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《世界华人消化杂态》:普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展(东南大学附属南京江北人民医院)

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∥C7D世界华人清化杂志 在线投稿:htp:// 世界华人消化杂志2017年月28日;25(9):810815 DOL:101156/ vcjd. v25i9810 ISSN 1009-3079(print)ISSN 2219-2859(online) 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 黄晓丽,王国品,于成功 ■背景资料 黄晓丽,王国品,东南大学附属南京江北人民医院消化科 Received:2017-01-15 正常人体胃肠道江苏省南京市210048 Revised:2017-02-18 细菌微生态处于 Accepted:2017-02-27 种平衡状态,于成功,南京大学医学院附属鼓楼医院消化科江苏省 Published online:2017-03-28 若这种平街被破南京市210008 坏将会引起许多 相关疾病,目前基金项目:国家目然科学基金资助项目No81470819 菌群失调越来 Abstract 越受到人们的作者贡献分布本文综述由黄說前完成王国品与于成功审校. Recently, the relationship between intestinal aecalibacterum通讯作者:于成功,教授,主任医师210008江苏省南京市 dysbacteriosis and intestinal disease has 重视.普拉梭菌 prausnItz,F.中路321号,南京大学医学院附属鼓楼医院消化科. become a hot research topic. As one of the prausnItZ)是健康 most abundant symbiotic bacteria in the 人类肠道共生菌 human gut, Faecalibacterium prausnitz plays 的一个重要组成收稿日期:2017-01-15 an important role in intestinal disease and has 部分,对人类的健修回日期:2017-02-18 received more and more attention. This article 康发挥着重要的接受日期:2017-02-27 作用.最近研究发 derstanding of 现一些肠道在线出版日期:2017-03-28 the mechanism of action and active ingredients 肠内 F prausnitz f this bacterium as well as its relationshil 数量的发生了很 with intestinal disease 大的变化 Advances in understanding relationship between The Author(s)2017. Published by Baishideng Faecalibacterium prausnitzii Publishing Group Inc. All rights reserved and intestinal disease Key Words: Faecalibacterium prausnitz; Gut Xiao-Li Huang, Guo-Pin Wang, Cheng-Gong Yu microbial communities: intestinal disease Huang XL, Wang GP, Yu CG. Advances in Xiao-Li Huang, Guo-Pin Wang, Department of ween Faecalibicterium Gastroenterology, Nanjing Jiangbei People's Hospital rausnitzii and intestinal disease. Shijie Huaren Xiaohua AffiliatedtoSoutheastUniversityNanjing210048,Zazhi2017:25(9):810-815Url:http://www.wjgnet ■同行评议 Jiangsu Province, China om/1009-3079/full/v25/19/810.htmDoi:http:// 金博,主任医师 Cheng-Gong Yu, Department of Gastroenterology, dx. doi org/10.11569/wcjd v25 19.810 解放军第309医 Nanjing Drum Tower Hospital, the Affliated Hospiti 院(总参谋部总医 of Nanjing University Medical School, Nanjing2006 纯杰,研究员,军 iangsu Province. China 摘要 事医学科学院生 Supported by; National Natural science foundation of肠道菌群失调与肠道疾病的关系一直是当 物工程研究所;钱Chna,No.81470819 福初,副主任技 前研究的热点.普拉梭菌作为人类最丰富的 院中心实验室;王 Physician,, Department a orrespondence to: CE 肠道共生菌之一,其在肠道疾病中所起的作 m用越来越引起人们的重视本文就此菌的作 多春,研究员,中 Tower Hospital, the affil 国疾病预防控制 Medical school,32 1 Zhongshan Road, Nanji 用机制、抗炎有效成分以及与肠道疾病的 关系的研究进展作一综述 2017-03-28I Volume 25 Issue 9 I

黄晓丽, 王国品, 东南大学附属南京江北人民医院消化科 江苏省南京市 210048 于成功, 南京大学医学院附属鼓楼医院消化科 江苏省 南京市 210008 基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 81470819. 作者贡献分布: 本文综述由黄晓丽完成; 王国品与于成功审校. 通讯作者: 于成功, 教授, 主任医师, 210008, 江苏省南京市 中山路321号, 南京大学医学院附属鼓楼医院消化科. chenggong_yu@nju.edu.cn 电话: 025-83106666 收稿日期: 2017-01-15 修回日期: 2017-02-18 接受日期: 2017-02-27 在线出版日期: 2017-03-28 Advances in understanding relationship between Faecalibacterium prausnitzii and intestinal disease Xiao-Li Huang, Guo-Pin Wang, Cheng-Gong Yu Xiao-Li Huang, Guo-Pin Wang, Department of Gastroenterology, Nanjing Jiangbei People’s Hospital Affiliated to Southeast University, Nanjing 210048, Jiangsu Province, China Cheng-Gong Yu, Department of Gastroenterology, Nanjing Drum Tower Hospital, the Affiliated Hospital of Nanjing University Medical School, Nanjing 210008, Jiangsu Province, China Supported by: National Natural Science Foundation of China, No. 81470819. Correspondence to: Cheng-Gong Yu, Professor, Chief Physician, Department of Gastroenterology, Nanjing Drum Tower Hospital, the Affiliated Hospital of Nanjing University Medical School, 321 Zhongshan Road, Nanjing 210008, Jiangsu Province, China. chenggong_yu@nju.edu.cn ■背景资料 正常人体胃肠道 细菌微生态处于 一 种 平 衡 状 态 , 若这种平衡被破 坏将会引起许多 相关疾病, 目前 菌 群 失 调 越 来 越 受 到 人 们 的 重视. 普拉梭菌 (Faecalibacterium p r a u s n it z ii, F. prausnitzii)是健康 人类肠道共生菌 的一个重要组成 部分, 对人类的健 康发挥着重要的 作用. 最近研究发 现一些肠道疾病 肠内F. prausnitzii 数量的发生了很 大的变化. Received: 2017-01-15 Revised: 2017-02-18 Accepted: 2017-02-27 Published online: 2017-03-28 Abstract Recently, the relationship between intestinal dysbacteriosis and intestinal disease has become a hot research topic. As one of the most abundant symbiotic bacteria in the human gut, Faecalibacterium prausnitzii plays an important role in intestinal disease and has received more and more attention. This article reviews the advances in the understanding of the mechanism of action and active ingredients of this bacterium as well as its relationship with intestinal disease. © The Author(s) 2017. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved. Key Words: Faecalibacterium prausnitzii; Gut microbial communities; Intestinal disease H u a n g X L , W a n g G P , Y u C G . A d v a n c e s i n understanding relationship between Faecalibacterium prausnitzii and intestinal disease. Shijie Huaren Xiaohua Zazhi 2017; 25(9): 810-815 URL: http://www.wjgnet. com/1009-3079/full/v25/i9/810.htm DOI: http:// dx.doi.org/10.11569/wcjd.v25.i9.810 摘要 肠道菌群失调与肠道疾病的关系一直是当 前研究的热点. 普拉梭菌作为人类最丰富的 肠道共生菌之一, 其在肠道疾病中所起的作 用越来越引起人们的重视. 本文就此菌的作 用机制、抗炎有效成分以及与肠道疾病的 关系的研究进展作一综述. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 黄晓丽, 王国品, 于成功 在线投稿: http://www.baishideng.com/wcjd/ch/index.aspx DOI: 10.11569/wcjd.v25.i9.810 世界华人消化杂志 2017年3月28日; 25(9): 810-815 ISSN 1009-3079 (print) ISSN 2219-2859 (online) 文献综述 REVIEW ® ■同行评议者 金博, 主任医师, 解 放 军 第 3 0 9 医 院(总参谋部总医 院)消化内科; 刘 纯杰, 研究员, 军 事医学科学院生 物工程研究所; 钱 福初, 副主任技 师, 湖州市中心医 院中心实验室; 王 多春, 研究员, 中 国疾病预防控制 中心传染病所 WCJD|www.wjgnet.com 810 2017-03-28|Volume 25|Issue 9|

