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南京农业大学:《微生物资源与分类学》课程教学大纲

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生命科学学院本科课程教学大纲 《微生物资源与分类学》教学大纲 一、基本信息 课程名称 微生物资源与分类学 课程编号0330 英文名称 专业基础理 学时36 中:理论学 课程类型 生物科专业三年 学分2 预修课程微生物学 适用对象 微生物是地球上生物多样性最为丰富的资源。《微生物资源与分类学》是关于微生物 资源的种类和分布、合理开发」 用和右效保护相结 1)微生物资源部分着重研究微生我 这的轴米 微生物资在农业 工业、环保、科研等领域的应用,研究微生物资源合理利用的战略 ,所究微生物资 源的有效保护措施等。 课程简介 (2)分类学部分是框括有关微生物学的成果而建立的,是实践性最强的微生物学 支。重点在于系统佩明微生物分类学的基本知识和原理、分类方法,介绍常用分类系统及 依据、各代表类群」 “原本山川,极命草木”。作为前期课程的延续,《微生物资源与分类学》,将拓宽学 生对微生物资源多样性的认知,及微生物为人类提供广泛而大量的未开发资源方面所起的 作用。 二、教学目标及任务 本课程是生物科学专业、理科基地本科生三年级的专业基础选修课,在专业人才培养方案中位于课程设置的 专业教版块 酒过本误程学习,塑求学生堂操微生物资分布及其应用的基本知识。堂把微生物分举的基础系统及微生物 分类学的基本原理,技术和方法,在与前期课程《微生物学》相联系的基础之上,提高学生的科学思维能力。通 过微生物资源开发面临的问愿及突破途径的介绍,锻炼学生发现问愿、思考问愿和解决实践生产中的实际问愿的 能力。拓宽学生的视野,了解微生物资源分类学的发展及其对人类现代生活的影响,提高综合素质。 三、学时分配 教学课时分配 章节内容 讲 实验 合计 微生物资源的种类及分 农业 上的应 上的用 第三骨 资源微生物在医药 第四章 资源微生物在环境保护上的应用 弟五 资源微生物在科研实践上的应用 第六章 微生物资源开发利用 第七章 微生物进化、系统发生和分类学(总论) 第八章 古菌的分类 第九章 真细菌的分类 第十章真核微生物的分类 第十一章病毒的分类 复习 合计 36 36 193

生命科学学院本科课程教学大纲 193 《微生物资源与分类学》教学大纲 一、基本信息 课程名称 微生物资源与分类学 课程编号 BIOL3307 英文名称 Resources and Classification of Microorganisms 课程类型 专业基础课 学 时 36 其中:理论学时 36 实验学时 实践学时 学 分 2 预修课程 微生物学 适用对象 生物科学专业三年级 理科基地三年级 课程简介 微生物是地球上生物多样性最为丰富的资源。《微生物资源与分类学》是关于微生物 资源的种类和分布、合理开发、利用和有效保护相结合的科学,分为两个部分: (1)微生物资源部分着重研究微生物资源的种类、分布规律,研究微生物资源在农业、 工业、环保、科研等领域的应用,研究微生物资源合理利用的战略和策略,研究微生物资 源的有效保护措施等。 (2)分类学部分是概括有关微生物学的成果而建立的,是实践性最强的微生物学分 支。重点在于系统阐明微生物分类学的基本知识和原理、分类方法。介绍常用分类系统及 依据、各代表类群。 “原本山川,极命草木”。作为前期课程的延续,《微生物资源与分类学》,将拓宽学 生对微生物资源多样性的认知,及微生物为人类提供广泛而大量的未开发资源方面所起的 作用。 二、教学目标及任务 本课程是生物科学专业、理科基地本科生三年级的专业基础选修课,在专业人才培养方案中位于课程设置的 “专业教育”版块。 通过本课程学习,要求学生掌握微生物资源分布及其应用的基本知识。掌握微生物分类的基础系统及微生物 分类学的基本原理、技术和方法。在与前期课程《微生物学》相联系的基础之上,提高学生的科学思维能力。通 过微生物资源开发面临的问题及突破途径的介绍,锻炼学生发现问题、思考问题和解决实践生产中的实际问题的 能力。拓宽学生的视野,了解微生物资源分类学的发展及其对人类现代生活的影响,提高综合素质。 三、学时分配 教学课时分配 章 节 章节内容 讲课 实验 实践 合计 绪 论 微生物资源的种类及分布 2 2 第一章 资源微生物在农业上的应用 3 3 第二章 资源微生物在工业上的应用 3 3 第三章 资源微生物在医药上的应用 3 3 第四章 资源微生物在环境保护上的应用 3 3 第五章 资源微生物在科研实践上的应用 2 2 第六章 微生物资源开发利用 4 4 第七章 微生物进化、系统发生和分类学(总论) 3 3 第八章 古菌的分类 2 2 第九章 真细菌的分类 4 4 第十章 真核微生物的分类 4 4 第十一章 病毒的分类 2 2 复 习 1 1 合 计 36 36

