,易于摄取乳糖和半乳糖; ③. 转乙酰酶: β-半乳糖转变成乙酰半乳糖。 大量乳糖时:大肠杆菌三种酶的数量急剧增加,几分钟 即可达到千倍以上,这三种酶能够成比例地增加; 乳糖消耗完:这三种酶的合成也即同时停止。 浙江大学 遗传学第十一章 38 2. 乳糖操纵元的负调控: ①. 乳糖操纵元组成部分; ②. 野生型基因型(I+O+Z+Y+A+), 无乳糖时,基因不表达; ③. 野生型基因型(I+O+Z+Y+A+), 有乳糖时,基因表达; ④. 抑制基因突变(I-O+Z+Y+A+), 无乳糖时,基因组成型表达; ⑤. 操纵基因突变型(I+Oc Z+Y+A+), 无乳糖时,基因组成型表达。 阻遏蛋白 乳糖 RNA聚合酶 浙江大学 遗传学第十一章 39 3. 乳糖操纵元的正调控: 当有乳糖存在时,操纵子开启,基因进行表达。 当既有大量半乳糖又有葡萄糖时,基因表达将会怎样? 基因不表达,存在新的调节因子来控制乳糖操纵子开启,这 个因子的活性与葡萄糖有关。 葡萄糖可使腺苷酸环化酶活性降低; 而腺苷酸环化酶能将ATP转变成cAmP。 cAmP又与代谢激活蛋白 (catabolite activating protein, CAP) 结合¨形成cAmP-CAP 复合物,作为lac操纵子正调 控因子。当cAmP-CAP复合 物二聚体插入到lac特异启动 子序列时¨使DNA构型发生 变化,而RNA聚酶与该新构 型的DNA结合紧密,转录效 率高。 葡萄糖抑制操纵子的原理: 葡萄糖 ¨ 腺苷酸环化酶活性降低 ¨ ATP无法转变成cAmP ¨ 不能形成CAP-cAmP复合蛋白 ¨ RNA酶无法结合在DNA上 ¨ 基因不表达。 浙江大学 遗传学第十一章 41 4. 乳糖操纵元存在的遗传证据: ⑴. 遗传分析的三个基本假定: ①. 阻遏基因的产物是可以在细胞中扩散的反式调控元件; ②. 操纵子O是调控位点,不编码蛋白; ③. O 位点需紧邻 受其控制的结构基因, 是顺式调控元件; 通过性导产生局部 二倍体,可以进行遗传 验证。 浙江大学 遗传学第十一章 42 ⑵. 阻遏蛋白的分离与鉴定: 吉尔伯特(Gilbert W., 1966)等利用阻遏蛋白超量表达突变 型(regulator Quantity,Iq) ¨分离出阻遏蛋白; ①. IPTG 诱导Iq细胞,分离提取阻遏蛋白,用含有同位素标 记的IPTG溶液透析,透析袋内外浓度不一样 ¨ 提取物中含有与 IPTG结合的物质,纯化分析证明具有蛋白特性。 IPTG 乳糖类似物
7 浙江大学 遗传学第十一章 37 ㈡、乳糖操纵元(操纵子): 1.乳糖操纵元模型: 1961年,雅各布(Jacob F.)和莫诺(Monod J.) 的操纵元模型: 操纵元:细菌的主要基因调控单位,也就是转录单位。 如:大肠杆菌乳糖代谢的调控需要三种酶参加: ①. β-半乳糖酶:将乳糖分解成半乳糖和葡萄糖; ②. 渗透酶:增加糖的渗透,易于摄取乳糖和半乳糖; ③. 转乙酰酶: β-半乳糖转变成乙酰半乳糖。 大量乳糖时:大肠杆菌三种酶的数量急剧增加,几分钟 即可达到千倍以上,这三种酶能够成比例地增加; 乳糖消耗完:这三种酶的合成也即同时停止。 浙江大学 遗传学第十一章 38 2. 乳糖操纵元的负调控: ①. 乳糖操纵元组成部分; ②. 野生型基因型(I+O+Z+Y+A+), 无乳糖时,基因不表达; ③. 野生型基因型(I+O+Z+Y+A+), 有乳糖时,基因表达; ④. 抑制基因突变(I-O+Z+Y+A+), 无乳糖时,基因组成型表达; ⑤. 操纵基因突变型(I+Oc Z+Y+A+), 无乳糖时,基因组成型表达。 阻遏蛋白 乳糖 RNA聚合酶 浙江大学 遗传学第十一章 39 3. 