黄晓啊,等.普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 e The Author(s)2017. Published by Baishideng其中Ⅱ型对区别炎症性肠病( nflammatory bowel■研发沿 Publishing Group Inc. All rights reserve disease,IBD)亚型有一定帮助, F prausnitz是 F. prausnItz是新 近发现的一种肠 关键词:普拉梭菌;肠道微生物;肠道疾病 种厌氧菌,对氧极度敏感,即使在厌氧环境下道益生菌,与肠 也很难培养,但在培养基中加上黄素、半胱氦道疾病,尤其是 炎症性肠病的发 核心提要:普拉梭茵( Faecalibacterium酸或谷胱甘肽可使其在微需氧环境下生长.F.是其作用的有效 病密切相关,但 prausnitz, F prausnitz)是存在于使康人群肠道 prausnItz酵解葡萄糖后能够产生大量的丁酸成分和其作用的 中最丰富的肠道微生物之一,其数量的变化与盐、甲酸盐和少量D.乳酸盐 机制目前还未究 肠道疾病的发生发展有着重要的联系.本文综 全阐明,是目前 述当前的研究进展,探讨肠道FPam数量2肠内posm的影响因素 研究的热点 与肠道疾病发生的关系 F prausnitz在健康人类肠道含量丰富,在粪 便中微生物的5%,甚至在有些人群中可高达 黄晓丽,王国品于成功普拉梭菌与肠疾病关系的付究进15%此菌也广泛分布在一些动物胃肠道 展.世界华人消化杂志2017:259:810-815URL: ww.wjgnet. com/1009-3079/full/v25/19/810. htm 如哺乳动物猪、牛、小鼠和家禽类鸡口,.F http://dx.doi.org/10.11569/wcjd.v25.19.810 prausnItz在肠道菌群中的比例受到结肠环境 的影响,肠道中pH值、胆酸盐和氧含量均可 0引言 影响 F prausnitz的生长倒吸烟和要素饮食 普拉梭菌( Faecalibacterium prausnitzil,F 降低其在肠道中的含量,肠镜检查前服用 prausnItz)是存在于健康人群肠道中最丰富菜乙二醇400肯肠后肠黏膜相关 praun也 的肠道微生物之一,约占肠道粪便细菌总数会降低一些药物的使用也会影响Fpam 的5% f prausnitz作为健康人类肠道共生在肠道中的含量,利福昔明可以提高肠道F 菌的一个重要组成部分对人类的健康发挥着pW含量,英夫利昔和大剂量的皮质醇 重要的作用,目前越来越多的研究发现肠内F激素也可逆转活动性克罗恩病( Crohns disease, prausnItz改变导致的微生态失衡与一些肠道CD患者粪便中降低的 F prausnitz某些基 疾病的发病密切相关研究认为 F prausnitz和因的缺失也可影响肠道菌群的变化动物实验 其上清具有抗炎效应,可明显改善肠道炎症显示NOD基因敲除小鼠的回肠和盲肠中黏膜 本文综合最近发表的文献,对 2 prausnitz的相关 F prausnitz的数量明显减少叫 特性、作用机制及与肠道疾病的相关性作 综述 3 F prausni的抗炎机制 F prausnitz及其培养上清能够减轻三硝基苯 1 F prausnitz的命名来历和生物特性 磺酸 ( trinitro-benzene-sulfonic acid,TNBS)诱导 1922年, Prausnit从一例患者的胸腔脓肿中的肠道炎症具有明确的抗炎效应,其抗炎效 分离出来一种棒状杆菌,最初被归为梭菌应与调节机体免疫有关一个可能的机制是抑 Fusobacterium属.直到19年此菌的不同人制机体核因子 kb(nuclear factor-KB,NFB)的 类菌株的完整的16 SIrNA基因序列被构建活性,NFKB是参与免疫和炎症的重要转录因 后,才发现他与梭状芽孢杆菌属结构更接近子,其激活后可促进促炎介质的表达 Sokol等 相关报道 1从4.200年 Duncan等建议将其归属为一个新发现 F prausnItz培养上清可抑制Caco2细胞 Sokol等认为F 的菌种 Faecalibacterium属,定义为不产芽胞厌白介素( interleukin,I}1B诱导的NFxB的活性pamm培养上 氧菌和不动革兰氏阳性杆菌,并将此菌更名和L8的分泌;另一个免疫因素是 F prausnitz( (interleukin,L) aecalibacterium prausnitz,简称 F prausnitz能够诱导外周血单个核细胞生成大量抗炎因1阝诱导的NFkB 的活性和促因 A prausnitz归属于厚壁菌门 Firmicutes)柔子IL-10,维持肠道的生态稳定,IL-10可抑制子8的分泌,且 嫩梭菌属( Clostridium leptum),有多个亚种干扰素 (interferon-,IFN-7)、肿瘤坏死因子 A2-165、SL3/3、L2/6、M21/2、HTFF和( tumour necrosis factor-o,TNF-a)、ⅡL-6、大量抗萸因子 KLE1255其中A2-165是最常见且研究得1L12炎性因子的产生,诱导肠黏膜Treg细胞膜Treg细胞的生 最多的一种,现代的种系遗传学分析显示F的生成和抑制炎症的作用.Ross等也通过成和抑制炎症的 pai具有两种不同的种系:1型和Ⅱ型,体内外研究证实 F prausnitz/A2165能促进的生态德次质 811 2017-03-28I Volume 25 Issue 9 I

黄晓丽, 等. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 WCJD|www.wjgnet.com 811 2017-03-28|Volume 25|Issue 9| ■研发前沿 F. prausnitzii是新 近发现的一种肠 道益生菌, 与肠 道疾病, 尤其是 炎症性肠病的发 病密切相关, 但 是其作用的有效 成分和其作用的 机制目前还未完 全阐明, 是目前 研究的热点. © The Author(s) 2017. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved. 关键词: 普拉梭菌; 肠道微生物; 肠道疾病 核 心 提 要 : 普拉梭菌(F a e c a l i b a c t e r i u m prausnitzii, F. prausnitzii)是存在于健康人群肠道 中最丰富的肠道微生物之一, 其数量的变化与 肠道疾病的发生发展有着重要的联系. 本文综 述当前的研究进展, 探讨肠道F. prausnitzii数量 与肠道疾病发生的关系. 黄晓丽, 王国品, 于成功. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进 展. 世界华人消化杂志 2017; 25(9): 810-815 URL: http:// www.wjgnet.com/1009-3079/full/v25/i9/810.htm DOI: http://dx.doi.org/10.11569/wcjd.v25.i9.810 0 引言 普拉梭菌(Faecalibacterium prausnitzii, F. prausnitzii )是存在于健康人群肠道中最丰富 的肠道微生物之一, 约占肠道粪便细菌总数 的5%[1]. F. prausnitzii作为健康人类肠道共生 菌的一个重要组成部分对人类的健康发挥着 重要的作用, 目前越来越多的研究发现肠内F. prausnitzii改变导致的微生态失衡与一些肠道 疾病的发病密切相关. 研究认为F. prausnitzii和 其上清具有抗炎效应, 可明显改善肠道炎症[2]. 本文综合最近发表的文献, 对F. prausnitzii的 特性、作用机制及与肠道疾病的相关性作一 综述. 1 F. prausnitzii的命名来历和生物特性 1922年, Pr ausnit从一例患者的胸腔脓肿中 分离出来一种棒状杆菌, 最初被归为梭菌 Fusobacterium属, 直到1996年此菌的不同人 类菌株的完整的16s rRNA基因序列被构建 后, 才发现他与梭状芽孢杆菌属结构更接近 [3,4] . 2002年Duncan等[5] 建议将其归属为一个新 的菌种Faecalibacterium属, 定义为不产芽胞厌 氧菌和不动革兰氏阳性杆菌, 并将此菌更名 Faecalibacterium prausnitzii, 简称F. prausnitzii. F. prausnitzii归属于厚壁菌门(Firmicutes)柔 嫩梭菌属(Clostridium leptum), 有多个亚种 A2-165、SL3/3、L2/6、M21/2、HTF-F和 K LE1255, 其中A2-165是最常见且研究得 最多的一种. 现代的种系遗传学分析显示F. prausnitzii具有两种不同的种系: Ⅰ型和Ⅱ型, 其中Ⅱ型对区别炎症性肠病(inflammatory bowel disease, IBD)亚型有一定帮助. F. prausnitzii是一 种厌氧菌, 对氧极度敏感, 即使在厌氧环境下 也很难培养, 但在培养基中加上黄素、半胱氨 酸或谷胱甘肽可使其在微需氧环境下生长. F. prausnitzii酵解葡萄糖后能够产生大量的丁酸 盐、甲酸盐和少量D-乳酸盐. 2 肠内F. prausnitzii的影响因素 F. prausnitzii在健康人类肠道含量丰富, 在粪 便中微生物的5%, 甚至在有些人群中可高达 15%[6] . 此菌也广泛分布在一些动物胃肠道, 如哺乳动物猪、牛、小鼠和家禽类鸡[7,8] . F. prausnitzii在肠道菌群中的比例受到结肠环境 的影响, 肠道中pH值、胆酸盐和氧含量均可 影响F. prausnitzii的生长[5,9] . 吸烟和要素饮食 可降低其在肠道中的含量[10] , 肠镜检查前服用 聚乙二醇400清肠后肠黏膜相关F. prausnitzii也 会降低. 一些药物的使用也会影响F. prausnitzii 在肠道中的含量, 利福昔明可以提高肠道F. prausnitzii含量[11] , 英夫利昔和大剂量的皮质醇 激素也可逆转活动性克罗恩病(Crohn's disease, CD)患者粪便中降低的F. prausnitzii [12] . 