生命科学学院本科误程教学大纲 四、教学内容及教学要求 绪论微生物资源的种类及分布 第一节微生物是一类资源 1.微生物资源的定义 2.微生物资源的贡献 习题要点:微生物资源的定义 第二节微生物资源的种类 1,微生物资源的种 2.微生物资源的特点 源相比。微生物变源所验有的特 的分希 了银”。尚生物咨箱的料李 “理解”,微生物资与环境的关系 “拿握:微生物资源区分于动植物资源的特征】 第一章资源微生物在农业上的应用 第一节徽生物肥科 】。微生物即划的种类 2。微生物肥料的作用 3。几种重要的微生物制剂肥料 习题要点:微生物肥料的作用 第二节微生物饲料 1.单细胞蛋白和菌体蛋白饲料 2.固态发酵饲料 习题要点:单细胞蛋白的定义 第三节徽生物农药 1.微生物余虫 2,微生物杀南剂 Bt研究和 利用的策 农业生产中常用的各类微生物 理解 物在北,生 应买取些措速来推动微生物在绿色农产品生产中的应用 第二章资源微生物在工业上的应用 第一节工业展的生产 1.微生物酶及其应用 2.工业阵的生产 习题要点:微生物南及其应用 194

生命科学学院本科课程教学大纲 194 四、教学内容及教学要求 绪论微生物资源的种类及分布 第一节 微生物是一类资源 1.微生物资源的定义 2.微生物资源的贡献 习题要点:微生物资源的定义 第二节 微生物资源的种类 1.微生物资源的种类 2.微生物资源的特点 习题要点:与其他生物资源相比,微生物资源所独有的特点 第三节 微生物资源的分布 1.土壤微生物资源 2.极端环境微生物资源 3.生物环境中的微生物资源 习题要点:微生物资源与环境的关系 本章重点、难点:微生物资源的种类及分布 本章教学要求: “了解”:微生物资源的概念。 “理解”:微生物资源与环境的关系。 “掌握”:微生物资源区分于动植物资源的特征。 第一章 资源微生物在农业上的应用 第一节 微生物肥料 1.微生物肥料的种类 2.微生物肥料的作用 3.几种重要的微生物制剂肥料 习题要点:微生物肥料的作用 第二节 微生物饲料 1.单细胞蛋白和菌体蛋白饲料 2.固态发酵饲料 习题要点:单细胞蛋白的定义 第三节 微生物农药 1.微生物杀虫剂 2.微生物杀菌剂 3.微生物除草剂 4.植物生长调节剂 习题要点:Bt 研究和利用的策略 本章重点、难点:在农业环境保护中,微生物可以从减少农药、化肥等污染物投入和消除已投入污染物两个方面 改善农业环境,从而成为现代绿色农业生产的重要支柱技术。 本章教学要求: “了解”:农业生产中常用的各类微生物。 “理解”:微生物在农业生产中的用途。 “掌握”:应采取哪些措施来推动微生物在绿色农产品生产中的应用。 第二章 资源微生物在工业上的应用 第一节 工业酶的生产 1.微生物酶及其应用 2.工业酶的生产 习题要点:微生物酶及其应用