乳糖操纵元的正调控: 当有乳糖存在时,操纵子开启,基因进行表达。 当既有大量半乳糖又有葡萄糖时,基因表达将会怎样? 基因不表达,存在新的调节因子来控制乳糖操纵子开启,这 个因子的活性与葡萄糖有关。 葡萄糖可使腺苷酸环化酶活性降低; 而腺苷酸环化酶能将ATP转变成cAmP。 cAmP又与代谢激活蛋白 (catabolite activating protein, CAP) 结合¨形成cAmP-CAP 复合物,作为lac操纵子正调 控因子。当cAmP-CAP复合 物二聚体插入到lac特异启动 子序列时¨使DNA构型发生 变化,而RNA聚酶与该新构 型的DNA结合紧密,转录效 率高。 葡萄糖抑制操纵子的原理: 葡萄糖 ¨ 腺苷酸环化酶活性降低 ¨ ATP无法转变成cAmP ¨ 不能形成CAP-cAmP复合蛋白 ¨ RNA酶无法结合在DNA上 ¨ 基因不表达。 浙江大学 遗传学第十一章 41 4. 乳糖操纵元存在的遗传证据: ⑴. 遗传分析的三个基本假定: ①. 阻遏基因的产物是可以在细胞中扩散的反式调控元件; ②. 操纵子O是调控位点,不编码蛋白; ③. O 位点需紧邻 受其控制的结构基因, 是顺式调控元件; 通过性导产生局部 二倍体,可以进行遗传 验证。 浙江大学 遗传学第十一章 42 ⑵. 阻遏蛋白的分离与鉴定: 吉尔伯特(Gilbert W., 1966)等利用阻遏蛋白超量表达突变 型(regulator Quantity,Iq) ¨分离出阻遏蛋白; ①. IPTG 诱导Iq细胞,分离提取阻遏蛋白,用含有同位素标 记的IPTG溶液透析,透析袋内外浓度不一样 ¨ 提取物中含有与 IPTG结合的物质,纯化分析证明具有蛋白特性。 IPTG 乳糖类似物
8 浙江大学 遗传学第十一章 43 ②. 沉降分析: IPTG阻遏蛋白复合物+lacO+序列: DNA沉降系数为40S; IPTG阻遏蛋白复合物:沉降系数为7S; IPTG阻遏蛋白复合物(同位素标记)+DNA序列:超速梯度 沉降分析有同位标记的沉降系数为40S。 ③. 序列特异结合: 阻遏蛋白只与正常的乳糖操纵子(lac O)序列结合,而 不与lacOc 的序列结合。 浙江大学 遗传学第十一章 44 ⑶. 蛋白的结晶分析: 刘毅斯(Lewis M., 1996 )等成功地测定了 阻遏蛋白的晶体结构, 与诱导物以及与DNA 序 列的结合的结构。 阻遏蛋白: 360个氨基酸; 功能蛋白: 同聚四聚体。 浙江大学 遗传学第十一章 45 操纵元调控位点的精细分析: 浙江大学 遗传学第十一章 46 ㈢、色氨酸操纵元: 1.色氨酸操纵元模型: 由雅各布(Jacob F.)和莫诺(Monod J.)提出,具有合成 代谢途径典型的操纵元模型。 操纵元:包括色氨酸合成有关的5种酶的结构基因; 大量色氨酸时:大肠杆菌5种酶的转录同时受到抑制; 色氨酸不足时:这5种酶的基因开始转转录; 色氨酸:作为阻遏物而不是诱导物参与调控结构基因的 转录。 ∴ trp操纵元是一个典型的可阻遏操纵元模型(repressible operon)。 色氨酸操纵元模型结构: 5种结构基因:trpE、D、C、B、A; 调控结构:启动子、操纵子、前导序列、弱化子; 阻遏物trpR基因:与trp操纵元相距较远; 浙江大学 遗传学第十一章 48 2.色氨酸操纵元的负调控: ⑴. 阻遏调控: trpR基因编码无辅基阻遏物 ¨ 与色氨酸结合 ¨形成 有活性的色氨酸阻遏物 ¨ 与操纵子结合 ¨ 阻止转录; 色氨酸不足:阻遏物三维空间结构发生变化 ,不能 与操纵子结合,操纵元开始转录; 色氨酸浓度升高:色氨酸与阻遏物结合,空间结构 发生变化,可与操纵子结合,阻止转录
