附录1:伯杰氏系统细菌学手册(第九版)纲要 伯杰氏系统细菌学手册( Bergey's Manual of Systematic Bacteriology)共分四卷。 第一卷(1984年):具有医学和商用价值的革兰氏阴性细菌。包括螺旋体,螺菌和弧菌, 氏阴性好氧和兼性好氧杆菌,革兰氏阴性的专性厌氧菌,革兰氏阴性好氧和厌氧球菌, 盐和硫还原细菌,立克次氏体,衣原体和枝原体。 第二卷(1986年):具医学和商用价值的革兰氏阳性细菌。包括革兰氏阳性球菌,革兰氏阳性 芽孢和非芽孢杆菌,分支细菌,非丝状放线菌 第三卷(1989年):剩余的革兰氏阴性细菌。趋光性、滑动、有鞘、出芽和有附器的细菌,蓝 细菌,自养菌和古细菌。 第四卷(1989年):丝状放线菌及相关细菌。 第一卷 第一节螺旋体 目1:螺旋体目 Spirochaetales 科1:螺旋体科 Spirochaetaceae 属1:螺旋体属 Spirochaeta 属2:脊螺旋体属 Cristispira 属3:密螺旋体属 Treponema 属4:疏螺旋体属 borrelia 科2:钩端螺旋体科 Leptospiraceae 属1:钩端螺旋体属 Leptospira 其它种类 白蚁和食木蟑螂后肠中螺旋体 第二节好氧或微好氧运动螺旋或弧菌状革兰氏阴性细菌 属:水生螺菌属 Aquaspirillum 属:螺菌属 Spirillum 属:氮螺菌属 Azospirillum 属:海洋螺菌属 Oceanospirillum 属:弯曲杆菌属 Campylobacter 属:蛭弧菌属 Bdellovibrio 属:吸血弧菌属 Vampirpvibrio 第三节非运动或偶见运动,革兰氏阴性弯曲细菌 科1:螺状菌科 Spirosomaceae 属1:螺状菌属 Spirosoma 属2:古字状菌属 Rubella 属3:交织杆菌属 Plectobacillus 其它属 属:微环菌属 Microcyclus 属:新月菌属 Meniscus 属:短弓菌属 Brachyurus 属:暗屈曲菌属 Pelosigma
附录 1:伯杰氏系统细菌学手册（第九版）纲要 伯杰氏系统细菌学手册（Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology）共分四卷。 第一卷(1984 年)：具有医学和商用价值的革兰氏阴性细菌。包括螺旋体，螺菌和弧菌，革兰 氏阴性好氧和兼性好氧杆菌，革兰氏阴性的专性厌氧菌，革兰氏阴性好氧和厌氧球菌，硫酸 盐和硫还原细菌，立克次氏体，衣原体和枝原体。 第二卷(1986 年)：具医学和商用价值的革兰氏阳性细菌。包括革兰氏阳性球菌，革兰氏阳性 芽孢和非芽孢杆菌，分支细菌，非丝状放线菌。 第三卷(1989 年)：剩余的革兰氏阴性细菌。趋光性、滑动、有鞘、出芽和有附器的细菌，蓝 细菌，自养菌和古细菌。 第四卷(1989 年)：丝状放线菌及相关细菌。 第一卷 第一节 螺旋体 目 1：螺旋体目 Spirochaetales 科 1：螺旋体科 Spirochaetaceae 属 1：螺旋体属 Spirochaeta 属 2：脊螺旋体属 Cristispira 属 3：密螺旋体属 Treponema 属 4：疏螺旋体属 Borrelia 科 2：钩端螺旋体科 Leptospiraceae 属 1：钩端螺旋体属 Leptospira 其它种类 白蚁和食木蟑螂后肠中螺旋体 第二节 好氧或微好氧,运动,螺旋或弧菌状革兰氏阴性细菌 属：水生螺菌属 Aquaspirillum 属：螺菌属 Spirillum 属：氮螺菌属 Azospirillum 属：海洋螺菌属 Oceanospirillum 属：弯曲杆菌属 Campylobacter 属：蛭弧菌属 Bdellovibrio 属：吸血弧菌属 Vampirovibrio 第三节 非运动(或偶见运动),革兰氏阴性弯曲细菌 科 1：螺状菌科 Spirosomaceae 属 1：螺状菌属 Spirosoma 属 2：古字状菌属 Runella 属 3：交织杆菌属 Plectobacillus 其它属 属：微环菌属 Microcyclus 属：新月菌属 Meniscus 属：短弓菌属 Brachyarcus 属：暗屈曲菌属 Pelosigma