生命科学学院本科课程教学大纲 物利用生产 的微生物 2食品安 食品、发产物利用生产中的常用微生物 第三节化工、能源微生物 2.乳酸、乙酸等化工微生物 习题要点:能源微生物及其应用 本章重点、难点:工业酶的种类及生产 本章教学要求: “了醒”.工业生立中常用的客米微生物 “理解”:微生物在工业生产中的用途 “掌握”:应采取哪些措施来推动微生物在工业生产中的应用。 微生物能源的生产原理及应用 第三章资源微生物在医药上的应用 第一节抗生素 1,天然抗生素 2.半合成抗生意 习题要点:抗生素的发展历史 第二节其他生物活性物质 1,维生素 2.微生物活性多糖 中制剂 适用粒 糖 2。药用微生物研究发展的趋势 习要占,药用生物研究发据的趋 本章重点、难点:抗生素的作用机理 本童教学要求: “了解”:微生物药物的概念 理解”。拉生素作用的主要机理 章握”:药用微生物研究发展的趋势 第四章资源微生物在环境保护上的应用 第一节固体魔弃物的处理 1,固体废弃物的高温堆肥技术 2。好氧堆肥的隙理及微生物学过程 3.有机废弃物的微生物饲料化处理 习题要点:好氧堆肥的原理 第二节液体废弃物的处理 1,有机污水的水质指标 2,活性污泥 3.生物膜 4.厌氧生物处理 习题要点:活性污泥的定义 195

生命科学学院本科课程教学大纲 195 第二节 食品、发酵工业上的利用 1.食品、发酵产物利用生产中的微生物 2.食品安全 习题要点:食品、发酵产物利用生产中的常用微生物 第三节 化工、能源微生物 1.能源微生物 2.乳酸、乙酸等化工微生物 习题要点:能源微生物及其应用 本章重点、难点:工业酶的种类及生产 本章教学要求: “了解”:工业生产中常用的各类微生物。 “理解”:微生物在工业生产中的用途。 “掌握”:应采取哪些措施来推动微生物在工业生产中的应用。 微生物能源的生产原理及应用 第三章 资源微生物在医药上的应用 第一节 抗生素 1.天然抗生素 2.半合成抗生素 习题要点:抗生素的发展历史 第二节 其他生物活性物质 1.维生素 2.微生物活性多糖 习题要点: 第三节 酶抑制剂 1.酶抑制剂及适用症 2.实例:糖尿病 习题要点:酶抑制剂的定义 第四节 微生物药物发展趋势 1.微生物药物的来源及开发 2.药用微生物研究发展的趋势 习题要点:药用微生物研究发展的趋势 本章重点、难点:抗生素的作用机理 本章教学要求: “了解”:微生物药物的概念。 “理解”:抗生素作用的主要机理。 “掌握”:药用微生物研究发展的趋势。 第四章 资源微生物在环境保护上的应用 第一节 固体废弃物的处理 1.固体废弃物的高温堆肥技术 2.好氧堆肥的原理及微生物学过程 3.有机废弃物的微生物饲料化处理 习题要点:好氧堆肥的原理 第二节 液体废弃物的处理 1.有机污水的水质指标 2.活性污泥 3.生物膜法 4.厌氧生物处理 习题要点:活性污泥的定义

生命科学学院本科误程教学大纲 第三节生物检测 发光细南发光 制试验 速检测 速检 本教学求, 了解”:环保产业中常用的各类微生物】 “理解微生物在环境保护产业中的用途 “零握”:应采取哪些措施来推动微生物在生态建设中的应用。 第五章资源微生物在科研实践上的应用 第一节科研模式微生物 1。科研模式微牛物的历中 2.科研模式微生物的类群 习题要点:主要的科研模式微生物 第二节科研模式微生物的贡献 1.在基础研究中的贡献 2,在应用研究中的页献 习题要点:科研模式微生物的贡献 第三节徽生物基因资源 【,微生物基因组研究极其意义 2.微生物 因组的研究万视 3.微生物基因资源的开发利用 习题要点 科研模式微生物的贡献 本章重点 点:微生物基因资源的开发利用 本草数 要求 模式微生物 或中的作用 第 第一节徽2 2微生物资源开发利用的基本程序 习占,尚生物资开发利用的其木程序 第二节开发利用微生物资源的新技术 1,微生物天然产物的高通量筛选 )发特新结求 3组合生物合成特术 习题要点:微生物天然产物的高通量箱透 第三节资源微生物的分离与保存 1.分离资源微生物的基本原 2,各类微生物的分离程序 3.资源微生物的保存 习题要点:各类微生物的分高程序 第四节微生物资源的保护 1.保护微生物资源的必要性和紧迫性 2.保护微生物资源的近 习题要点:保护微生物资源的措施 196