某些基 因的缺失也可影响肠道菌群的变化, 动物实验 显示NOD2基因敲除小鼠的回肠和盲肠中黏膜 相关F. prausnitzii的数量明显减少[13] . 3 F. prausnitzii的抗炎机制 F. prausnitzii及其培养上清能够减轻三硝基苯 磺酸(trinitro-benzene-sulfonic acid, TNBS)诱导 的肠道炎症[1] , 具有明确的抗炎效应, 其抗炎效 应与调节机体免疫有关. 一个可能的机制是抑 制机体核因子-κB(nuclear factor-κB, NF-κB)的 活性, NF-κB是参与免疫和炎症的重要转录因 子, 其激活后可促进促炎介质的表达. Sokol等[2] 发现F. prausnitzii培养上清可抑制Caco-2细胞 白介素(interleukin, IL)-1β诱导的NF-κB的活性 和IL-8的分泌; 另一个免疫因素是F. prausnitzii 能够诱导外周血单个核细胞生成大量抗炎因 子IL-10, 维持肠道的生态稳定, IL-10可抑制 干扰素-γ(interferon-γ, IFN-γ)、肿瘤坏死因子 -α(tumour necrosis factor-α, TNF-α)、IL-6、 IL-12炎性因子的产生, 诱导肠黏膜 Treg细胞 的生成和抑制炎症的作用. Rossi等[14] 也通过 体内外研究证实F. prausnitzii A2-165能促进 ■相关报道 S o k o l等认为F. prausnitzii培养上 清可抑制白介素 (interleukin, IL)- 1β诱导的NF-κB 的活性和促炎因 子IL-8的分泌, 且 能够诱导外周血 单个核细胞生成 大 量 抗 炎 因 子 IL-10, 诱导肠黏 膜Treg细胞的生 成和抑制炎症的 作用, 维持肠道 的生态稳定

黄晓丽,等.普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 ■创新盘点 T细胞的增殖和IL-10的分泌,抑制IFNT细 inflammatory molecule,MAM,能够抑制肠上 章多是研究类的胞的分化.近来研究表明 F prausnitz还可以皮细胞中NFκB通路,DNBS诱导的小鼠肠道 文献,本文将目通过临床研究发现人类肠道中树突状细胞炎症 前的最新研究成 果进行了分析( dentritic cell,DC)细胞表达Tol|受体4(Toll 总结,综述了 . like receptor4,TLR4)的数量与水平呈负相关,5 praun与肠道疾病的关系 prausnitz的抗炎 有效成分及发病提示肠道DC的功能可能受此菌的影响吗 51炎症性肠病 F prausnitz的数量在IBD 机制,及其在几 种肠道疾病的作 F prausnitz还可以提高肠黏膜屏障功能.患者肠道中数量较健康人群明显降低,且与 用机制 Carlsson等研究认为 F prausnitz上清还可以疾病的活动性有关.成人克罗恩病( Crohn's 通过影响肠上皮细胞通透性来增强肠道黏膜 disease,CD的粪便和回肠黏膜中 F prausnitz 屏障功能,减轻DS诱导的小鼠结肠和回肠的的数量较健康人群明显减少,活动期CD患 炎症,Lal等体内外研究也发现 :prausnitz者 F prausnitz数量较缓解期明显降低2同 能够提高紧密连接蛋白闭合蛋白和E钙黏蛋白样, Machiels等分析了127例溃疡性结肠炎 来减轻TNF-α诱导的肠黏膜高渗状态 ( ulcerative colitis,UC)患者和87例对照组人群, 发现活动性UC患者肠道中 F prausnitz菌数 4 F prausnitz炎有效成分 量明显低于正常对照人群,且疾病的活动性 F prausnitz与其培养上清具有抗炎效应虽然与 F prausnitz数量呈负相关.也有研究发现 已得到公认,但是何种物质直接影响机体免疫UC患者及其一级亲戚的粪便中 F prausnitz 以及确切的作用机制目前还未阐明.很多研究数量较对照人群明显降低.最近一项关于F 认为 F prausnitz是通过其主要分解产物-丁酸 prausnItz和IBD的Meta分析也显示BD患者粪 盐起作用的, F prausnitz能够通过发酵葡萄便和肠道中 F prausnitz均降低,特别是回肠病 糖产生大量的丁酸盐, F prausnitz培养上清变的CD患者最为明显有研究认为儿童CD患 中含有大量的丁酸盐.丁酸盐可为肠上皮细者粪便中 Praun/是升高而不是降低的,很 胞提供能量,通过增加紧密蛋白的合成增强肠可能与儿童的肠道微生态与成人不同有关 道黏膜屏障功能,对保持肠道健康起着重要作也提示炎症性肠病是一种多因素病变,不同的 用丁酸盐还可通过抑制乙酰化酶的活性,使病变部位、不同发病年龄和严重程度的不同 组蛋白高乙酰化,从而抑制NF-KB的活性,减其发病原因均不尽相同 少IL-8的生成,调节机体免疫;可通过促进组 F prausnitz在IBD患者肠道中数量与病 蛋白乙酰化影响基因表达,诱导肿瘤细胞大量变严重程度、治疗和预后也有明显的相关性 凋亡,可以抑制亚硝铵和过氧化氢对机体的毒 Sokol等研究发现CD经手术治疗患者中,术 性作用,具有抗肿瘤作用.但有研究显示与F后6mo内复发者术前和术后6mo肠道黏膜相 prausnItz上清中含量相当的丁酸盐并不能完关 F prausnitz数量均较术后6mo内未复发的 全替代 F prausnitz清发挥其抗炎作用,提患者明显降低. Varela等的一项横断面研究 示 F prausnitz上清中可能存在其他代谢产物发现UC患者给5-ASA治疗后病情得到稳定缓 发挥着重要的作用Ross1等从HTFF菌株提解的患者肠道中 E prausnitz数量逐渐增加,那 取的胞外聚合物基体( extracellular poly meric些肠道中 F prausnitz数量不能增高的患者存 matrIx,EPM)具有抗炎效应,能够通过调节∏LR2在着较高疾病复发风险,多见于病情严重的、 依赖的调节抗原递呈细胞II-12和IL-10细胞因病变范围广泛、缓解期短暂、有频繁复发史 子的释放,来达到抗炎作用 Miquel等研究认者, F prausnitz在肠道的高定植可阻止疾病的 为水杨酸作为 E prausnitz代谢产物之一能够复发,改善疾病的预后 抑制IL8细胞因子的释放,发挥与 F prausnitz52肠易激综合征肠易激综合征 (irritable bowel 上清和丁酸盐相似的抗炎作用,而 F prausnitz syndrome,IBS)是以慢性复发性腹痛、腹泻 的其他代谢产物莽草酸、棉子糖和α-酮戊二排便习惯和大便性状异常为主要临床表现的 酸均无明显抗炎作用. Quevrain最近成功功能性肠道疾病.目前有研究认为肠道菌群失 从 F prausnitz上清中分离出一种15kDa的蛋调与IBS的发生及临床症状密切相关IBS患 白,将其命名为微生物抗炎分子( microbial anti-者肠道中厚壁菌门和拟杆菌比例较健康人群 . 5Aishideng 2017-03-28I Volume 25 Issue 9 I

黄晓丽, 等. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 WCJD|www.wjgnet.com 812 2017-03-28|Volume 25|Issue 9| T细胞的增殖和IL-10的分泌, 抑制IFN-γ + T细 胞的分化. 近来研究表明F. prausnitzii还可以 通过临床研究发现人类肠道中树突状细胞 (dentritic cell, DC)细胞表达Toll样受体4(Toll￾like receptor 4, TLR4)的数量与水平呈负相关, 提示肠道DC的功能可能受此菌的影响[15] . F. prausnitzii还可以提高肠黏膜屏障功能. Carlsson等[16] 研究认为F. prausnitzii上清还可以 通过影响肠上皮细胞通透性来增强肠道黏膜 屏障功能, 减轻DSS诱导的小鼠结肠和回肠的 炎症. Laval等[17] 体内外研究也发现F. prausnitzii 能够提高紧密连接蛋白闭合蛋白和E-钙黏蛋白 来减轻TNF-α诱导的肠黏膜高渗状态. 4 F. prausnitzii抗炎有效成分 F. prausnitzii与其培养上清具有抗炎效应虽然 已得到公认, 但是何种物质直接影响机体免疫 以及确切的作用机制目前还未阐明. 很多研究 认为F. prausnitzii是通过其主要分解产物-丁酸 盐起作用的, F. prausnitzii能够通过发酵葡萄 糖产生大量的丁酸盐, F. prausnitzii培养上清 中含有大量的丁酸盐[18] . 丁酸盐可为肠上皮细 胞提供能量, 通过增加紧密蛋白的合成增强肠 道黏膜屏障功能, 对保持肠道健康起着重要作 用[1] . 丁酸盐还可通过抑制乙酰化酶的活性, 使 组蛋白高乙酰化, 从而抑制NF-κB的活性, 减 少IL-8的生成, 调节机体免疫; 可通过促进组 蛋白乙酰化影响基因表达, 诱导肿瘤细胞大量 凋亡, 可以抑制亚硝铵和过氧化氢对机体的毒 性作用, 具有抗肿瘤作用. 但有研究显示与F. prausnitzii上清中含量相当的丁酸盐并不能完 全替代F. prausnitzii上清发挥其抗炎作用[1] , 提 示F. prausnitzii上清中可能存在其他代谢产物 发挥着重要的作用. Rossi等[19] 从HTF-F菌株提 取的胞外聚合物基体(extracellular polymeric matrix, EPM)具有抗炎效应, 能够通过调节TLR2 依赖的调节抗原递呈细胞IL-12和IL-10细胞因 子的释放, 来达到抗炎作用. Miquel等[20] 研究认 为水杨酸作为F. prausnitzii代谢产物之一能够 抑制IL-8细胞因子的释放, 发挥与F. prausnitzii 上清和丁酸盐相似的抗炎作用, 而F. prausnitzii 的其他代谢产物莽草酸、棉子糖和α-酮戊二 酸均无明显抗炎作用. Quévrain[21] 最近成功 从F. prausnitzii上清中分离出一种15 kDa的蛋 白, 将其命名为微生物抗炎分子(microbial anti￾inflammatory molecule, MAM), 能够抑制肠上 皮细胞中NF-κB通路, DNBS诱导的小鼠肠道 炎症. 5 F. prausnitzii与肠道疾病的关系 5.1 炎症性肠病 F. prausnitzii的数量在IBD 患者肠道中数量较健康人群明显降低, 且与 疾病的活动性有关. 成人克罗恩病(Cr o h n's disease, CD)的粪便和回肠黏膜中F. prausnitzii 的数量较健康人群明显减少, 活动期C D患 者F. prausnitzii数量较缓解期明显降低[22] . 同 样, Machiels等[23] 分析了127例溃疡性结肠炎 (ulcerative colitis, UC)患者和87例对照组人群, 发现活动性UC患者肠道中F. prausnitzii 菌数 量明显低于正常对照人群, 且疾病的活动性 与F. prausnitzii数量呈负相关. 也有研究发现 UC患者及其一级亲戚的粪便中F. prausnitzii 数量较对照人群明显降低[24] . 最近一项关于F. prausnitzii和IBD的Meta分析也显示IBD患者粪 便和肠道中F. prausnitzii均降低, 特别是回肠病 变的CD患者最为明显[25] . 有研究认为儿童CD患 者粪便中F. prausnitzii是升高而不是降低的, 很 可能与儿童的肠道微生态与成人不同有关[26] . 也提示炎症性肠病是一种多因素病变, 不同的 病变部位、不同发病年龄和严重程度的不同, 其发病原因均不尽相同. F. prausnitzii在IBD患者肠道中数量与病 变严重程度、治疗和预后也有明显的相关性. Sokol等[2] 研究发现CD经手术治疗患者中, 术 后6 mo内复发者术前和术后6 mo肠道黏膜相 关F. prausnitzii数量均较术后6 mo内未复发的 患者明显降低. Varela等[24] 的一项横断面研究 发现UC患者给5-ASA治疗后病情得到稳定缓 解的患者肠道中F. prausnitzii数量逐渐增加, 那 些肠道中F. prausnitzii数量不能增高的患者存 在着较高疾病复发风险, 多见于病情严重的、 病变范围广泛、缓解期短暂、有频繁复发史 者. F. prausnitzii在肠道的高定植可阻止疾病的 复发, 改善疾病的预后. 5.2 肠易激综合征 肠易激综合征(irritable bowel syndrome, IBS)是以慢性复发性腹痛、腹泻、 排便习惯和大便性状异常为主要临床表现的 功能性肠道疾病. 目前有研究认为肠道菌群失 调与IBS的发生及临床症状密切相关[27] . IBS患 者肠道中厚壁菌门和拟杆菌比例较健康人群 ■创新盘点 以前有关此类文 章多是研究类的 文献, 本文将目 前的最新研究成 果 进 行 了 分 析 总结, 综述了F. prausnitzii的抗炎 有效成分及发病 机制, 及其在几 种肠道疾病的作 用机制