第四节革兰氏阴性好氧杆菌和球菌 科1:假单胞菌科 Pseudomonadaceae 属1:假单胞菌属 Pseudomonas 属2:黄单胞菌属 Xanthomonas 属3:弗拉特氏菌属 frateuria 属4:动胶菌属 Zoogloea 科2:固氮菌科 Azotobacteraceae 属1:固氮菌属A= otobacter 属2:固氮单胞菌属A= monas 科3:根瘤菌科 Rhizobiaceae 属1:根瘤菌属 Rhizobium 属2:慢生根瘤菌属 Bradyrhizobium 属3:土壤杆菌属 Agrobacterium 属4:叶杆菌属 Phyllobacterium 科4:甲基球菌科 Methyl 属1:甲基球菌属 Methylococcus 属2:甲基单胞菌属 Methylomonas 科5:盐杆菌科 Halobacteriaceae 属1:盐杆菌属 Halobacterium 属2:盐球菌属 Halococcus 科6:醋杆菌科 Acetobacteraceae 属1:醋杆菌属 Acetobacter 属2:葡糖杆菌属 Gluconobacter 科7:军团菌科 Legionellaceae 属1:军团菌属 Legionella 科8:奈瑟氏球菌科 Neisseriaceae 属1:奈瑟氏球菌属 Neisseria 属2:莫拉氏菌属 Moraxella 属3:不动杆菌属 Acinetobacter 属4:金氏菌属 Kingella 其它属 属:拜叶林克氏菌属 Beijerinckii 属:德克斯氏菌属 Derxia 属:黄色杆菌属 Xanthobacter 属:栖热菌属 Thern 属:热微菌属 Thermomicpbiun 属:盐单胞菌属 Halomonas 属:交替单孢菌属 Alteromonas 属:黄杆菌属 Flavobacteriun 属:产碱杆菌属 alcaligenes 属:蛇形菌属 Serpens 属:紫色杆菌属 Janthinobacteriun 属:布鲁氏菌属 Bruce
第四节 革兰氏阴性好氧杆菌和球菌 科 1：假单胞菌科 Pseudomonadaceae 属 1：假单胞菌属 Pseudomonas 属 2：黄单胞菌属 Xanthomonas 属 3：弗拉特氏菌属 Frateuria 属 4：动胶菌属 Zoogloea 科 2：固氮菌科 Azotobacteraceae 属 1：固氮菌属 Azotobacter 属 2：固氮单胞菌属 Azomonas 科 3：根瘤菌科 Rhizobiaceae 属 1：根瘤菌属 Rhizobium 属 2：慢生根瘤菌属 Bradyrhizobium 属 3：土壤杆菌属 Agrobacterium 属 4：叶杆菌属 Phyllobacterium 科 4：甲基球菌科 Methylococcaceae 属 1：甲基球菌属 Methylococcus 属 2：甲基单胞菌属 Methylomonas 科 5：盐杆菌科 Halobacteriaceae 属 1：盐杆菌属 Halobacterium 属 2：盐球菌属 Halococcus 科 6：醋杆菌科 Acetobacteraceae 属 1：醋杆菌属 Acetobacter 属 2：葡糖杆菌属 Gluconobacter 科 7：军团菌科 Legionellaceae 属 1：军团菌属 Legionella 科 8：奈瑟氏球菌科 Neisseriaceae 属 1：奈瑟氏球菌属 Neisseria 属 2：莫拉氏菌属 Moraxella 属 3：不动杆菌属 Acinetobacter 属 4：金氏菌属 Kingella 其它属： 属：拜叶林克氏菌属 Beijerinckia 属：德克斯氏菌属 Derxia 属：黄色杆菌属 Xanthobacter 属：栖热菌属 Thermus 属：热微菌属 Thermomicrobium 属：盐单胞菌属 Halomonas 属：交替单孢菌属 Alteromonas 属：黄杆菌属 Flavobacterium 属：产碱杆菌属 Alcaligenes 属：蛇形菌属 Serpens 属：紫色杆菌属 Janthinobacterium 属：布鲁氏菌属 Brucella
属:博德特氏菌属 bordetella 属:弗郎西丝氏菌属 francisella 属:副球菌属 Paracoccus 属:俊片菌属 Lampropedia 第五节兼性厌氧革兰氏阴性杆菌 科1:肠杆菌科 Enterobacteriaceae 属1:埃希氏菌属 Escherichia 属2:志贺氏菌属 Shigella 属3:沙门氏菌属 Saimonella 属4:柠檬酸细菌属 Citrobacter 属5:克雷伯氏菌属 Klebsiella 属6:肠杆菌属 Enterobacter 属7:欧文氏菌属 Envinia 属8:沙雷氏菌属 serratia 属9:哈夫尼菌属 Hafnia 属10:爱德华氏菌属 edwardsiella 属11:变形菌属 Proteus 属12:普罗威登斯菌属 Providencia 属13:摩根氏菌属 Morganella 属14:耶尔森氏菌属 Yersinia 肠杆菌科的其它属 属:肥杆菌属 Obesumbacterium 属:致病杆菌属 Xenorhabdus 属:克吕沃尔氏菌属 Kluyvera 属:拉恩氏菌属 Rahnella 属:西地西菌属 Cedecea 属:塔特姆氏菌属 Tatumella 科2:弧菌科 Vibrionaceae 属1:弧菌属 Vibrio 属2:发光杆菌属 Photobacterium 属3:气单胞菌属 Aeromonas 属4:邻单胞菌属 Plesiomonas 科3:巴斯德菌科 Pasteurellaceae 属1:巴斯德杆菌属 Pasteurella 属2:嗜血菌属 Haemophilus 属3:放线杆菌属 Actinobacillus 其它属 属:发酵单胞菌属2 monona 属:色杆菌属 Chromobacterium 属:心杆菌属 Cardiobacterium 属:鞘杆菌属 Calymmatobacterium 属:加德纳氏菌属 gardnerella 属:艾肯氏菌属 eikenella