生命科学学院本科课程教学大纲 196 第三节 微生物检测 1.Ames 试验技术 2.发光细菌发光抑制试验 3.果蔬产品上的微生物快速检测 习题要点:果蔬产品上的微生物快速检测 本章重点、难点:液体废弃物的微生物处理 本章教学要求: “了解”:环保产业中常用的各类微生物。 “理解”:微生物在环境保护产业中的用途。 “掌握”:应采取哪些措施来推动微生物在生态建设中的应用。 第五章 资源微生物在科研实践上的应用 第一节 科研模式微生物 1.科研模式微生物的历史 2.科研模式微生物的类群 习题要点:主要的科研模式微生物 第二节 科研模式微生物的贡献 1.在基础研究中的贡献 2.在应用研究中的贡献 习题要点:科研模式微生物的贡献 第三节 微生物基因资源 1.微生物基因组研究极其意义 2.微生物基因组的研究方法 3.微生物基因资源的开发利用 习题要点:科研模式微生物的贡献 本章重点、难点:微生物基因资源的开发利用 本章教学要求: “了解”:主要的科研模式微生物。 “理解”:科研模式微生物在科研实践中的作用。 “掌握”:模式微生物之所以成为“模式”的特点,及作为工具、作为模板如何扩大在科研中的服务范围。 第六章 微生物资源开发利用 第一节 微生物资源开发利用的战略与策略 1.微生物资源开发利用的战略 2.微生物资源开发利用的基本程序 习题要点:微生物资源开发利用的基本程序 第二节 开发利用微生物资源的新技术 1.微生物天然产物的高通量筛选 2.发酵新技术 3.组合生物合成技术 习题要点:微生物天然产物的高通量筛选 第三节 资源微生物的分离与保存 1.分离资源微生物的基本原则 2.各类微生物的分离程序 3.资源微生物的保存 习题要点:各类微生物的分离程序 第四节 微生物资源的保护 1.保护微生物资源的必要性和紧迫性 2.保护微生物资源的措施 习题要点:保护微生物资源的措施

生命科学学院本科课程教学大纲 第五节问与展 2。微生物药物开发面 本章重点、难点:微生物资源开发利用的流程 本章数学要求: “了解”:微生物资源开发利用的战略与策略。 “理解”:微生物资源与其他资源一样。需要保护 堂程”,微生物资酒开发利用的流程。面临的问理及突破占 第七章微生物进化、系统发生和分类学(总论) 第一节分类单元及命名 1.微生物分类体系 2,微生物的命名 习题要点:双名法:学名的标准格式 第二节徽生物的分类系统 I,Bergey氏分类系统 2.真菌字典 习塑要点:细菌和真菌的分类系统 第三节徽生物的整定 1,微生物鉴定的基本依据 2. 鉴定 本章数学 应用 第八章古生菌的分类 第一节古生 元系统的提出及演变 2吉生菌的特性 3.古生菌的分布 习题要点:三元界系统中古生菌的地行 第二节古生菌的分类 1士生苗的分米系结 2.各种极端环境下的古生菌类群 习题要点:古生菌分类的依据 本章凰点、难点:古生荫的一般特性和分类 本章散学要求: “了解”: :元界系统 “理解:古生菌的分类地位及起源 掌握”:古生菌的分布特点:应用古生菌的原理 第九章真细菌的分类 第一节真细菌的分类历史及方法 1.真细菌的分类历史 2真细菌的分类方 3专感:细菌的分子生物学分类方法 习避要点:细菌的分子生物学分类方法 19