8 浙江大学 遗传学第十一章 43 ②. 沉降分析: IPTG阻遏蛋白复合物+lacO+序列: DNA沉降系数为40S; IPTG阻遏蛋白复合物:沉降系数为7S; IPTG阻遏蛋白复合物(同位素标记)+DNA序列:超速梯度 沉降分析有同位标记的沉降系数为40S。 ③. 序列特异结合: 阻遏蛋白只与正常的乳糖操纵子(lac O)序列结合,而 不与lacOc 的序列结合。 浙江大学 遗传学第十一章 44 ⑶. 蛋白的结晶分析: 刘毅斯(Lewis M., 1996 )等成功地测定了 阻遏蛋白的晶体结构, 与诱导物以及与DNA 序 列的结合的结构。 阻遏蛋白: 360个氨基酸; 功能蛋白: 同聚四聚体。 浙江大学 遗传学第十一章 45 操纵元调控位点的精细分析: 浙江大学 遗传学第十一章 46 ㈢、色氨酸操纵元: 1.色氨酸操纵元模型: 由雅各布(Jacob F.)和莫诺(Monod J.)提出,具有合成 代谢途径典型的操纵元模型。 操纵元:包括色氨酸合成有关的5种酶的结构基因; 大量色氨酸时:大肠杆菌5种酶的转录同时受到抑制; 色氨酸不足时:这5种酶的基因开始转转录; 色氨酸:作为阻遏物而不是诱导物参与调控结构基因的 转录。 ∴ trp操纵元是一个典型的可阻遏操纵元模型(repressible operon)。 色氨酸操纵元模型结构: 5种结构基因:trpE、D、C、B、A; 调控结构:启动子、操纵子、前导序列、弱化子; 阻遏物trpR基因:与trp操纵元相距较远; 浙江大学 遗传学第十一章 48 2.色氨酸操纵元的负调控: ⑴. 阻遏调控: trpR基因编码无辅基阻遏物 ¨ 与色氨酸结合 ¨形成 有活性的色氨酸阻遏物 ¨ 与操纵子结合 ¨ 阻止转录; 色氨酸不足:阻遏物三维空间结构发生变化 ,不能 与操纵子结合,操纵元开始转录; 色氨酸浓度升高:色氨酸与阻遏物结合,空间结构 发生变化,可与操纵子结合,阻止转录
9 浙江大学 遗传学第十一章 49 ⑵. 弱化子调控: 当有色氨酸存在而trp操纵元受抑制时,仍有一段前导序列 发生转录,可能存在另一种的机制来抑制trp操纵元的转录? 色氨酸高浓度存在时,转录的前导序列140bp长,其中有一 28bp的弱化子区域;形成发夹结构,为内部终止子,RNA酶从 DNA上脱落; 色氨酸低浓度或不存在时,RNA聚合酶能通过弱化子区域, 转录完整的多顺反子mRNA序列; 问题:弱化子如何进行调控? 前导序列可翻译出一段14个氨基酸的短肽,在该短肽的第10、 11位置上是两个色氨酸密码子;两个密码子之后是一段mRNA序列, 该序列可分为四个区段,区段间可互补配对,形成不同的二级结构。 浙江大学 遗传学第十一章 51 原核生物为边转录边翻译,前导序列中核糖体位置决定形成 哪种二级结构Ä从而决定弱化子是否可形成终止信号。 ①. 当有色氨酸时,完整翻译短肽 Ä 核糖体停留在终止密码子 处,邻近区段2位置 Ä 阻碍了2,3配对 Ä 使3, 4区段配对形成发夹 结构终止子 Ä RNA酶在弱化子处终止,不能向前移动。 ②. 如缺乏色氨酸,核糖体到达色氨酸密码子时Ä 由于没有色氨 酰tRNA的供应 Ä 停留在该密码子位置,位于区段1 Ä 使区段2与区段 3配对Ä 区段4无对应序列配对呈单链状态 Ä RNA聚合酶通过弱化子, 继续向前移动,转录出完整的多顺反子序列。 苏氨酸在前导肽中有8个氨基酸密码子存在,组氨酸则有7个组氨 酸密码子存在,核糖体停留在这些位置时,弱化子不产生发夹结构, 结构基因开始转录。 细菌弱化子的 作用是许多关键 氨基酸生物合成所 共有的一种调控机 制;在苏氨酸、组 氨酸、亮氨酸和苯 丙氨酸等操纵元的 前导肽中均有弱化 子存在,具有多个 相应氨基酸密码子 供核糖体停留。 浙江大学 遗传学第十一章 54 ⑶. 阿拉伯糖操纵元: Ara操纵元是控制分解代谢途径的另一调控系统。 特点:调节蛋白既可起正调控作用,又可起负调控作用。 组成:R: araC基因编码调节蛋白AraC蛋白; O:O1不参与调控;O2 :AraC蛋白负调控结合位点; I:调节位点,CAP-cAmP复合物结合位点,AraC 蛋白正调控结合位点