属：博德特氏菌属 Bordetella 属：弗郎西丝氏菌属 Francisella 属：副球菌属 Paracoccus 属：俊片菌属 Lampropedia 第五节 兼性厌氧革兰氏阴性杆菌 科 1：肠杆菌科 Enterobacteriaceae 属 1：埃希氏菌属 Escherichia 属 2：志贺氏菌属 Shigella 属 3：沙门氏菌属 Salmonella 属 4：柠檬酸细菌属 Citrobacter 属 5：克雷伯氏菌属 Klebsiella 属 6：肠杆菌属 Enterobacter 属 7：欧文氏菌属 Erwinia 属 8：沙雷氏菌属 Serratia 属 9：哈夫尼菌属 Hafnia 属 10：爱德华氏菌属 Edwardsiella 属 11：变形菌属 Proteus 属 12：普罗威登斯菌属 Providencia 属 13：摩根氏菌属 Morganella 属 14：耶尔森氏菌属 Yersinia 肠杆菌科的其它属 属：肥杆菌属 Obesumbacterium 属：致病杆菌属 Xenorhabdus 属：克吕沃尔氏菌属 Kluyvera 属：拉恩氏菌属 Rahnella 属：西地西菌属 Cedecea 属：塔特姆氏菌属 Tatumella 科 2: 弧菌科 Vibrionaceae 属 1：弧菌属 Vibrio 属 2：发光杆菌属 Photobacterium 属 3：气单胞菌属 Aeromonas 属 4：邻单胞菌属 Plesiomonas 科 3：巴斯德菌科 Pasteurellaceae 属 1：巴斯德杆菌属 Pasteurella 属 2：嗜血菌属 Haemophilus 属 3：放线杆菌属 Actinobacillus 其它属 属：发酵单胞菌属 Zymomonas 属：色杆菌属 Chromobacterium 属：心杆菌属 Cardiobacterium 属：鞘杆菌属 Calymmatobacterium 属：加德纳氏菌属 Gardnerella 属：艾肯氏菌属 Eikenella
属:链杆菌属 Streptobacilli 第六节厌氧革兰氏阴性直、弯和螺杆菌 科1:拟杆菌科 Bacteroidaceae 属1:拟杆菌属 Bacteroides 属2:梭杆菌属 Fusobacterium 属3:纤毛菌属 Leptotrichia 属4:丁酸弧菌属 Butyrivibrio 属5:琥珀酸单胞菌属 Succinimona 属6:琥珀酸弧菌属 Succinivibrio 属7:厌氧螺菌属 Anaerpbiospirillum 属8:沃林氏菌属 wolinella 属9:月形单胞菌属 Selenomonas 属10:厌氧弧菌属 Anaerovibrio 属11:梳状菌属 Pectinatus 属12:醋弧菌属 A cetivibrio 属13:毛螺菌属 Lachnospira 第七节异化型硫酸盐或硫还原细菌 属:脱硫单孢菌属 Desulfummonas 属:脱硫弧菌属 Desulfovibrio 属:脱硫单胞菌属 Desulfomonas 属:脱硫球菌属 Desulfococcus 属:脱硫杆菌属 Desulfobacter 属:脱硫叶菌属 Desulfobulbus 属:脱硫八叠球菌属 Desulfosarcina 第八节厌氧革兰氏阴性球菌 科1:韦荣氏球菌科 Veillonellaceae 属1:韦荣氏球菌属 Veillonella 属2:氨基酸球菌属 acidaminococcus 属3:巨球形菌属 Megasphaera 第九节立克次氏体和衣原体 目1:立克次氏体目 Rickettsiales 科1:立克次氏体科 Rickettsiaceae 族1:立克次氏体族 Rickettsiae 属1:立克次氏体属 Rickettsia 属2:罗卡利马氏体菌属 Rochalimaea 属3:考克斯体菌属 Coxiella 族2:埃里希氏体族 Ehrlichia 属4:埃里希氏体属 Ehrlichia 属5:考德里氏体属 cowdria 属6:新立克次氏体属 Neorickettsia
