裁反应(PCR)技术
一.实验目的及背景 多聚酶链式反应(polymerase chain reaction)简称PCR技术,是8 0年代中期发展起来的一种体外扩增特异DNA片段的技术。此 法操作简便, 可在短时间内在试管中获得数百万个特异的目的D NA序列的拷贝,PCR技术虽然问世仅数年时间, 但它已迅速 渗透到分子生物学的各个领域,引起了生物技术发展的一次革命, 目前它在分子克隆, 目的基础检测,遗传病的基因诊断,法医学, 考古学等方面得到了广泛的应用。 PCR技术实际上是在模板DNA, 引物和4种脱氧核苷酸存在 的条件下依赖于DNA聚合酶的酶促合反应,PCR技术的特异 性取决于引物和模板DNA结合的特异性。 反应分三步:①变性 (denaturation);②退火(annealing);③延伸(ex tension), 反应过程见图
一.实验目的及背景 多聚酶链式反应(polymerase chain reaction)简称PCR技术,是8 0年代中期发展起来的一种体外扩增特异DNA片段的技术。此 法操作简便, 可在短时间内在试管中获得数百万个特异的目的D NA序列的拷贝,PCR技术虽然问世仅数年时间, 但它已迅速 渗透到分子生物学的各个领域,引起了生物技术发展的一次革命, 目前它在分子克隆, 目的基础检测,遗传病的基因诊断,法医学, 考古学等方面得到了广泛的应用。 PCR技术实际上是在模板DNA, 引物和4种脱氧核苷酸存在 的条件下依赖于DNA聚合酶的酶促合反应,PCR技术的特异 性取决于引物和模板DNA结合的特异性。 反应分三步:①变性 (denaturation);②退火(annealing);③延伸(ex tension), 反应过程见图
模板DNA在94℃条件下变性形成单链; 在55℃ 条件下根据目的基因两侧序列设计的引物分别与其同 源序列结合;70℃下在耐热性DNA聚合酶Taq 酶催 化下, 在4种dNTP存在条件下延伸形成双链。完成一 次循环。 接着又以新合成的DNA为模板进行同样反 应,如次往复循环30次,由于每次循环目标DNA 都以2n次幂扩增,30次循环后目的DNA的量增加1 06-7倍。成功的PCR反应要求反应有很好的特异 性,和相当的扩增效率。 要达此目的PCR反应要注 意以下问题:
模板DNA在94℃条件下变性形成单链; 在55℃ 条件下根据目的基因两侧序列设计的引物分别与其同 源序列结合;70℃下在耐热性DNA聚合酶Taq 酶催 化下, 在4种dNTP存在条件下延伸形成双链。完成一 次循环。 接着又以新合成的DNA为模板进行同样反 应,如次往复循环30次,由于每次循环目标DNA 都以2n次幂扩增,30次循环后目的DNA的量增加1 06-7倍。成功的PCR反应要求反应有很好的特异 性,和相当的扩增效率。 要达此目的PCR反应要注 意以下问题:
1.DNA模板:反应中DNA量在50ng~200 ng左右。且DNA纯度较高, 以增加反应特异性。 2.dNTP:反应体系中达100μM~200μM。 3.Mg2+:Mg2+是Taq酶的辅基浓度在2.0mM左右, 浓度太低Taq酶活力降低;太高反应特异性降低。 4.引物:根据目的基因两侧特定序列设计。引物约 20碱基左右;G+C含量在40 %-70%之间;引物内 部不能有回该序列;引物3’端不能互补。 5.Taq酶:它是从嗜热杆菌中提取的耐热性DNA聚 合酶,在95℃时30分钟还有50%活力
1.DNA模板:反应中DNA量在50ng~200 ng左右。且DNA纯度较高, 以增加反应特异性。 2.dNTP:反应体系中达100μM~200μM。 3.Mg2+:Mg2+是Taq酶的辅基浓度在2.0mM左右, 浓度太低Taq酶活力降低;太高反应特异性降低。 4.引物:根据目的基因两侧特定序列设计。引物约 20碱基左右;G+C含量在40 %-70%之间;引物内 部不能有回该序列;引物3’端不能互补。 5.Taq酶:它是从嗜热杆菌中提取的耐热性DNA聚 合酶,在95℃时30分钟还有50%活力
6.变性温度:在93~95℃之间使模板充分变性。 7.复性温度:55℃左右,此温度选择是根据模板 和引物配对结合强弱而定, 它是反应特异性的决定因 素。 8.延伸温度:70~72℃左右,为Taq酶最适反应 温度
6.变性温度:在93~95℃之间使模板充分变性。 7.复性温度:55℃左右,此温度选择是根据模板 和引物配对结合强弱而定, 它是反应特异性的决定因 素。 8.延伸温度:70~72℃左右,为Taq酶最适反应 温度
二.实验试剂及仪器 10×buffer: 500mM KCl 100mM Tris-HCl (pH9.0) 0.1% 明胶 1% TritonX-100 MgCl2 2.5mM 4×dNTP: 1mM 引物:TGGCCGAGCTG 5.0uM 模板: 20ng/μl Taq酶: 5u/μl PCR仪,凝胶成像系统,电泳系统
二.实验试剂及仪器 10×buffer: 500mM KCl 100mM Tris-HCl (pH9.0) 0.1% 明胶 1% TritonX-100 MgCl2 2.5mM 4×dNTP: 1mM 引物:TGGCCGAGCTG 5.0uM 模板: 20ng/μl Taq酶: 5u/μl PCR仪,凝胶成像系统,电泳系统
三. 实验方法 1.向无菌的500μl Eppendorf管中依次加入以下溶液。 反应物 体积 10×buffer 2.5μl 4×dNTP(1mM) 2.5μl MgCl2 (25mM) 2.5μl 无菌水 10.5μl Taq酶 (1U/ul) 1μl 引物 2μl 模板DNA (20ng) 4μl 总体积 25μl
三. 实验方法 1.向无菌的500μl Eppendorf管中依次加入以下溶液。 反应物 体积 10×buffer 2.5μl 4×dNTP(1mM) 2.5μl MgCl2 (25mM) 2.5μl 无菌水 10.5μl Taq酶 (1U/ul) 1μl 引物 2μl 模板DNA (20ng) 4μl 总体积 25μl
2.反应体系混匀,离心 3.在PCR仪上按以下方式循环 94℃变性 1分钟 36℃退火 1分钟 72℃延伸 2分钟 经过40个循环 4.72℃延伸反应7分钟。 5.取20μl反应液加4μl Loading buffer在 6.1.5%琼脂糖凝胶上120伏,电泳2小时。 7. 在凝胶成像系统上观察记录实验结
2.反应体系混匀,离心 3.在PCR仪上按以下方式循环 94℃变性 1分钟 36℃退火 1分钟 72℃延伸 2分钟 经过40个循环 4.72℃延伸反应7分钟。 5.取20μl反应液加4μl Loading buffer在 6.1.5%琼脂糖凝胶上120伏,电泳2小时。 7. 在凝胶成像系统上观察记录实验结
四. 结果分析 1.记录实验结果,并估测PCR扩增 产物分子量。 问题与讨论: 1.简述PCR基本原理 2.进行一次成功的PCR反应顺注意 哪些问题
四. 结果分析 1.记录实验结果,并估测PCR扩增 产物分子量。 问题与讨论: 1.简述PCR基本原理 2.进行一次成功的PCR反应顺注意 哪些问题