9 浙江大学 遗传学第十一章 49 ⑵. 弱化子调控: 当有色氨酸存在而trp操纵元受抑制时,仍有一段前导序列 发生转录,可能存在另一种的机制来抑制trp操纵元的转录? 色氨酸高浓度存在时,转录的前导序列140bp长,其中有一 28bp的弱化子区域;形成发夹结构,为内部终止子,RNA酶从 DNA上脱落; 色氨酸低浓度或不存在时,RNA聚合酶能通过弱化子区域, 转录完整的多顺反子mRNA序列; 问题:弱化子如何进行调控? 前导序列可翻译出一段14个氨基酸的短肽,在该短肽的第10、 11位置上是两个色氨酸密码子;两个密码子之后是一段mRNA序列, 该序列可分为四个区段,区段间可互补配对,形成不同的二级结构。 浙江大学 遗传学第十一章 51 原核生物为边转录边翻译,前导序列中核糖体位置决定形成 哪种二级结构Ä从而决定弱化子是否可形成终止信号。 ①. 当有色氨酸时,完整翻译短肽 Ä 核糖体停留在终止密码子 处,邻近区段2位置 Ä 阻碍了2,3配对 Ä 使3, 4区段配对形成发夹 结构终止子 Ä RNA酶在弱化子处终止,不能向前移动。 ②. 如缺乏色氨酸,核糖体到达色氨酸密码子时Ä 由于没有色氨 酰tRNA的供应 Ä 停留在该密码子位置,位于区段1 Ä 使区段2与区段 3配对Ä 区段4无对应序列配对呈单链状态 Ä RNA聚合酶通过弱化子, 继续向前移动,转录出完整的多顺反子序列。 苏氨酸在前导肽中有8个氨基酸密码子存在,组氨酸则有7个组氨 酸密码子存在,核糖体停留在这些位置时,弱化子不产生发夹结构, 结构基因开始转录。 细菌弱化子的 作用是许多关键 氨基酸生物合成所 共有的一种调控机 制;在苏氨酸、组 氨酸、亮氨酸和苯 丙氨酸等操纵元的 前导肽中均有弱化 子存在,具有多个 相应氨基酸密码子 供核糖体停留。 浙江大学 遗传学第十一章 54 ⑶. 阿拉伯糖操纵元: Ara操纵元是控制分解代谢途径的另一调控系统。 特点:调节蛋白既可起正调控作用,又可起负调控作用。 组成:R: araC基因编码调节蛋白AraC蛋白; O:O1不参与调控;O2 :AraC蛋白负调控结合位点; I:调节位点,CAP-cAmP复合物结合位点,AraC 蛋白正调控结合位点
10 浙江大学 遗传学第十一章 55 调控: ①. 诱导物阿拉伯糖和cAMP同时存在: Ara 与AraC蛋白复合物结合在I位点, CAP-cAmp复合 物结合I位点,基因转录开启; ②. 在没有诱导物阿拉伯糖和cAMP时: AraC蛋白同时与I和 O2结合,DNA构型发生改变,形成 一个紧密的环结构,抑制表达。 浙江大学 遗传学第十一章 57 ⑷. 翻译水平的调控: ①. 反馈调控机制(feedback regulation): 大肠杆菌核糖体蛋白合成: E. coli有 7 个参与核糖体蛋白合成的操纵元结构 ¨ 转录的 各种mRNA都可与同一操纵元编码的核糖体蛋白识别结合; 如果其中有一种核糖体蛋白过量累积,它们将与其自身的 mRNA 结合¨阻止进一步翻译。 结合位点: 5‘ 端非翻译区(untranslated region,UTR),也包括启动子 Shine-Dalgarno 序列,为mRNA翻译起始信号上游的一段5’- AGGAGGU- 3’保守序列,与16SrRNA3’端保守序列互补配对。 