属：链杆菌属 Streptobacillus 第六节 厌氧革兰氏阴性直、弯和螺杆菌 科 1：拟杆菌科 Bacteroidaceae 属 1：拟杆菌属 Bacteroides 属 2：梭杆菌属 Fusobacterium 属 3：纤毛菌属 Leptotrichia 属 4：丁酸弧菌属 Butyrivibrio 属 5：琥珀酸单胞菌属 Succinimonas 属 6：琥珀酸弧菌属 Succinivibrio 属 7：厌氧螺菌属 Anaerobiospirillum 属 8：沃林氏菌属 Wolinella 属 9：月形单胞菌属 Selenomonas 属 10：厌氧弧菌属 Anaerovibrio 属 11：梳状菌属 Pectinatus 属 12：醋弧菌属 Acetivibrio 属 13：毛螺菌属 Lachnospira 第七节 异化型硫酸盐或硫还原细菌 属：脱硫单孢菌属 Desulfuromonas 属：脱硫弧菌属 Desulfovibrio 属：脱硫单胞菌属 Desulfomonas 属：脱硫球菌属 Desulfococcus 属：脱硫杆菌属 Desulfobacter 属：脱硫叶菌属 Dusulfobulbus 属：脱硫八叠球菌属 Desulfosarcina 第八节 厌氧革兰氏阴性球菌 科 1：韦荣氏球菌科 Veillonellaceae 属 1：韦荣氏球菌属 Veillonella 属 2：氨基酸球菌属 Acidaminococcus 属 3：巨球形菌属 Megasphaera 第九节 立克次氏体和衣原体 目 1：立克次氏体目 Rickettsiales 科 1：立克次氏体科 Rickettsiaceae 族 1：立克次氏体族 Rickettsieae 属 1：立克次氏体属 Rickettsia 属 2：罗卡利马氏体菌属 Rocalimaea 属 3：考克斯体菌属 Coxiella 族 2：埃里希氏体族 Ehrlichieae 属 4：埃里希氏体属 Ehrlichia 属 5：考德里氏体属 cowdria 属 6：新立克次氏体属 Neorickttsia
族3:沃尔巴克氏体族 Wolbachia 属7:沃尔巴克氏体属 Wolbachia 属8:立克次氏小体属 Rickettsiella 科2:巴尔通氏体科 Bartonellaceae 属1:巴尔通氏体属 Bartonella 属2:格拉汉氏体属 grahamella 科3:无形体科 Anaplasmataceae 属1:无形体属 Anaplasma 属2:埃及小体属 Aegyptianella 属3:血巴通氏体属 Haemobartonella 属4:血虫体属 Eperythrozoon 目2:衣原体目 Chlamydiales 科1:衣原体科 Chlamydiaceae 属1:衣原体属 Chlamydia 第十节枝原体 目1:枝原体目 Mycoplasmatales 科1:枝原体科 Mycoplasmataceae 属1:枝原体属 Mycoplasma 属2:尿枝原体属 Ureaplasma 科2:无胆甾原体科 Acholeplasmaceae 属1:无胆甾原体属 Acholeplasma 科3:螺原体科 Spiroplasmacead 属1:螺原体属 Spiroplasma 其它属 属:厌氧枝原体属 Anaeroplasma 属:热原体属 Thermoplasma 植物和无脊椎动物的枝原体样生物 第十一节内共生菌 A.原生动物的内共生菌 纤毛内共生菌 鞭毛内共生菌 阿米巴内共生菌 内共生菌类别: 属1:全孢螺菌属 Holospora 属2:杀手杆菌属 Caedibacter 属3:类杀手杆菌属 Pseudocaedibacter 属4:溶菌属 Lyticum 属5:罩杆菌属 Tectibacter B.昆虫内共生菌 属:蟑螂杆状体属 Blattabacterium C.真菌和除节肢动物外的无脊椎动物内共生菌
族 3：沃尔巴克氏体族 Wolbachieae 属 7：沃尔巴克氏体属 Wolbachia 属 8：立克次氏小体属 Rickettsiella 科 2：巴尔通氏体科 Bartonellaceae 属 1：巴尔通氏体属 Bartonella 属 2：格拉汉氏体属 Grahamella 科 3：无形体科 Anaplasmataceae 属 1：无形体属 Anaplasma 属 2：埃及小体属 Aegyptianella 属 3：血巴通氏体属 Haemobartonella 属 4：血虫体属 Eperythrozoon 目 2：衣原体目 Chlamydiales 科 1：衣原体科 Chlamydiaceae 属 1：衣原体属 Chlamydia 第十节 枝原体 目 1：枝原体目 Mycoplasmatales 科 1：枝原体科 Mycoplasmataceae 属 1：枝原体属 Mycoplasma 属 2：尿枝原体属 Ureaplasma 科 2：无胆甾原体科 Acholeplasmaceae 属 1：无胆甾原体属 Acholeplasma 科 3：螺原体科 Spiroplasmaceae 属 1：螺原体属 Spiroplasma 其它属 属：厌氧枝原体属 Anaeroplasma 属：热原体属 Thermoplasma 植物和无脊椎动物的枝原体样生物 第十一节 内共生菌 A. 