黄晓丽,等.普拉梭菌与肠道疾病关系的硏究进展 升高了2倍2有研究认为IBD的不同类型也泄、慢性自发性腹泻、急性阑尾炎例、■应用要点 与 F prawn相关,腹泻便秘相交替的B$中肠道神经内分泌肿瘤的患者肠道或粪便中F年pMm与 F prausnitz的数量明显下降,而腹泻型和便秘 prausnItz含量较健康人群均有明显下降. 肠道疾病发生的 型IBS未见减少剛 Lopez-Siles等圆用qPCR方 相关性,分析了 其抗炎机制、作 法检测了45例CD患者、28例UC、10例IBS及6讨论 用有效成分.相 28例对照组人群黏膜相关 prausnItz和大肠 F prausnItz是肠道中不可缺少的一种潜在益psm或将成 杆菌,发现BD患者 F prausnitz明显低于IBS,生菌,其细菌本身和培养上清均具有抗炎作用.为治疗肠道病变, 而大肠杆菌高于IBS.Sold等用 RT-PCR 着对其研究的深入,抗炎有效成分的不断发病的重要手段 变性梯度凝胶电泳技术和新一代测序技术检现相信不久的将来补充 prausnItz的某种有 测了15例非便秘型1BS和健康人群患者粪便效代谢产物将会成为治疗肠道病变尤其是炎 中微生物群的组成和差异,发现IBS患者粪便症性肠病的重要手段 中 Faecalibacterium菌属的比例高于健康人群 7参考文献 (4.42%vs5.66%),使用利福昔明治疗14d后 1 Arumugam M, Raes J, Pelletier E, Le Paslier D, 腹泻症状缓解, Faecalibacteriun比例明显升高 Yamada T, Mende dr, Fernandes Gr, Tap j (T4:8.50%WsTo.5.58%) F prausnmitzil还可通 Bruls T, Batto JM, Bertalan M, Borruel N, Casellas 过增强肠道上皮屏障功能,降低由于压力所致 F Fernandez l gautier L hansen T, Hattori M Hayashi T, Kleerebezem M, Kurokawa K, Lecler 的IBS肠道高敏性,从而缓解IBS小鼠内脏疼 A, Levenez f, manichanh C Nielsen HB, Nielsen 痛,但上清无镇痛作用 T, Pons N, Poulain J, Qin J, Sicheritz-Ponten T Tims S, Torrents D, Ugarte E, Zoetendal EG, 53结直肠癌 F prausnitz在肠癌患者的肠道 Wang J, Guarner F, Pedersen O, de Vos WM, 分布较健康人群存在差异. Lopez-Siles等用 Brunak S, Dore J, Antolin M, Artiguenave F lottiere HM, Almeida M, Brecht C, Cara C qPCR方法检测了20例结直肠癌患者肠黏膜 Chervaux C, Cultrone A, Delorme C, Venaria 相关 F prausnitz含量,发现肠癌的肠道黏膜 G, Dervyn R, Foerstner KU, Friss C, van de Guchte M, Guedon E, Haimet F, Huber w,van 组织 E prausnitz的含量较健康对照组明显降 Hvlckama-V J, Jamet A, Juste C, Kaci G, Kno 低 Balamurugan等用16 SIrNA测序技术检 Lakhdari O, Layec S, Le Roux K, Maguin E, Merieux A, Melo Minardi R, Mrini C Muller 测了20例结直肠癌、9例上消化道肿瘤和17 J, Oozeer R, Parkhill J, Renault P, Rescigno M, 例健康自愿者粪便中细菌的种类,结果发现 Sanchez N, Sunagawa S, Torrejon A, Turner K, Vandemeulebrouck G, Varela E, Winogradsky 结直肠癌患者粪便中产丁酸盐的直肠真杆菌 Y, Zeller G, Weissenbach J, Ehrlich SD, Bork P. ( Eubacterium rectale)和 F prausnitz的含量较 Enterotypes of the human gut microbiome Natie 211;473:174-180[PMID:21508958DO:10.1038/ 健康自愿者明显减少. F prausnitz的重要产物 之一丁酸盐除了抗炎作用外,还可通过促进组 2 Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, Lakhdari O, Bermudez-Humaran LG, Gratadoux J, Blugeon 蛋白乙酰化影响基因表达,诱导肿瘤细胞大量 Bridonneau C, Furet JP, Corthier G, Grangette 凋亡,并抑制亚硝铵和过氧化氢对结肠细胞的 C, Vasquez N, Pochart P, Trugnan G, Thomas G, Blottiere HM, Dore J, Marteau P, Seksik 毒性作用,具有抗肿瘤作用,故肠道 F prausnitz P, Langella P Faecalibacterium prausnitzii is 的减少与结直肠癌的发病存在一定的相关性 an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn 但也有研究发现结直肠癌及腺瘤性息肉病患者 肠道柔嫩梭菌和球形梭菌明显增加, Sobhan 105:16731-16736[PMID.1896492DO:10.1073/ 等检测了60例肠癌患者和19例正常人群的3 Wang RF, Cao ww, Cerniglia CE. Phylogenetic 粪便微生物DNA,认为肠癌患者中 Fprausnitzll nalysis of Fusobacterium prausnitzii based upon the 16s rRNa gene sequence and PCR 属与正常患者之间无明显统计学差异,而拟 confirmation. Int J Syst Bacteriol 1996; 46 341-343 杆菌和普氏杆菌在肠癌人群中明显升高.F PMD:8573517DOl:10.1099/00207713-46-1-341 Suau A, Bonnet R, Sutren M, Godon J, Gibson prausnInZll在肠癌患者肠道中的分布还一定的争 GR, Collins MD, Dore J. Direct analysis of gene 议,造成各研究结果差异的原因不明,临床均为 coding 16s rRNA from complex communities als manv nove s within 小样本研究,有待大样本研究进一步明确. the human gut. Appl Environ Microbiol 1999;65 54 F Prausnitz与其他肠道疾病的关系F 4799-4807[PMID:10543789 prausnitz在其他肠道疾病中也有改变,乳糜5 ncan SH, Hold GL, Harmsen1 Stewart CS 813 2017-03-28 I Volume 25 Issue 9 I

黄晓丽, 等. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 WCJD|www.wjgnet.com 813 2017-03-28|Volume 25|Issue 9| 升高了2倍[28] . 有研究认为IBD的不同类型也 与F. prausnitzii相关, 腹泻便秘相交替的IBS中 F. prausnitzii的数量明显下降, 而腹泻型和便秘 型IBS未见减少[29] . Lopez-Siles等[30] 用qPCR方 法检测了45例CD患者、28例UC、10例IBS及 28例对照组人群黏膜相关F. prausnitzii和大肠 杆菌, 发现IBD患者F. prausnitzii明显低于IBS, 而大肠杆菌高于IBS. Soldi等[31] 用RT-PCR、 变性梯度凝胶电泳技术和新一代测序技术检 测了15例非便秘型IBS和健康人群患者粪便 中微生物群的组成和差异, 发现IBS患者粪便 中Faecalibacterium菌属的比例高于健康人群 (4.42% vs 5.66%),使用利福昔明治疗14 d后, 腹泻症状缓解, Faecalibacterium比例明显升高 (T14: 8.50% vs T0: 5.58%). F. prausnitzii还可通 过增强肠道上皮屏障功能, 降低由于压力所致 的IBS肠道高敏性, 从而缓解IBS小鼠内脏疼 痛, 但上清无镇痛作用[32] . 5.3 结直肠癌 F. prausnitzii在肠癌患者的肠道 分布较健康人群存在差异. Lopez-Siles等[33] 用 qPCR方法检测了20例结直肠癌患者肠黏膜 相关F. prausnitzii含量, 发现肠癌的肠道黏膜 组织F. prausnitzii的含量较健康对照组明显降 低. Balamurugan等[34] 用16SrRNA测序技术检 测了20例结直肠癌、9例上消化道肿瘤和17 例健康自愿者粪便中细菌的种类, 结果发现 结直肠癌患者粪便中产丁酸盐的直肠真杆菌 (Eubacterium rectale )和F. prausnitzii的含量较 健康自愿者明显减少. F. prausnitzii的重要产物 之一丁酸盐除了抗炎作用外, 还可通过促进组 蛋白乙酰化影响基因表达, 诱导肿瘤细胞大量 凋亡, 并抑制亚硝铵和过氧化氢对结肠细胞的 毒性作用, 具有抗肿瘤作用, 故肠道F. prausnitzii 的减少与结直肠癌的发病存在一定的相关性. 