一、 DNA甲基化与基因表达 DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一, 可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化 能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导 了基因的重新活化和表达。 1.DNA甲基化的主要形式 5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基 鸟嘌呤。在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要 出现在CpG和CpXpG中,原核生物中 CCA/TGG和GATC也常被甲基化
一、 DNA甲基化与基因表达 DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一, 可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化 能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导 了基因的重新活化和表达。 1.DNA甲基化的主要形式 5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基 鸟嘌呤。在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要 出现在CpG和CpXpG中,原核生物中 CCA/TGG和GATC也常被甲基化
NH NHa H,C 甲基化 胞嘧啶 5-甲基胞密啶 NH, HN-CH, 甲基化 腺隳玲 N,甲基腺隳岭 甲基化— 鸟嘌岭 ?-甲基鸟嘌吟 图7-15-甲基胞嘧啶、N-甲基腺骠岭和7-甲基鸟隳岭结构图
表7-1不同生物DNA甲基化的特征比较 特征 脊 椎动物 植物 大肠杆菌 甲基化的碱基 m'Cyt mCyt m'Cyt,m'Ade 甲基化序列 CpG CpG.CpXpG CCA/TGG,GATC 甲基化程度 ≤90% ≤90% 约100% 甲基化对称性 + + + 甲基化酶的种类 1 多个 DNA底物特异性 半甲基化DNA优先 半甲基化和无甲基化DNA
真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:一 种被称为日常型(mainte-nance)甲基转移酶, 另一种是 从头合成(denovo synthesis)甲基转 移酶。前者主要在甲基化母链(模板链)指导下 使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶 相对应的胞嘧啶甲基化。日常型甲基转移酶常常 与DNA内切酶活性相耦联,有3种类型。II类酶活 性包括内切酶和甲基化酶两种成分,而I类和III类 都是双功能酶,既能将半甲基化DNA甲基化,又 能降解外源无甲基化DNA
真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:一 种被称为日常型(mainte-nance)甲基转移酶, 另一种是 从头合成(denovo synthesis)甲基转 移酶。前者主要在甲基化母链(模板链)指导下 使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶 相对应的胞嘧啶甲基化。日常型甲基转移酶常常 与DNA内切酶活性相耦联,有3种类型。II类酶活 性包括内切酶和甲基化酶两种成分,而I类和III类 都是双功能酶,既能将半甲基化DNA甲基化,又 能降解外源无甲基化DNA
CHa ACGTATCGT ACGTATE methylated cytosine me助ation mthated 1106 iiW 5 cytosine CHa TGCATAGCA TGCATAE ACGTATCGT 3 oreced by 3 6 DNA y mainterance maintenan图 TGCATAGCA tepleation methe 简h链 CHa ACGTATCGT ACGTATC 3 ii田 methylation 5 ii册 5 TGCATAGCA TGCATAR 4-68 C
表7-2细胞内3类日常型甲基转移酶活性分析 特性 1类 1类 1类 蛋白质结构 甲基化与内切酶功能 双功能醇,2个亚基 双功能酶,3个亚基 由不同蛋白质执行 识别位点 4~6bp,常为回文结构 5~1bp,常为不对称序列由两个不对称序列构成 酶切位点 同识别位点或非常靠 识别位点下游24~25bp 非特异性,可在距识别 近该位点 位点>1000bp处 内切/甲基化相互独立 同时进行 不能同时进行 其他 不需要ATP水解 需要ATP水解 需要ATP水解
由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失,所以,高等 真核生物中CG序列远远低于其理论值。哺乳类基因组 中约存在4万个CG islands,大多位于转录单元的5‘区。 没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用,就可能被氧 化成为U,被DNA修复系统所识别和切除,恢复成C。 已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法 被区分。因此, CpG序列极易丢失
由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失,所以,高等 真核生物中CG序列远远低于其理论值。哺乳类基因组 中约存在4万个CG islands,大多位于转录单元的5‘区。 没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用,就可能被氧 化成为U,被DNA修复系统所识别和切除,恢复成C。 已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法 被区分。因此, CpG序列极易丢失