原生动物的内共生菌 纤毛内共生菌 鞭毛内共生菌 阿米巴内共生菌 内共生菌类别： 属 1：全孢螺菌属 Holospora 属 2：杀手杆菌属 Caedibacter 属 3：类杀手杆菌属 Pseudocaedibacter 属 4：溶菌属 Lyticum 属 5：罩杆菌属 Tectibacter B. 昆虫内共生菌 属：蟑螂杆状体属 Blattabacterium C. 真菌和除节肢动物外的无脊椎动物内共生菌
第二卷 第十二节革兰氏阳性球菌 科1:微球菌科 Micrococcaceae 属1:微球菌属 Micrococcus 属2:口腔球菌属 Stomatococcus 属3:动性球菌属 Planococcus 属4:葡萄球菌属 Staphylococcus 科2:异常球菌科 Deinococcaceae 属:异常球菌属 Deinococcus 其它属 属:链球菌属 Streptococcus 产脓的溶血性链球菌,口腔链球菌,肠道链球菌 乳酸链球菌,厌氧性链球菌和其它链球菌 属:明串珠菌属 Leuconostoc 属:片球菌属 Pediococcus 属:气球菌属 Aerococcus 属:孪生球菌属 Gemella 属:消化球菌属 Peptococcus 属:消化链球菌属 Peptostreptococcus 属:瘤胃球菌属 Ruminococcus 属:粪球菌属 Coppcoccus 属:八叠球菌属 Santana 第十三节形成芽孢的革兰氏阳性杆菌和球菌 属:芽孢杆菌属 Bacillus 属:芽孢乳杆菌属 Sporolactobacillus 属:梭菌属 Clostridium 属:脱硫肠状菌属 Desulfotomaculum 属:芽孢八叠球菌属 Sporosarcina 属:颤螺菌属 Oscillospira 第十四节匀称的、无芽孢革兰氏阳性杆菌 属:乳杆菌属 Lactobacilli 属:利斯特氏菌属 Listeria 属:丹毒丝菌属 Erysipelothrix 属:索丝菌属 Brochothrix 属:肾杆菌属 Renibacterium 属:库特氏菌属 Kurthia 属:里拉菌属 Caryophanon 第十五节不匀称的、无芽孢革兰氏阳性杆菌 属:棒杆菌属 Corynebacterium 植物病原性棒杆菌
第二卷 第十二节 革兰氏阳性球菌 科 1：微球菌科 Micrococcaceae 属 1：微球菌属 Micrococcus 属 2：口腔球菌属 Stomatococcus 属 3：动性球菌属 Planococcus 属 4：葡萄球菌属 Staphylococcus 科 2：异常球菌科 Deinococcaceae 属：异常球菌属 Deinococcus 其它属 属：链球菌属 Streptococcus 产脓的溶血性链球菌，口腔链球菌，肠道链球菌， 乳酸链球菌，厌氧性链球菌和其它链球菌 属：明串珠菌属 Leuconostoc 属：片球菌属 Pediococcus 属：气球菌属 Aerococcus 属：孪生球菌属 Gemella 属：消化球菌属 Peptococcus 属：消化链球菌属 Peptostreptococcus 属：瘤胃球菌属 Ruminococcus 属：粪球菌属 Coprococcus 属：八叠球菌属 Sarcina 第十三节 形成芽孢的革兰氏阳性杆菌和球菌 属：芽孢杆菌属 Bacillus 属：芽孢乳杆菌属 Sporolactobacillus 属：梭菌属 Clostridium 属：脱硫肠状菌属 Desulfotomaculum 属：芽孢八叠球菌属 Sporosacina 属：颤螺菌属 Oscillospora 第十四节 匀称的、无芽孢革兰氏阳性杆菌 属：乳杆菌属 Lactobacillus 属：利斯特氏菌属 Listeria 属：丹毒丝菌属 Erysipelothrix 属：索丝菌属 Brochothrix 属：肾杆菌属 Renibacterium 属：库特氏菌属 Kurthia 属：里拉菌属 Caryophanon 第十五节 不匀称的、无芽孢革兰氏阳性杆菌 属：棒杆菌属 Corynebacterium 植物病原性棒杆菌