生命科学学院本科课程教学大纲 197 第五节 问题与展望 1.开发利用已保存的微生物资源 2.微生物药物开发面临的问题 3.如何突破限制微生物药物研发的瓶颈 习题要点:微生物药物开发面临的问题及突破点 本章重点、难点:微生物资源开发利用的流程 本章教学要求: “了解”:微生物资源开发利用的战略与策略。 “理解”:微生物资源与其他资源一样,需要保护。 “掌握”:微生物资源开发利用的流程、面临的问题及突破点。 第七章 微生物进化、系统发生和分类学(总论) 第一节 分类单元及命名 1.微生物分类体系 2.微生物的命名 习题要点:双名法;学名的标准格式 第二节 微生物的分类系统 1.Bergey 氏分类系统 2.真菌字典 习题要点:细菌和真菌的分类系统 第三节 微生物的鉴定 1.微生物鉴定的基本依据 2.微生物鉴定技术和方法 习题要点:鉴定微生物的依据 本章重点、难点:双名法;“种”的概念 本章教学要求: “了解”:菌株、种及命名模式。 “理解”:系统发育在分类中的应用。 “掌握”:常见的微生物鉴定技术。 第八章 古生菌的分类 第一节 古生菌的特性 1.三元界系统的提出及演变 2.古生菌的特性 3.古生菌的分布 习题要点:三元界系统中古生菌的地位 第二节 古生菌的分类 1.古生菌的分类系统 2.各种极端环境下的古生菌类群 习题要点:古生菌分类的依据 本章重点、难点:古生菌的一般特性和分类 本章教学要求: “了解”:三元界系统。 “理解”:古生菌的分类地位及起源。 “掌握”:古生菌的分布特点;应用古生菌的原理。 第九章 真细菌的分类 第一节 真细菌的分类历史及方法 1.真细菌的分类历史 2.真细菌的分类方法 3.专题:细菌的分子生物学分类方法 习题要点:细菌的分子生物学分类方法

生命科学学院本科误程教学大纲 第二节革兰氏阳性分类群介 生细菌 氏阳性细菌 其他 本章重点、难点:链霉菌成员的兴衰 本章教学罩求, “了解”:细菌分类系统 “理解”:真增分类的依据,直菌分类中存在人为因素 “掌握"”:常见的细菌鉴定技术及相关平台。 第十音直核微生物的分举 第一节真曹的分类历史及方法 1,直菌的分类历史 2,真菌的分类方法 习题要点:真菌的分类方法 第二节真菌的分类 1.真菌分类系统 2.直菌代表类 习题要点:真南各个纲 第三节藻类和原生动物的分类 1藻类分类系统 代衣 2,原生动物分类系统及代 类耕 常见的藻类及原 本 动物类群 、难点:真菌的分类的依 本率数学 直菌各个纲的名称 菌分类中存在人为因素 第十一章病毒的 1病毒分类的历史 2。灾毒分举依据 习题要点:病毒分类的依据 第二节病毒的分类 1.病毒分类的系统 2病毒名个类雅及曲型代表 习题要点:分类系统修订的要点 本章重点、难点:病毒的分类系统及依据 本章救学要求: “了解"”:病毒分类的依据。 “理解":病毒分类从依据宿主类型到核酸性质的演化过程。 “掌握:常见的病毒鉴定技术。 五、考核方式及要求 新核方式: 出勤*:占总成绩的10% 小测验:闭卷,2次,20%,第一次,覆盖资源部分,第二次,针对分类学部分 198

生命科学学院本科课程教学大纲 198 第二节 革兰氏阳性分类群介绍 习题要点:典型的革兰氏阳性细菌 第三节 革兰氏阴性分类群介绍 习题要点:典型的革兰氏阳性细菌 第四节 放线菌分类 1.链霉菌 2.其他 本章重点、难点:链霉菌成员的兴衰 本章教学要求: “了解”:细菌分类系统。 “理解”:真菌分类的依据,真菌分类中存在人为因素。 “掌握”:常见的细菌鉴定技术及相关平台。 第十章 真核微生物的分类 第一节 真菌的分类历史及方法 1.真菌的分类历史 2.真菌的分类方法 习题要点:真菌的分类方法 第二节 真菌的分类 1.真菌分类系统 2.真菌代表类群 习题要点:真菌各个纲 第三节 藻类和原生动物的分类 1.藻类分类系统及代表类群 2.原生动物分类系统及代表类群 习题要点:常见的藻类及原生动物类群 本章重点、难点:真菌的分类的依据 本章教学要求: “了解”:真菌各个纲的名称。 “理解”:真菌分类的依据,真菌分类中存在人为因素。 “掌握”:常见的真菌类群及其贡献。 第十一章 病毒的分类 第一节 病毒的分类历史及方法 1.病毒分类的历史 2.病毒分类依据 习题要点:病毒分类的依据 第二节 病毒的分类 1.病毒分类的系统 2.病毒各个类群及典型代表 习题要点:分类系统修订的要点 本章重点、难点:病毒的分类系统及依据 本章教学要求: “了解”:病毒分类的依据。 “理解”:病毒分类从依据宿主类型到核酸性质的演化过程。 “掌握”:常见的病毒鉴定技术。 五、考核方式及要求 考核方式: 出勤率:占总成绩的 10% 小测验:闭卷,2 次,20%。第一次,覆盖资源部分。第二次,针对分类学部分