浙江大学 遗传学第十一章 58 ②. 反义RNA(antisense RNA)的调控: 原核生物中mRNA的翻译也受反义RNA的调控。 反义RNA与mRNA 的5’ 端非翻译区UTR片段互补配对, 使mRNA不能有效地与核糖体结合 ¨ 阻止蛋白质的合成。 真核细胞中导入反义RNA基因 ¨ 控制真核生物基因表达。 如将乙烯形成酶基因的反义RNA导入番茄,延长了番茄 常温贮藏期。 浙江大学 遗传学第十一章 59 二、真核生物的基因调控: 真核生物与原核生物的调控差异 真核生物 原核生物 操纵元调控 多样化调控,更为复杂 基因组小,大肠杆菌: 总长 4.6×106 bp, 编码 4288 个基因, 每个基因 约 1100bp 基因组大,人类基因组全长3×109 bp, 编码10万个基因,其余为重复序列 基因分布在同一染色体 上,操纵元控制 DNA 与组蛋白结合成染色质,染色质 的变化调控基因表达;基因分布在不 同的染色体上,存在不同染色体间基 因的调控问题 适应外界环境,操纵元 调控表达 基因差别表达是细胞分化和功能的核 心 转录和翻译同时进行, 大部分为转录水平调控 转录和翻译在时间和空间上均不同, 从 DNA 到蛋白质的各层次上都有调 控,但多数为转录水平调控
10 浙江大学 遗传学第十一章 55 调控: ①. 诱导物阿拉伯糖和cAMP同时存在: Ara 与AraC蛋白复合物结合在I位点, CAP-cAmp复合 物结合I位点,基因转录开启; ②. 在没有诱导物阿拉伯糖和cAMP时: AraC蛋白同时与I和 O2结合,DNA构型发生改变,形成 一个紧密的环结构,抑制表达。 浙江大学 遗传学第十一章 57 ⑷. 翻译水平的调控: ①. 反馈调控机制(feedback regulation): 大肠杆菌核糖体蛋白合成: E. coli有 7 个参与核糖体蛋白合成的操纵元结构 ¨ 转录的 各种mRNA都可与同一操纵元编码的核糖体蛋白识别结合; 如果其中有一种核糖体蛋白过量累积,它们将与其自身的 mRNA 结合¨阻止进一步翻译。 结合位点: 5‘ 端非翻译区(untranslated region,UTR),也包括启动子 Shine-Dalgarno 序列,为mRNA翻译起始信号上游的一段5’- AGGAGGU- 3’保守序列,与16SrRNA3’端保守序列互补配对。 浙江大学 遗传学第十一章 58 ②. 反义RNA(antisense RNA)的调控: 原核生物中mRNA的翻译也受反义RNA的调控。 反义RNA与mRNA 的5’ 端非翻译区UTR片段互补配对, 使mRNA不能有效地与核糖体结合 ¨ 阻止蛋白质的合成。 真核细胞中导入反义RNA基因 ¨ 控制真核生物基因表达。 如将乙烯形成酶基因的反义RNA导入番茄,延长了番茄 常温贮藏期。 浙江大学 遗传学第十一章 59 二、真核生物的基因调控: 真核生物与原核生物的调控差异 真核生物 原核生物 操纵元调控 多样化调控,更为复杂 基因组小,大肠杆菌: 总长 4.6×106 bp, 编码 4288 个基因, 每个基因 约 1100bp 基因组大,人类基因组全长3×109 bp, 编码10万个基因,其余为重复序列 基因分布在同一染色体 上,操纵元控制 DNA 与组蛋白结合成染色质,染色质 的变化调控基因表达;基因分布在不 同的染色体上,存在不同染色体间基 因的调控问题 适应外界环境,操纵元 调控表达 基因差别表达是细胞分化和功能的核 心 转录和翻译同时进行, 大部分为转录水平调控 转录和翻译在时间和空间上均不同, 从 DNA 到蛋白质的各层次上都有调 控,但多数为转录水平调控