属:加德纳氏菌属 Gardnerella 属:隐秘杆菌属 Arcanobacterium 属:节杆菌属 Arthobacter 属:短杆菌属 Brevibacterium 属:短小杆菌属 Curtobacterium 属:乳酪杆菌属 Caseobacter 属:微杆菌属 Microbacterium 属:金杆菌属 Aureobacteriun 属:纤维单胞菌属 Cellulomonas 属:壤霉菌属 Agromyces 属:蛛菌属 arachnia 属:罗氏菌属 rothia 属:丙酸杆菌属 Propionibacterium 属:真杆菌属 Eubacterium 属:醋杆菌属 a cetobacteriun 属:毛螺菌属 Lachnospi 属:丁酸弧菌属 Butyrivibrio 属:高温厌氧杆菌属 Thermoanaerobacter 属:放线菌属 Actinomyces 属:双岐杆菌属 Bifidobacterium 第十六节分枝杆菌 科1:分枝杆菌科 Mycobacteriaceae 属1:分枝杆菌属 Mycobacterium 第十七节诺卡氏菌类 属:诺卡氏菌属 nocardia 属:红球菌属 Rhodococcus 属:类诺卡氏菌属 nocardioides 属:假诺卡氏菌属 Pseudonocardia 属:厄氏菌属 Oerskovia 属:糖多孢菌属 Saccharopolyspora 属:小多孢菌属 Micropolyspora 属:原小单孢菌属 Pmmicomonospora 属:间孢囊菌属 intrasporangium 第三卷 第十八节非放氧光合细菌 紫细菌 科1:着色菌科 Chromatiaceae 属1:着色菌属 Chromatin 属2:束硫菌属 Thiocystis 属3:硫螺旋菌属 Thiospirillum 属4:荚硫菌属 Thiocapsa
属：加德纳氏菌属 Gardnerella 属：隐秘杆菌属 Arcanobacterium 属：节杆菌属 Arthrobacter 属：短杆菌属 Brevibacterium 属：短小杆菌属 Curtobacterium 属：乳酪杆菌属 Caseobacter 属：微杆菌属 Microbacterium 属：金杆菌属 Aureobacterium 属：纤维单胞菌属 Cellulomonas 属：壤霉菌属 Agromyces 属：蛛菌属 Arachnia 属：罗氏菌属 Rothia 属：丙酸杆菌属 Propionibacterium 属：真杆菌属 Eubacterium 属：醋杆菌属 Acetobacterium 属：毛螺菌属 Lachnospira 属：丁酸弧菌属 Butyrivibrio 属：高温厌氧杆菌属 Thermoanaerobacter 属：放线菌属 Actinomyces 属：双岐杆菌属 Bifidobacterium 第十六节 分枝杆菌 科 1：分枝杆菌科 Mycobacteriaceae 属 1：分枝杆菌属 Mycobacterium 第十七节 诺卡氏菌类 属：诺卡氏菌属 Nocardia 属：红球菌属 Rhodococcus 属：类诺卡氏菌属 Nocardioides 属：假诺卡氏菌属 Pseudonocardia 属：厄氏菌属 Oerskovia 属：糖多孢菌属 Saccharopolyspora 属：小多孢菌属 Micropolyspora 属：原小单孢菌属 Promicromonospora 属：间孢囊菌属 Intrasporangium 第三卷 第十八节 非放氧光合细菌 紫细菌 科 1：着色菌科 Chromatiaceae 属 1：着色菌属 Chromatium 属 2：束硫菌属 Thiocystis 属 3：硫螺旋菌属 Thiospirillum 属 4：荚硫菌属 Thiocapsa
属5:闪杆菌属 Lamprobacter 属6:闪囊菌属 Lamprocystis 属7:网硫菌属 Thiodictyon 属8:可变杆菌属 Amoebobacter 属9:板硫菌属 Thiopedia 科2:外硫红螺菌科 Ectothiorhodospiraceae 属:外硫红螺菌属 Ectothiorhodospira 紫色非硫化细菌 属:红螺菌属 Rhodospirillum 属:红球形菌属 Rhodopila 属:红杆菌属 Rhodobacter 属:红假单胞菌属 Rhodopseudomonas 属:红微菌属 Rhodomicrobium 属:红环菌属 Rhodocyclus 绿色细菌 绿硫细菌 属:绿菌属 Chlorobi 属:突柄绿菌属 Prosthecochloris 属:暗网菌属 Pelodictyon 属:绿臂菌属 Ancalochloris 属:绿滑菌属 Chlorpherpeton 共生菌 多细胞,丝状绿色细菌 属:绿屈挠菌属 Chloroflexus 属:螺丝菌属 Heliothri 属:绿颤蓝细菌属 Oscillocholoris 属:绿丝菌属 Chloronema 未确定属 属:螺旋杆菌属 Heliobacterium 属:赤细菌属 Erythrobacter 第十九节好氧光合细菌 组1:蓝细菌 小节1 目:着色球菌目 Chroococcales 属1:管孢蓝细菌属 Chamaesiphon 属2:粘杆菌属 Gloeobacter 属3:粘杆蓝细菌属 Gloeothece 小节2 目:宽球蓝细菌目 Pleurocapsales 属1:皮果蓝细菌属 Dermocarpa 属2:异球蓝细菌属 Xenococcus 属3:小皮果蓝细菌属 Dermocarpella 属4:粘八叠球菌属 Myxosacina