但也有研究发现结直肠癌及腺瘤性息肉病患者 肠道柔嫩梭菌和球形梭菌明显增加[35] , Sobhani 等[36] 检测了60例肠癌患者和119例正常人群的 粪便微生物DNA, 认为肠癌患者中F. prausnitzii 属与正常患者之间无明显统计学差异, 而拟 杆菌和普氏杆菌在肠癌人群中明显升高. F. prausnitzii在肠癌患者肠道中的分布还一定的争 议, 造成各研究结果差异的原因不明, 临床均为 小样本研究, 有待大样本研究进一步明确. 5.4 F. Prausnitzii与其他肠道疾病的关系 F. prausnitzii在其他肠道疾病中也有改变, 乳糜 泄[37] 、慢性自发性腹泻[38] 、急性阑尾炎[39] 、 肠道神经内分泌肿瘤[11] 的患者肠道或粪便中F. prausnitzii含量较健康人群均有明显下降. 6 讨论 F. prausnitzii是肠道中不可缺少的一种潜在益 生菌, 其细菌本身和培养上清均具有抗炎作用. 随着对其研究的深入, 抗炎有效成分的不断发 现, 相信不久的将来补充F. prausnitzii的某种有 效代谢产物将会成为治疗肠道病变, 尤其是炎 症性肠病的重要手段. 7 参考文献 1 Arumugam M, Raes J, Pelletier E, Le Paslier D, Yamada T, Mende DR, Fernandes GR, Tap J, Bruls T, Batto JM, Bertalan M, Borruel N, Casellas F, Fernandez L, Gautier L, Hansen T, Hattori M, Hayashi T, Kleerebezem M, Kurokawa K, Leclerc M, Levenez F, Manichanh C, Nielsen HB, Nielsen T, Pons N, Poulain J, Qin J, Sicheritz-Ponten T, Tims S, Torrents D, Ugarte E, Zoetendal EG, Wang J, Guarner F, Pedersen O, de Vos WM, Brunak S, Doré J, Antolín M, Artiguenave F, Blottiere HM, Almeida M, Brechot C, Cara C, Chervaux C, Cultrone A, Delorme C, Denariaz G, Dervyn R, Foerstner KU, Friss C, van de Guchte M, Guedon E, Haimet F, Huber W, van Hylckama-Vlieg J, Jamet A, Juste C, Kaci G, Knol J, Lakhdari O, Layec S, Le Roux K, Maguin E, Mérieux A, Melo Minardi R, M'rini C, Muller J, Oozeer R, Parkhill J, Renault P, Rescigno M, Sanchez N, Sunagawa S, Torrejon A, Turner K, Vandemeulebrouck G, Varela E, Winogradsky Y, Zeller G, Weissenbach J, Ehrlich SD, Bork P. Enterotypes of the human gut microbiome. Nature 2011; 473: 174-180 [PMID: 21508958 DOI: 10.1038/ nature09944] 2 Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, Lakhdari O, Bermúdez-Humarán LG, Gratadoux JJ, Blugeon S, Bridonneau C, Furet JP, Corthier G, Grangette C, Vasquez N, Pochart P, Trugnan G, Thomas G, Blottière HM, Doré J, Marteau P, Seksik P, Langella P. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. Proc Natl Acad Sci USA 2008; 105: 16731-16736 [PMID: 18936492 DOI: 10.1073/ pnas.0804812105] 3 Wang RF, Cao WW, Cerniglia CE. Phylogenetic analysis of Fusobacterium prausnitzii based upon the 16S rRNA gene sequence and PCR confirmation. Int J Syst Bacteriol 1996; 46: 341-343 [PMID: 8573517 DOI: 10.1099/00207713-46-1-341] 4 Suau A, Bonnet R, Sutren M, Godon JJ, Gibson GR, Collins MD, Doré J. Direct analysis of genes encoding 16S rRNA from complex communities reveals many novel molecular species within the human gut. Appl Environ Microbiol 1999; 65: 4799-4807 [PMID: 10543789] 5 Duncan SH, Hold GL, Harmsen HJ, Stewart CS, Flint HJ. Growth requirements and fermentation ■应用要点 本文总结了近几 年F. prausnitzii与 肠道疾病发生的 相关性, 分析了 其抗炎机制、作 用有效成分. 相 信不久的将来, F. prausnitzii或将成 为治疗肠道病变, 尤其是炎症性疾 病的重要手段

黄晓丽,等.普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 ■名词斛释 products of Fusobacterium prausnitzii, and a Louis P. Effect of inulin on the human 微生态失衡;肠道 proposal to reclassify it as Faecalibacterium iota, stimulation of bifidobacterium 菌群素乱指人体 肠道内致病菌和 comb. nov. Int) Syst Evol and Faecalibacterium prausnitz. Br Microbiol2002;52:2141-2146[PMID:12508881 101:541-550[PMD:18590586DO 益生菌的比例失 DO:10.1099/00207713-52-6-214 10.1017/50007114508019880 调致病菌、条件6 Hold GL, Schwiertz A, Aminov ri, Blaut m,16 Carlsson ah, Yakymenko c, Olivier I 致病菌的数量增 多,而益生菌数量 Flint HJ. Oligonucleotide probes that detect Hakansson F, Postma E, Keita AV, Soderholm JD. quantitatively significant groups of butyrate- Faecalbacterium prausnitzii supernatant improve 肠黏膜屏障:指肠 producing bacteria in human feces. Appl Environ intestinal barrier function in mice dss colitis. Saund Microbio200369:4320-4324[PMD:12839823 J Gastroenterol 2013 48: 1136-1144 [PMID: 23971882 的有害物质如细7 Nava GM, Tappenbeck TS. Diversity of the DOL10.3109/003655212013.828773 菌和毒素穿过肠 utochthonous colonic microbiota Gut Microbes 17 Laval L, Martin R, Natividad JN, Chain F, 黏膜进入人体内 其他组织、器官8 Oikonomou g, Teixeira AG, Foditsch C S, Sokol H, Verdu EF, van Hylckama Vlieg JE, 和血液循环的结 Bicalho ML, Machado vs, Bicalho RC. Fecal Bermudez-Humaran LG, Smokvina T, Langella 构和功能的总和 microbial diversity in pre-weaned dairy calves P. Lactobacillus rhamnosus CNCM 1-3690 and the commensal bacterium Faecalibacteriu 16s rDNA. Associations of Faecalibacterium prausnitzii A2-165 exhibit similar protective species with health and growth. PLos One 2013: effects to induced barrier hyper-permeability in 8:e63157[PMID:23646192DO:101371/ journal mice. Gut Microbes 2015: 6: 1-9 [PMID: 25517879 pone.0063157 DOI10.4161/194909762014990784 9 Lopez-Siles M, Khan TM, Duncan SH, 18 Louis P, Flint HJ. Diversity, metabolism and Harmsen H, Garcia-Gil LJ, Flint H. Cultured microbial ecology of butyrate-producing bacteri from the human large intestine. FEMS Microbi human colonic Faecalibacterium prausnitzii can et2009294:1-8[PMD:1922573DO:10.11 utilize pectin, cids, and host-derive 1574-6968200901514x] ubstrates for Appl Environ Microbiol 19 Rossi O, Khan MT, Schwarzer M, Hudcovic T 201278:420428PMID:22101049DO:10.1128/ utkova D. duncan sh Stolte eh, Kozakova AEM06858-11 H, Flint H, Samsom JN, Harmsen H, Wells JM. 10 Benus RF, van der Werf TS, Welling Gw Faecalibacterium prausnitzii Strain HTF-F and Judd PA, Taylor