2024/11/1 1 第 二 章 微 生 物 分 类 与 鉴 定
2024/11/1 1 第 二 章 微 生 物 分 类 与 鉴 定
2024/11/1 2 主要内容 一、微生物的分类单位 二、微生物的命名 三、微生物分类的依据 四、分类的方法 五、微生物的鉴定 六、微生物的常用分类系统
2024/11/1 2 主要内容 一、微生物的分类单位 二、微生物的命名 三、微生物分类的依据 四、分类的方法 五、微生物的鉴定 六、微生物的常用分类系统
2024/11/1 3 一、微生物的分类单位 1.微生物分类的目的:把各种微生物按照它们的亲缘 关系分群归类,排成条理清楚的系统,以便于人们对微生 物进行鉴定和交流。 2. 微生物分类的任务: 分类:通过收集大量描述有关个体的文献资料,经过归纳, 整理成一个科学的分类系统。 鉴定:通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各 种性状特征,然后查找现成的分类系统,以达到对 其知类,辨名的目的。 命名:是为新发现的微生物确定新的学名
2024/11/1 3 一、微生物的分类单位 1.微生物分类的目的:把各种微生物按照它们的亲缘 关系分群归类,排成条理清楚的系统,以便于人们对微生 物进行鉴定和交流。 2. 微生物分类的任务: 分类:通过收集大量描述有关个体的文献资料,经过归纳, 整理成一个科学的分类系统。 鉴定:通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各 种性状特征,然后查找现成的分类系统,以达到对 其知类,辨名的目的。 命名:是为新发现的微生物确定新的学名
2024/11/1 4 3. 通用分类单元 种以上的系统分类单元 界 Kingdom(拉:Regnum) 门 Phylum(拉:Phylum)或Division(拉:Divisio)—亚门 纲 Class(拉:Classis)—亚纲 —超目 目 Order (拉:Ordo)—亚目 科 Family (拉:Familia)—亚科 —族 —亚族 属 Genus(拉:Genus) 种 Species(拉:Species)
2024/11/1 4 3. 通用分类单元 种以上的系统分类单元 界 Kingdom(拉:Regnum) 门 Phylum(拉:Phylum)或Division(拉:Divisio)—亚门 纲 Class(拉:Classis)—亚纲 —超目 目 Order (拉:Ordo)—亚目 科 Family (拉:Familia)—亚科 —族 —亚族 属 Genus(拉:Genus) 种 Species(拉:Species)
2024/11/1 5 4. 种的概念 ➢种是一个基本分类单位 定义:种是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其 接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 或定义 亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进化发育阶段 上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源 性≧70% 。 模式种:在微生物中,一个种只能用该种内的一个典 型菌株作为具体标本,它就是该种的模式种。 ➢新种: sp.nov.或nov. sp.,新被鉴定的种发表时应 在其学名后标上sp.nov.的符号,新种发表前应将其模 式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构,并应允 许人们从中取得
2024/11/1 5 4. 种的概念 ➢种是一个基本分类单位 定义:种是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其 接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 或定义 亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进化发育阶段 上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源 性≧70% 。 模式种:在微生物中,一个种只能用该种内的一个典 型菌株作为具体标本,它就是该种的模式种。 ➢新种: sp.nov.或nov. sp.,新被鉴定的种发表时应 在其学名后标上sp.nov.的符号,新种发表前应将其模 式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构,并应允 许人们从中取得
2024/11/1 6 亚种(小种race)(subspecies):实验室中获得的微生物变 异型称为小种或亚种。 或定义 :一般指其某一稳定的 特征的种与模式种中不同的种,常在种名、属名的名词后 写上subsp.然后再写具体亚种的名词。 变种(variety):从自然界分离到的微生物纯种,如果与 典型种之间存在某些特征的差别,而这些特征又是稳定 遗传的,则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽 孢杆菌的黑色变种(在酪氨酸培养基上产黑色素)。是亚种 的同义词(1975)已规定它在命名法中没有地位。 5. 种以下的分类单元
2024/11/1 6 亚种(小种race)(subspecies):实验室中获得的微生物变 异型称为小种或亚种。 或定义 :一般指其某一稳定的 特征的种与模式种中不同的种,常在种名、属名的名词后 写上subsp.然后再写具体亚种的名词。 变种(variety):从自然界分离到的微生物纯种,如果与 典型种之间存在某些特征的差别,而这些特征又是稳定 遗传的,则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽 孢杆菌的黑色变种(在酪氨酸培养基上产黑色素)。是亚种 的同义词(1975)已规定它在命名法中没有地位。 5. 种以下的分类单元