属 5：闪杆菌属 Lamprobacter 属 6：闪囊菌属 Lamprocystis 属 7：网硫菌属 Thiodictyon 属 8：可变杆菌属 Amoebobacter 属 9：板硫菌属 Thiopedia 科 2：外硫红螺菌科 Ectothiorhodospiraceae 属：外硫红螺菌属 Ectothiorhodospira 紫色非硫化细菌 属：红螺菌属 Rhodospirillum 属：红球形菌属 Rhodopila 属：红杆菌属 Rhodobacter 属：红假单胞菌属 Rhodopseudomonoas 属：红微菌属 Rhodomicrobium 属：红环菌属 Rhodocyclus 绿色细菌 绿硫细菌 属：绿菌属 Chlorobium 属：突柄绿菌属 Prosthecochloris 属：暗网菌属 Pelodictyon 属：绿臂菌属 Ancalochloris 属：绿滑菌属 Chloroherpeton 共生菌 多细胞，丝状绿色细菌 属：绿屈挠菌属 Chloroflexus 属：螺丝菌属 Heliothrix 属：绿颤蓝细菌属 Oscillocholoris 属：绿丝菌属 Chloronema 未确定属 属：螺旋杆菌属 Heliobacterium 属：赤细菌属 Erythrobacter 第十九节 好氧光合细菌 组 1：蓝细菌 小节 1： 目：着色球菌目 Chrococcales 属 1：管孢蓝细菌属 Chamaesiphon 属 2：粘杆菌属 Gloeobacter 属 3：粘杆蓝细菌属 Gloeothece 小节 2： 目：宽球蓝细菌目 Pleurocapsales 属 1：皮果蓝细菌属 Dermocarpa 属 2：异球蓝细菌属 Xenococcus 属 3：小皮果蓝细菌属 Dermocarpella 属 4：粘八叠球菌属 Myxosacina
属5:拟色球蓝细菌属 Chrpococcidiopsis 小节3: 目:颤蓝细菌目 Oscillatoriales 属1:螺旋蓝细菌属 spirulina 属2:节螺蓝细菌属 Arthrospira 属3:颤蓝细菌属 Oscillatoria 属4:鞘丝蓝细菌属 Lyngbya 属5:假鱼腥蓝细菌属 Pseudanabaena 属6:斯塔尔氏蓝细菌属 Sarria 属7:发毛针蓝细菌属 Crinalium 属8:微鞘蓝细菌属 Microcoleus 小节4 目:念珠蓝细菌目 Nostocales 科1:念珠蓝细菌科 Nostocaceae 属1:鱼腥蓝细菌属 Anabaena 属2:蓝束丝蓝细菌属 Aphanizomenon 属3:节球蓝细菌属 nodularia 属4:筒孢蓝细菌属 Cylindnospermun 属5:念珠蓝细菌属 Nostoc 科2:伪枝蓝细菌科 Scytonemataceae 属1:伪枝蓝细菌属 Scytonema 科3:胶须蓝细菌科 Rivulariaceae 属1:眉蓝细菌属 Calothrix 小节5 目:拟绿胶蓝细菌目 Stigonematales 属1:真杆蓝细菌属 Chlorogloeopsis 属2:飞氏蓝细菌属 Fischerella 属3:真枝蓝细菌属 Stigonema 属4:吉特勒氏蓝细菌属 Geigeria 组2 目:原绿蓝细菌目 Prochlorales 科1:原绿蓝细菌科 Prochloraceae 属:原绿蓝细菌属 Prpchloon 其它类别 属:原绿丝蓝细菌属“ Prochlorothrix” 第二十节好气化能自养细菌和相关生物 A.硝化细菌 科:硝化细菌科 Nitrobacteraceae 属1:硝化杆菌属 Nitrobacter 属2:硝化刺菌属 Nitrospira 属3:硝化球菌属 Nitrococcus 属4:亚硝化螺菌属 Nitrosospira 属5:亚硝化单胞菌属 nitrosomonas
属 5：拟色球蓝细菌属 Chroococcidiopsis 小节 3： 目：颤蓝细菌目 Oscillatoriales 属 1：螺旋蓝细菌属 Spirulina 属 2：节螺蓝细菌属 Arthrospira 属 3：颤蓝细菌属 Oscillatoria 属 4：鞘丝蓝细菌属 Lyngbya 属 5：假鱼腥蓝细菌属 Pseudanabaena 属 6：斯塔尔氏蓝细菌属 Starria 属 7：发毛针蓝细菌属 Crinalium 属 8：微鞘蓝细菌属 Microcoleus 小节 4： 目：念珠蓝细菌目 Nostocales 科 1：念珠蓝细菌科 Nostocaceae 属 1：鱼腥蓝细菌属 Anabaena 属 2：蓝束丝蓝细菌属 