MA, Harmsen HJ, Whelan K Its Extracellular Polymeric Matrix Attenuate Association between Faecalibacterium prausnitz Clinical Parameters in DSS-Induced Colitis. PLos and dietary fibre in colonic fermentation One2015;10:e0123013PMID:25910186DOl: in healthy human subjects. Br) Nutr 2010 104: 693-700 [PMID: 20346190 DOI: 10.1017/ 20 Miquel S, Leclerc M, Martin R, Chain E, Lenoir M, 0007114510001030 Raguideau S, Hudault S, Bridonneau C, Northen 11 DOrffel Y, Swidsinski A, Loening-Baucke V T, Bowen B, Bermudez-Humaran LG, Sokol H Wiedenmann B, Pavel M. Common biostructure Thomas M, Langella P. Identification of metabolic of the colonic microbiota signatures linked to anti-inflammatory effects tumors and Crohn's disease and the effect of of Faecalibacterium prausnitzii MBio 2015; 6 therapy. Inflamm Bowel Dis 2012; 18: 1663-1671 e00300-15[PMID:25900655DOI:10.1128/ [PMD2213988DO:10.1002/ibd21923 12 Swidsinski A, Loening-Baucke V, Vaneechoutte 21 Quevrain E, Maubert MA, Michon C, Chain F, M, Doerffel Y. Active Crohn's disease and R, Tailhades J lel S, Carlier L, and monitored based on the biostructure of the O, Kharrat P, Thomas G, Rainteau D, Aubry fecal flora. Inflamm Bowel Dis 2008: 14: 147-161 N Afonso c lavelle s, grill PMD:18050295DOl:10.1002/ibd.20330 Chassaing G, Chatel JM, Trugnan G, Xavier R, 13 Li E, Hamm CM, Gulati As, Sartor RB, Chen Langella P, Sokol H, Seksik P. Identification of an H, Wu X, Zhang T, Rohlf FJ, Zhu W, Gu C, anti-inflammatory protein from Faecalibacterium Robertson CE, Pace NR, Boedeker EC, Harpaz prausnitzii, a commensal bacterium deficient in N, Yuan J, Weinstock GM, Sodergren E, Frank Crohns disease. Gut 2016; 65: 415-425 [PMID DN. Inflammatory bowel diseases phenotype, 26045134DOL10.1136/ guting-2014-307649 C difficile and NOD2 genotype ssociated 22 Martinez-Medina M, Aldeguer X, Gonzalez-Huix with shifts in human ileum associated microbial F, Acero D, Garcia-Gil L. Abnormal microbiota omposition. PLos One 2012; 7: e26284 [PMID: omposition in the ileocolonic mucosa of Crohn 22719818DO:10.1371/ journal. pone:0026284 s disease patients as revealed by polymerase chain 14 Rossi O, van Berkel LA, Chain F, Tanweer Khan reaction-denaturing gradient gel electrophoresis M. Taverne n sokol h duncan sh Flint h am Bowel Dis 2006; 12: 1136-1145 [PMID: Harmsen H, Langella P, Samsom JN, Wells JM. 17119388DOl:10.1097/01mib00003582809050 Faecalibacterium prausnitzii A2-165 has a high 23 Machiels K, Joossens M, Sabino J, De Preter apacity to induce IL-10 in human and murine V, Arijs I, Eeckhaut V, Ballet V, Claes K, va dendritic cells and modulates T cell responses. Sci Immerseel F, Verbeke K, Ferrante M, Verhaegen p20166:18507PMID26725514DO:10.1038/ J, Rutgeerts P, Vermeire S. A decrease of the utvrat 15 Ramirez-Farias C Slezak K Fuller Z Duncan A, and Faecalibacterium prausnitzii defines . 5Aishideng 814 2017-03-28I Volume 25 Issue 9 I

黄晓丽, 等. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 WCJD|www.wjgnet.com 814 2017-03-28|Volume 25|Issue 9| products of Fusobacterium prausnitzii, and a proposal to reclassify it as Faecalibacterium prausnitzii gen. nov., comb. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2002; 52: 2141-2146 [PMID: 12508881 DOI: 10.1099/00207713-52-6-2141] 6 Hold GL, Schwiertz A, Aminov RI, Blaut M, Flint HJ. Oligonucleotide probes that detect quantitatively significant groups of butyrate￾producing bacteria in human feces. Appl Environ Microbiol 2003; 69: 4320-4324 [PMID: 12839823] 7 Nava GM, Stappenbeck TS. Diversity of the autochthonous colonic microbiota. Gut Microbes 2011; 2: [PMID: 21637026] 8 Oikonomou G, Teixeira AG, Foditsch C, Bicalho ML, Machado VS, Bicalho RC. Fecal microbial diversity in pre-weaned dairy calves as described by pyrosequencing of metagenomic 16S rDNA. Associations of Faecalibacterium species with health and growth. PLoS One 2013; 8: e63157 [PMID: 23646192 DOI: 10.1371/journal. pone.0063157] 9 L o p e z - S i l e s M , K h a n T M , D u n c a n S H , Harmsen HJ, Garcia-Gil LJ, Flint HJ. Cultured representatives of two major phylogroups of human colonic Faecalibacterium prausnitzii can utilize pectin, uronic acids, and host-derived substrates for growth. Appl Environ Microbiol 2012; 78: 420-428 [PMID: 22101049 DOI: 10.1128/ AEM.06858-11] 10 Benus RF, van der Werf TS, Welling GW, Judd PA, Taylor MA, Harmsen HJ, Whelan K. Association between Faecalibacterium prausnitzii and dietary fibre in colonic fermentation in healthy human subjects. Br J Nutr 2010; 104: 693-700 [PMID: 20346190 DOI: 10.1017/ S0007114510001030] 11 Dörffel Y, Swidsinski A, Loening-Baucke V, Wiedenmann B, Pavel M. Common biostructure of the colonic microbiota in neuroendocrine tumors and Crohn’s disease and the effect of therapy. Inflamm Bowel Dis 2012; 18: 1663-1671 [PMID: 22113988 DOI: 10.1002/ibd.21923] 12 Swidsinski A, Loening-Baucke V, Vaneechoutte M, Doerffel Y. Active Crohn’s disease and ulcerative colitis can be specifically diagnosed and monitored based on the biostructure of the fecal flora. Inflamm Bowel Dis 2008; 14: 147-161 [PMID: 