生命科学学院本科课程教学大纲 期末考试:闭卷,70%。侧重考核学生利用所学知识综合分析各个微生物类群分类的依据,从微生物资源的 角度解决生产实践中的实际问题。 六、推荐教材及教学参考书 暂无合适的已出版教材,自建课程网站作为电子教材。 参考书: 《微生物资源学》第二版,徐丽华等编著,科学出版社,2010年,标准书号:ISBN978-7-03-029002-1。 《Brock微生物生物学》,M.T.马迪根等编著,Pearson Education出版社,2010年,标准书号:978-0321649638。 《细菌分类学》,杨苏声主编,中国农业大学出版社,1997年,标准书号:ISBN7-81002-858-8 网络资源: American Society for Microbiology(美国微生物学会) 简介:美国微生物学会是全球历史最悠久且最大的生命科学会员组织。美国微生物学会的期刊是微生物学领域最 杰出的出版物,刊载基础及临床微生物学领域最新且权威的信息。该学会的期刊引用率极高且具有很大知名度, 其期刊引用量占所有微生物学引用的近43%. 地址:htp:www.asm.org ICTVdB The Universal Virus Database of the International Committee on Taxonomy of Viruses 网址:htp://ictvdb.mirror.ac.cnl National Center for Biotechnology Information 简介:该网页列出了己完成和正在研究的微生物基因组,包括名称,信息量,研究单位,资金来源及发表在 何处等。已完成的基因组大部分可通过超链接进入该数据库进行查询。 网址:http:www.ncbi.nlm.nih.gov/ 七、说明 同期进行课程网站的建设。 大纲修订人:纪燕玲 大纲审定人:何琳燕 199

生命科学学院本科课程教学大纲 199 期末考试:闭卷,70%。侧重考核学生利用所学知识综合分析各个微生物类群分类的依据,从微生物资源的 角度解决生产实践中的实际问题。 六、推荐教材及教学参考书 暂无合适的已出版教材,自建课程网站作为电子教材。 参考书: 《微生物资源学》第二版,徐丽华等编著,科学出版社,2010 年,标准书号:ISBN 978-7-03-029002-1。 《Brock 微生物生物学》,M.T.马迪根等编著,Pearson Education 出版社,2010 年,标准书号:978-0321649638。 《细菌分类学》,杨苏声主编,中国农业大学出版社,1997 年,标准书号:ISBN 7-81002-858-8 网络资源: American Society for Microbiology(美国微生物学会) 简介:美国微生物学会是全球历史最悠久且最大的生命科学会员组织。美国微生物学会的期刊是微生物学领域最 杰出的出版物,刊载基础及临床微生物学领域最新且权威的信息。该学会的期刊引用率极高且具有很大知名度, 其期刊引用量占所有微生物学引用的近 43%。 地址:http://www.asm.org/ ICTVdB 简介:The Universal Virus Database of the International Committee on Taxonomy of Viruses 网址:http://ictvdb.mirror.ac.cn/ National Center for Biotechnology Information 简介:该网页列出了已完成和正在研究的微生物基因组,包括名称,信息量,研究单位,资金来源及发表在 何处等。已完成的基因组大部分可通过超链接进入该数据库进行查询。 网址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 七、说明 同期进行课程网站的建设。 大纲修订人:纪燕玲 大纲审定人:何琳燕

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