Chapter 9 Classification and identification of microbes 第九章 微生物的分类和鉴定
Chapter 9 Classification and identification of microbes 第九章 微生物的分类和鉴定
微生物的分类和鉴定 定义：按微生物的亲缘把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分 类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名
定义：按微生物的亲缘把它们安排成 条理清楚的各种分类单元或分 类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名 微生物的分类和鉴定
第一节 通用分类单元 种以上的系统分类单元 界Kingdom 门Phylum(或Division)一亚门 纲Class一亚纲 超目 目Order一亚目 科Family一一亚科 一一族 亚族 属Genus 种Species
第一节 通用分类单元 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species
一、种的概念 定义：种是一个基本分类单位，是一大群表 型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与 同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个 典型菌株作为具体标本，它就是该种的模 式种。 新种：sp.nov.或nov.sp.,新被鉴定的种发 表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新 种发表前应将其模式菌株的培养物存放在 一个永久性的保藏机构，并应允许人们从 中取得
一、种的概念 定义：种是一个基本分类单位，是一大群表 型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与 同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个 典型菌株作为具体标本，它就是该种的模 式种。 新种： sp.nov.或nov. sp.，新被鉴定的种发 表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新 种发表前应将其模式菌株的培养物存放在 一个永久性的保藏机构，并应允许人们从 中取得
二、微生物的命名 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按 照《国际细菌命名法规》命名的国际学 术界公认，并通用的名称。 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人） +现名定名人和现名定名年份 规定与常识：属名应大写首字母、单数、 可以组合外而成。种的加词代表一个种 的次要特征，首字小写
二、微生物的命名 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按 照《国际细菌命名法规》命名的国际学 术界公认，并通用的名称。 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人） +现名定名人和现名定名年份 规定与常识：属名应大写首字母、单数、 可以组合外而成。种的加词代表一个种 的次要特征，首字小写
微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉—— 粗糙脉孢霉 绿脓杆菌 铜绿假单胞菌 ÷学名一是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员会拟 定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名 有双名法和三名法两种。 ①双名法： 学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份 必要，用斜体表示可省略，用正体字 “属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写，表示 微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科学家命名。 种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等
微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉———粗糙脉孢霉 绿脓杆菌———铜绿假单胞菌 ❖学名—是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员会拟 定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名 有双名法和三名法两种。 ①双名法： 学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份 必要，用斜体表示 可省略，用正体字 ❖属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写，表示 微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科学家命名。 ❖种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等
例：大肠埃希氏杆菌 Escherichia coli (Migula)Castellani et Chalmers 1919 金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 ·当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未 定种名)时，可在属名后加sp.或ssp.(分别代表species 缩写的单数和复数形式) 例如：Saccharomyces sp. 表示酵母菌属中的一个种
例：大肠埃希氏杆菌 Escherichia coli （Migula）Castellani et Chalmers 1919 金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 ❖ 当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未 定种名）时，可在属名后加sp.或ssp.（分别代表species 缩写的单数和复数形式） 例如：Saccharomyces sp. 表示酵母菌属中的一个种
冬菌株名称一在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如： Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica Bacillus subtilis BF7658 BF=北纺 Clostridiumacetobutylicum ATCC824丙酮丁醇梭菌 ATCC=American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心 冬当文章中前面已出现过某学名时，后面的可将其属名缩写成1~3个字母。 如：Escherichia coli可缩写成E.coli Staphylococcus aureus可缩写成S.aureus ②三名法：用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个subsp.,然后再 附上亚种名称（斜排体)。如： Bacillus thuringiensis subsp.galleria 苏云金芽孢杆菌腊螟亚种
❖菌株名称——在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如： Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica Bacillus subtilisBF7658 BF=北纺 Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌 ATCC ＝American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心 ❖当文章中前面已出现过某学名时，后面的可将其属名缩写成1~3个字母。 如：Escherichia coli 可缩写成E. coli Staphylococcus aureus可缩写成S. aureus ②三名法：用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个subsp.，然后再 附上亚种名称（斜排体）。如： Bacillus thuringiensissubsp. galleria 苏云金芽孢杆菌腊螟亚种
三、亚种以下的分类单元 亚种（subspecies): 种的进一步细分，一般指其某一民而稳定的特征与模式 中不同的种常在种名、署名的加词后写上subsp.然后再 写具体亚种的加词； 变种(variety): 容易引起混乱； 型(form) : 使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现已作废； 类群（group): 没有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生物； 菌株(strain): 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体极 其一切后代；实际上是一个微生物达到遗传性纯的标志
三、亚种以下的分类单元 亚种（subspecies）： 种的进一步细分，一般指其某一民而稳定的特征与模式 中不同的种常在种名、署名的加词后写上subsp.然后再 写具体亚种的加词； 变种（ variety）： 容易引起混乱； 型（form）： 使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现已作废； 类群（group）： 没有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生物； 菌株（strain）： 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体极 其一切后代；实际上是一个微生物 达到遗传性纯的标志
第二节生物在自然界的地位 ·生物的界级分类学说：是在认识发展过程中存在 的对生物分类的不同阶段的不同观点。 。 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、 六界系统和三原界系统 ·三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和 L.Margulis提出的。 ·所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路 线，就形成了三个原界：古细菌原界 (Archaebacter)、真细菌原界、真核生物原界 ·提出了内共生学说，主要是Margulis的贡献
第二节 生物在自然界的地位 • 生物的界级分类学说：是在认识发展过程中存在 的对生物分类的不同阶段的不同观点。 • 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、 六界系统和三原界系统 • 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和 L.Margulis提出的。 • 所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路 线，就形成了三个原界：古细菌原界 （Archaebacter）、真细菌原界、真核生物原界 • 提出了内共生学说，主要是Margulis的贡献