18050295 DOI: 10.1002/ibd.20330] 13 Li E, Hamm CM, Gulati AS, Sartor RB, Chen H, Wu X, Zhang T, Rohlf FJ, Zhu W, Gu C, Robertson CE, Pace NR, Boedeker EC, Harpaz N, Yuan J, Weinstock GM, Sodergren E, Frank DN. Inflammatory bowel diseases phenotype, C. difficile and NOD2 genotype are associated with shifts in human ileum associated microbial composition. PLoS One 2012; 7: e26284 [PMID: 22719818 DOI: 10.1371/journal.pone.0026284] 14 Rossi O, van Berkel LA, Chain F, Tanweer Khan M, Taverne N, Sokol H, Duncan SH, Flint HJ, Harmsen HJ, Langella P, Samsom JN, Wells JM. Faecalibacterium prausnitzii A2-165 has a high capacity to induce IL-10 in human and murine dendritic cells and modulates T cell responses. Sci Rep 2016; 6: 18507 [PMID: 26725514 DOI: 10.1038/ srep18507] 15 Ramirez-Farias C, Slezak K, Fuller Z, Duncan A, Holtrop G, Louis P. Effect of inulin on the human gut microbiota: stimulation of Bifidobacterium adolescentis and Faecalibacterium prausnitzii. Br J Nutr 2009; 101: 541-550 [PMID: 18590586 DOI: 10.1017/S0007114508019880] 16 C a r l s s o n A H , Y a k y m e n k o O , O l i v i e r I , Håkansson F, Postma E, Keita AV, Söderholm JD. Faecalibacterium prausnitzii supernatant improves intestinal barrier function in mice DSS colitis. Scand J Gastroenterol 2013; 48: 1136-1144 [PMID: 23971882 DOI: 10.3109/00365521.2013.828773] 17 Laval L, Martin R, Natividad JN, Chain F, Miquel S, Desclée de Maredsous C, Capronnier S, Sokol H, Verdu EF, van Hylckama Vlieg JE, Bermúdez-Humarán LG, Smokvina T, Langella P. Lactobacillus rhamnosus CNCM I-3690 and the commensal bacterium Faecalibacterium prausnitzii A2-165 exhibit similar protective effects to induced barrier hyper-permeability in mice. Gut Microbes 2015; 6: 1-9 [PMID: 25517879 DOI: 10.4161/19490976.2014.990784] 18 Louis P, Flint HJ. Diversity, metabolism and microbial ecology of butyrate-producing bacteria from the human large intestine. FEMS Microbiol Lett 2009; 294: 1-8 [PMID: 19222573 DOI: 10.1111/ j.1574-6968.2009.01514.x] 19 Rossi O, Khan MT, Schwarzer M, Hudcovic T, Srutkova D, Duncan SH, Stolte EH, Kozakova H, Flint HJ, Samsom JN, Harmsen HJ, Wells JM. Faecalibacterium prausnitzii Strain HTF-F and Its Extracellular Polymeric Matrix Attenuate Clinical Parameters in DSS-Induced Colitis. PLoS One 2015; 10: e0123013 [PMID: 25910186 DOI: 10.1371/journal.pone.0123013] 20 Miquel S, Leclerc M, Martin R, Chain F, Lenoir M, Raguideau S, Hudault S, Bridonneau C, Northen T, Bowen B, Bermúdez-Humarán LG, Sokol H, Thomas M, Langella P. Identification of metabolic signatures linked to anti-inflammatory effects of Faecalibacterium prausnitzii. MBio 2015; 6: pii e00300-15 [PMID: 25900655 DOI: 10.1128/ mBio.00300-15] 21 Quévrain E, Maubert MA, Michon C, Chain F, Marquant R, Tailhades J, Miquel S, Carlier L, Bermúdez-Humarán LG, Pigneur B, Lequin O, Kharrat P, Thomas G, Rainteau D, Aubry C, Breyner N, Afonso C, Lavielle S, Grill JP, Chassaing G, Chatel JM, Trugnan G, Xavier R, Langella P, Sokol H, Seksik P. Identification of an anti-inflammatory protein from Faecalibacterium prausnitzii, a commensal bacterium deficient in Crohn’s disease. Gut 2016; 65: 415-425 [PMID: 26045134 DOI: 10.1136/gutjnl-2014-307649] 22 Martinez-Medina M, Aldeguer X, Gonzalez-Huix F, Acero D, Garcia-Gil LJ. Abnormal microbiota composition in the ileocolonic mucosa of Crohn’ s disease patients as revealed by polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis. 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黄晓啊,等.普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 dysbiosis in patients with ulcerative colitis irritable bowel syndrome patients: a molecular■间行评价 ut2014;63:1275-1283[PMID:24021287DOl approach. Clin Exp Gastroenterol 2015; 8: 309-325 F. prausnitziif PMD26673000DO:10.2147/CEG58999为人类最丰富的 24 Varela E, Manichanh C, Gallart M, Torrejon A32 Miquel S, Martin r, Lashermes a, Gillet M,肠道共生菌之 Borruel N, Casellas F, Guarner F, Antolin M Meleine M, Gelot A, Eschalier A, Ardid D, ,其在肠道疾 Colonisation by Faecalibacterium prausnitzii and Bermudez.Humaran Lg, Sokol h, Thomas m,病中所起的作用 naintenance of clinical remission in patients with Theodorou V, Langella P, Carvalho FA.Anti.越来越引起人们 ulcerative colitis. Aliment Pharmacol Trer 2013: 38 nociceptive effect of Faecalibacterium prausnitzii 151-161|PMID:23725320DO:10.111apt12365」 in non-inflammatory IBS-like models. Sci Rep prausnizln的作用 Cao Y, Shen J, Ran ZH. Association between 20166:19399PMD:26775847DO:10.1038/机制、抗炎有效 Faecalibacterium prausnitzii Reduction and 成分以及与肠道 nflammatory Bowel Disease: A Meta-Analysis3 opez-Siles M, Martinez-Medina M, Suris-valls的关的研 and Systematic Review of the Literature Gastroenterol Res Pract 2014; 2014: 872725 [PMID: R, Aldeguer X, Sabat-Mir M, Duncan SH, Flin系统的综逑,有 HJ, Garcia-Gil LJ Changes in the Abundance of理论和实用价值 24799893DO:10.1155/2014/872725 Faecalibacterium prausnitzii Phylogroups I and II 26 Hansen R, Russell RK, Reiff C Louis P, Mclntosh in the Intestinal Mucosa of Inflammate F, Berry SH, Mukhopadhya I, Bisset WM, Barclay isease and Patients with Colorectal