2024/11/1 7 菌株(品系)(strain):表示任何由一个独立分离 的单细胞繁殖而成的纯种群体极其一切后代。一种微生 物的每一不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为某菌 种的一个菌株。某一菌种内的菌株数目几乎是无数的。 菌株的名称可用字母加编号表示,字母多表示实 验室、产地或特征等的名称,编号则表示序号等数字。 例如,Bacillus subtilis AS1.398表示枯草芽孢杆菌的 蛋白酶生产菌株。“AS”为Academia Sinica(中国科学 院)的缩写。又如,Bifidobacterium bifidum ATCC 29521表示两歧双歧杆菌一个模式菌株。“ATCC”为 American Type Clutre Collection(美国典型菌种保藏 中心)的缩写
2024/11/1 7 菌株(品系)(strain):表示任何由一个独立分离 的单细胞繁殖而成的纯种群体极其一切后代。一种微生 物的每一不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为某菌 种的一个菌株。某一菌种内的菌株数目几乎是无数的。 菌株的名称可用字母加编号表示,字母多表示实 验室、产地或特征等的名称,编号则表示序号等数字。 例如,Bacillus subtilis AS1.398表示枯草芽孢杆菌的 蛋白酶生产菌株。“AS”为Academia Sinica(中国科学 院)的缩写。又如,Bifidobacterium bifidum ATCC 29521表示两歧双歧杆菌一个模式菌株。“ATCC”为 American Type Clutre Collection(美国典型菌种保藏 中心)的缩写
2024/11/1 8 型(type or form):自然界存在的差异较小的同种微生 物的不同类型,称为型。如结核分支杆菌依其寄主的 不同可分为人型、牛型和禽型。(菌株的同义词 ) 群(group):有些微生物的特征介于两种微生物之间, 我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群。(没 有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生 物)如大肠菌群。 相(phase):自然界存在的微生物交互变异的一定阶 段; 态(state):通常指微生物的菌落变异状态
2024/11/1 8 型(type or form):自然界存在的差异较小的同种微生 物的不同类型,称为型。如结核分支杆菌依其寄主的 不同可分为人型、牛型和禽型。(菌株的同义词 ) 群(group):有些微生物的特征介于两种微生物之间, 我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群。(没 有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生 物)如大肠菌群。 相(phase):自然界存在的微生物交互变异的一定阶 段; 态(state):通常指微生物的菌落变异状态
2024/11/1 9 二、微生物的命名 1.学名(scientific name)按照《国际细菌命名法规》命名的、 国际学术界公认并通用的正式名字。 命名的方法:国际法规命名,即林奈氏所创立的双(三)名法。 双名法的规则:学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定 名人和鲜明定名年份 由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成, 属名(generic name)为名词,单数,开头字母大写,是该微生 物的主要特征。 种名加词(specific epithet) (adj.) ,首字小写,为形容词,是该微 生物的次要特征。 在出版物中用斜体,书写时在学名下划横线以表示斜体
2024/11/1 9 二、微生物的命名 1.学名(scientific name)按照《国际细菌命名法规》命名的、 国际学术界公认并通用的正式名字。 命名的方法:国际法规命名,即林奈氏所创立的双(三)名法。 双名法的规则:学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定 名人和鲜明定名年份 由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成, 属名(generic name)为名词,单数,开头字母大写,是该微生 物的主要特征。 种名加词(specific epithet) (adj.) ,首字小写,为形容词,是该微 生物的次要特征。 在出版物中用斜体,书写时在学名下划横线以表示斜体
2024/11/1 10 例1.大肠埃希氏杆菌(简称大肠杆菌): Eschericha coli ( Migula ) Castellani et Chalmers 1919 例2.枯草芽孢杆菌(简称枯草杆菌): Bacillus subtilis (Ehrenberg)Cohn 1872 例3.金黄色葡萄球菌: Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 出现在分类学文献中的学名,在此两者之后往往还加上3 项内容,即首次定名人(正体字,用括号括住)、现名定名 人(正体字)和现名定名年份,但一般情况下省去
2024/11/1 10 例1.大肠埃希氏杆菌(简称大肠杆菌): Eschericha coli ( Migula ) Castellani et Chalmers 1919 例2.枯草芽孢杆菌(简称枯草杆菌): Bacillus subtilis (Ehrenberg)Cohn 1872 例3.金黄色葡萄球菌: Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 出现在分类学文献中的学名,在此两者之后往往还加上3 项内容,即首次定名人(正体字,用括号括住)、现名定名 人(正体字)和现名定名年份,但一般情况下省去