Aphanizomenon 属 3：节球蓝细菌属 Nodularia 属 4：筒孢蓝细菌属 Cylindrospermum 属 5：念珠蓝细菌属 Nostoc 科 2：伪枝蓝细菌科 Scytonemataceae 属 1：伪枝蓝细菌属 Scytonema 科 3：胶须蓝细菌科 Rivulariaceae 属 1：眉蓝细菌属 Calothrix 小节 5： 目：拟绿胶蓝细菌目 Stigonematales 属 1：真杆蓝细菌属 Chlorogloeopsis 属 2：飞氏蓝细菌属 Fischerella 属 3：真枝蓝细菌属 Stigonema 属 4：吉特勒氏蓝细菌属 Geitleria 组 2： 目：原绿蓝细菌目 Prochlorales 科 1：原绿蓝细菌科 Prochloraceae 属：原绿蓝细菌属 Prochloron 其它类别 属：原绿丝蓝细菌属“Prochlorothrix” 第二十节 好气化能自养细菌和相关生物 A. 硝化细菌 科：硝化细菌科 Nitrobacteraceae 属 1：硝化杆菌属 Nitrobacter 属 2：硝化刺菌属 Nitrospira 属 3：硝化球菌属 Nitrococcus 属 4：亚硝化螺菌属 Nitrosospira 属 5：亚硝化单胞菌属 Nitrosomonas
属6:亚硝化球菌属 Nitrosococcus 属7:亚硝化螺菌属 Nitrosospira 属8:亚硝化叶菌属 Nitro 属9:亚硝化弧菌属 Nitrosovib 无色硫化细菌 属:硫小杆菌属 Thiobacterium 属:大单胞菌属 Macromonas 属:硫螺菌属 Hospira 属:卵硫菌属 Thiovulun 属:硫杆菌属 Thiobacillus 属:硫微螺菌属 Thiomicrospira 属:硫球菌属 Thiosphaera 属:嗜酸菌属 Acidiphilium 属:嗜热丝菌属 Thermothrix C.专性氢氧化菌 属:氢细菌属 Hydrogenobacter D.铁和锰氧化和域或储存细菌 科:鞘铁菌科 Siderocapsac 属1:鞘铁菌属 Sidecap 属2:瑙曼氏菌属 naumanniella 属3:铁球菌属 Siderococcus 属4:赭菌属 Chobi E.趋磁细菌 属:水生螺菌属 Aquaspirillum 属:嗜胆球菌属 Bilophococcus 第二十一节芽生和或有附器的细菌 A.柄细菌 出芽细菌 属:生丝微菌属 属:生丝单胞菌属 hyphomonas 属:土微菌属 Pedomicrobium 属:臂微菌属 Ancalomicrobium 属:突柄微菌属 Prpsthecomicpbium 属:星状菌属Sell 属:双头菌属 Labrys 2.非出芽细菌 属:柄杆菌属 Caulobacter 属:不粘柄菌属 A asticcacaulis 属:突柄杆菌属 Prosthecobacter B无柄细菌 1.出芽细菌 属:浮霉状菌属 Planctommvces 属:等球菌属 sphaera
属 6：亚硝化球菌属 Nitrosococcus 属 7：亚硝化螺菌属 Nitrosospira 属 8：亚硝化叶菌属 Nitrolobus 属 9：亚硝化弧菌属 Nitrosovibrio B.无色硫化细菌 属：硫小杆菌属 Thiobacterium 属：大单胞菌属 Macromonas 属：硫螺菌属 Thiospira 属：卵硫菌属 Thiovulum 属：硫杆菌属 Thiobacillus 属：硫微螺菌属 Thiomicrospira 属：硫球菌属 Thiosphaera 属：嗜酸菌属 Acidiphilium 属：嗜热丝菌属 Thermothrix C.专性氢氧化菌 属：氢细菌属 Hydrogenobacter D. 铁和锰氧化和/或储存细菌 科：鞘铁菌科 Siderocapsaceae 属 1：鞘铁菌属 Siderocapsa 属 2：瑙曼氏菌属 Naumanniella 属 3：铁球菌属 Siderococcus 属 4：赭菌属 Ochrobium E. 趋磁细菌 属：水生螺菌属 Aquaspirillum 属：嗜胆球菌属 Bilophococcus 第二十一节 芽生和/或有附器的细菌 A. 柄细菌 1.出芽细菌 属：生丝微菌属 Hyphomicrobium 属：生丝单胞菌属 Hyphomonas 属：土微菌属 Pedomicrobium 属：臂微菌属 Ancalomicrobium 属：突柄微菌属 Prosthecomicrobium 属：星状菌属 Stella 属：双头菌属 Labrys 2．非出芽细菌 属：柄杆菌属 Caulobacter 属：不粘柄菌属 Asticcacaulis 属：突柄杆菌属 Prosthecobacter B.无柄细菌 1.出芽细菌 属：浮霉状菌属 Planctomyces 属：等球菌属 Isosphaera