第十三章微生物的分类 微生物的分类和鉴定 定义：按微生物的亲缘把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分 类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名
第十三章微生物的分类 微生物的分类和鉴定 定义：按微生物的亲缘把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分 类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 第一节 通用分类单元 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 第一节 通用分类单元 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species
第十三章微生物的分类 一、种的概念 ❖ 定义：种是一个基本分类单位，是一大群 表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、 与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个 典型菌株作为具体标本，它就是该种的模 式种。 ❖ 新种： sp.nov. 或nov. sp.，新被鉴定的种 发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号， 新种发表前应将其模式菌株的培养物存放 在一个永久性的保藏机构，并应允许人们 从中取得
第十三章微生物的分类 一、种的概念 ❖ 定义：种是一个基本分类单位，是一大群 表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、 与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个 典型菌株作为具体标本，它就是该种的模 式种。 ❖ 新种： sp.nov. 或nov. sp.，新被鉴定的种 发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号， 新种发表前应将其模式菌株的培养物存放 在一个永久性的保藏机构，并应允许人们 从中取得
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 二、微生物的学名 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照 《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认， 并通用的名称。 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名 定名人和鲜明定名年份 规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以 组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征， 首字小写
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 二、微生物的学名 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照 《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认， 并通用的名称。 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名 定名人和鲜明定名年份 规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以 组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征， 首字小写
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 三、亚种以下的分类单元 ❖ 亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指其某一 民而稳定的特征与模式中不同的种常在种名、署名的加 词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词； ❖ 变种（variety）：容易引起混乱； ❖ 型 （form）：使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现 已作废； ❖ 类群（group）：没有分类地位非正式地指定一组具有某 些共同性状的生物； ❖ 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖 而成的纯种群体极其一切后代；实际上是一个微生物达 到遗传性纯的标志。 ❖ 小种（race）：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵 义； ❖ 相（phase）：自然界存在的微生物交互变异的一定阶段； ❖ 态（state）：通常指微生物的菌落变异状态
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 三、亚种以下的分类单元 ❖ 亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指其某一 民而稳定的特征与模式中不同的种常在种名、署名的加 词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词； ❖ 变种（variety）：容易引起混乱； ❖ 型 （form）：使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现 已作废； ❖ 类群（group）：没有分类地位非正式地指定一组具有某 些共同性状的生物； ❖ 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖 而成的纯种群体极其一切后代；实际上是一个微生物达 到遗传性纯的标志。 ❖ 小种（race）：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵 义； ❖ 相（phase）：自然界存在的微生物交互变异的一定阶段； ❖ 态（state）：通常指微生物的菌落变异状态
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 四、微生物的分类与命名 （一）微生物的分类单位 界、门、纲、目、科、属、种 种是最基本的分类单位 每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科. 以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是： 界(Kindom)：真菌界 门(Phyllum)：真菌门 纲(Class)：子囊菌纲 目(Order)：内孢霉目 科(Family)：内孢霉科 属(Genus)：酵母属 种(Species)：啤酒酵母
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 四、微生物的分类与命名 （一）微生物的分类单位 界、门、纲、目、科、属、种 种是最基本的分类单位 每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科. 以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是： 界(Kindom)：真菌界 门(Phyllum)：真菌门 纲(Class)：子囊菌纲 目(Order)：内孢霉目 科(Family)：内孢霉科 属(Genus)：酵母属 种(Species)：啤酒酵母
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 1. 种（species）：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度 相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的 总称。 ①菌株（strain）:表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成 的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的 一组纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养 物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。 例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株： Escherichia coli B 和Escherichia coli K12 ❖菌株的表示法： ❖如果说种是分类学上的基本单位，那末菌株实际上是应用的基 本单位，因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上 会有很大的不同和差别！ 微生物的分类单位-1
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 1. 种（species）：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度 相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的 总称。 ①菌株（strain）:表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成 的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的 一组纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养 物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。 例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株： Escherichia coli B 和Escherichia coli K12 ❖菌株的表示法： ❖如果说种是分类学上的基本单位，那末菌株实际上是应用的基 本单位，因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上 会有很大的不同和差别！ 微生物的分类单位-1
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 ② 亚种(subspecies）或变种(variety)： 为种内的再分类。 当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗 传形状，而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两 个或更多的小的分类单元——亚种。 变种是亚种的同义词，因“变种”一词易引起词义上的混淆， 从1976年后，不在使用变种一词。通常把实验室中所获得的变 异型菌株，称之为亚种。 如：E.coli k12（野生型）是不需要特殊aa的，而实验室变异后， 可从k12获得某aa的缺陷型，此即称为E.coli k12的亚种。 ③ 型(form): 常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性 状差异不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如：按抗原特征的差异分为不同的血清型； 微生物的分类单位-2
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 ② 亚种(subspecies）或变种(variety)： 为种内的再分类。 当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗 传形状，而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两 个或更多的小的分类单元——亚种。 变种是亚种的同义词，因“变种”一词易引起词义上的混淆， 从1976年后，不在使用变种一词。通常把实验室中所获得的变 异型菌株，称之为亚种。 如：E.coli k12（野生型）是不需要特殊aa的，而实验室变异后， 可从k12获得某aa的缺陷型，此即称为E.coli k12的亚种。 ③ 型(form): 常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性 状差异不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如：按抗原特征的差异分为不同的血清型； 微生物的分类单位-2
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 （二）微生物的命名 微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉———粗糙脉孢霉 绿脓杆菌———铜绿假单胞菌 ❖学名—是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国 际委员会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外 来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。 ①双名法： 学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份 必要，用斜体表示 可省略，用正体字 ❖属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母 大写，表示微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科 学家命名。 ❖种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 （二）微生物的命名 微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉———粗糙脉孢霉 绿脓杆菌———铜绿假单胞菌 ❖学名—是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国 际委员会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外 来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。 ①双名法： 学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份 必要，用斜体表示 可省略，用正体字 ❖属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母 大写，表示微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科 学家命名。 ❖种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 例：大肠埃希氏杆菌 Escherichia coli （Migula）Castellani et Chalmers 1919 金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 ❖ 当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未定种 名）时，可在属名后加sp.或ssp.（分别代表species 缩写的 单数和复数形式） 例如：Saccharomyces sp. 表示酵母菌属中的一个种。 （二）微生物的命名（续）
第 十 三 章 微 生 物 的 分 类 例：大肠埃希氏杆菌 Escherichia coli （Migula）Castellani et Chalmers 1919 金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 ❖ 当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未定种 名）时，可在属名后加sp.或ssp.（分别代表species 缩写的 单数和复数形式） 例如：Saccharomyces sp. 表示酵母菌属中的一个种。 （二）微生物的命名（续）