AR, Bishop ), Flynn DM, McGrogan P, Loganathan Inflamm Bowel Dis 2016: 22: 28-41 [PMID S, Mahdi G, Flint H, El-Omar EM, Hold GL DO:10.1097/MIB000000009g Microbiota of de-novo pediatric IBD: increased 34 Balamurugan R, Rajendiran E, George S, Samuel Faecalibacterium prausnitzii and reduced bacterial GV, Ramakrishna BS Real-time polymerase diversity in Crohns but not in ulcerative colitis chain reaction quantification of specific A Gastroenterol 2012: 107: 1913-1922 [PMID: butyrate-producing bacteria, Desulfovibrio and 23044767D /aig2012335 Enterococcus faecalis in the feces of patients with 27 Yang J, Lee HR, Low K, Chatterjee S, Pimentel colorectal cancer. Gastroenterol Hepatol 2008, M. Rifaximin versus other antibiotics bacterial 23:1298-1303 IPMID:18624900DOl:10.111 primary treatment and retreatment of ba 144-1746200805490.x 35 Scanlan PD, Shanahan F, Clune Y, Collins K, O PMID:17520365DOL:10.1007/s10620007-9839-8 Sullivan GC, ORiordan M, Holmes E, Wang Y, 28 Rajilic-Stojanovic M, Biagi E, Heilig HG, Kajander Marchesi JR. Culture-independent analysis of the K, Kekkonen RA, Tims s, de vos wm. Global gut microbiota in colorectal cancer and polyposis and deep molecular analysis of microbiota Environ Microbiol 2008; 10: 789-798 [PMID natures in fecal samples from patients with 8237311DO:10.111146229202007.01503×] 141:1792-1801PMID:21820992DOl:10.1053/ Letulle S, Langella P, Corthier G, Tran Van Nhieu 1-gastro201107.043] Furet P Microbial dysbiosis in colorectal cancer 29 Duboc H, Rainteau D, Rajca S, Humbert L, CRO patients. PLos One 2011; 6: e16393 [PMID: Farabos D, Maubert M, Grondin V, Jouet P 1297998DO1:10.1371/ journal. pone.0016393 Bouhassira D, Seksik P, Sokol H, Coffin B, Sabate 37 De Palma G, Nadal I, Medina M, Donat E, Ribes- JM. Increase in fecal primary bile acids and Koninckx C, Calabuig M, Sanz Y Intestinal dysbiosis in patients with diarrhea-predominant dysbiosis and reduced oglobulin irritable bowel syndrome. Neurogastroenterol Motil coated bacteria associated with coeliac diseas 12;24:513-520,e246-e247[PMID:22356587 children. BMC Microbiol 2010: 10: 63 DOl:10.11 0181275DOl:10.1186/1471-2180-1063 pez-Siles M, Martinez.Medina M, Busquets 38 Swidsinski A, Loening-Baucke V, Verstraelen D, Sabat-Mir M, Duncan SH, Flint H, H, Osowska S, Doerffel Y Biostructure of fecal Aldeguer X, Garcia-Gil L]. Mucosa-associated microbiota in healthy subjects and patients with Faecalibacterium prausnitzii and Escherichia hronic idiopathic diarrhea. Gastroenterology 2008 coli co-abundance can distinguish Irritable 135:568-579[PMID:18570896DO:10.1053/ Bowel Syndrome and Inflammatory Bowel j-gastro.2008.04017 Disease phenotypes. Int) Med Microbiol 2014 Swidsinski A, Dorffel Y, Loening- Baucke V 304:464-475[PMD:24713205DOI:10.1016/ Theissig F, Rickert JC, Ismail M, Rau WA, j-iImn201402009 Gaschler D, Weizenegger M, Kuhn S, Schilling J, 31 Soldi S, Vasileiadis S, Uggeri F, Campanale M, DOrffel WV. Acute appendicitis is characterised torelli L, Fogli MV, Calanni F, Grimaldi M, by local invasion with Fusobacterium nucleatum/ Gasbarrini A Modulation of the gut microbiota necrophorum Gut 2011; 60: 34-40 [PMID composition by rifaximin in non-constipated 19926616DOl:10.1136/gut2009.191320 编辑:马亚娟电编:李瑞芳 +5Aishideng 2017-03-28I Volume 25 Issue 9 I

黄晓丽, 等. 普拉梭菌与肠道疾病关系的研究进展 WCJD|www.wjgnet.com 815 2017-03-28|Volume 25|Issue 9| dysbiosis in patients with ulcerative colitis. Gut 2014; 63: 1275-1283 [PMID: 24021287 DOI: 10.1136/gutjnl-2013-304833] 24 Varela E, Manichanh C, Gallart M, Torrejón A, Borruel N, Casellas F, Guarner F, Antolin M. Colonisation by Faecalibacterium prausnitzii and maintenance of clinical remission in patients with ulcerative colitis. Aliment Pharmacol Ther 2013; 38: 151-161 [PMID: 23725320 DOI: 10.1111/apt.12365] 25 Cao Y, Shen J, Ran ZH. Association between Faecalibacterium prausnitzii Reduction and Inflammatory Bowel Disease: A Meta-Analysis and Systematic Review of the Literature. Gastroenterol Res Pract 2014; 2014: 872725 [PMID: 24799893 DOI: 10.1155/2014/872725] 26 Hansen R, Russell RK, Reiff C, Louis P, McIntosh F, Berry SH, Mukhopadhya I, Bisset WM, Barclay AR, Bishop J, Flynn DM, McGrogan P, Loganathan S, Mahdi G, Flint HJ, El-Omar EM, Hold GL. Microbiota of de-novo pediatric IBD: increased Faecalibacterium prausnitzii and reduced bacterial diversity in Crohn’s but not in ulcerative colitis. Am J Gastroenterol 2012; 107: 1913-1922 [PMID: 23044767 DOI: 10.1038/ajg.2012.335] 27 Yang J, Lee HR, Low K, Chatterjee S, Pimentel M. Rifaximin versus other antibiotics in the primary treatment and retreatment of bacterial overgrowth in IBS. Dig Dis Sci 2008; 53: 169-174 [PMID: 17520365 DOI: 10.1007/s10620-007-9839-8] 28 Rajilić-Stojanović M, Biagi E, Heilig HG, Kajander K, Kekkonen RA, Tims S, de Vos WM. Global and deep molecular analysis of microbiota signatures in fecal samples from patients with irritable bowel syndrome. Gastroenterology 2011; 141: 1792-1801 [PMID: 21820992 DOI: 10.1053/ j.gastro.2011.07.043] 29 Duboc H, Rainteau D, Rajca S, Humbert L, Farabos D, Maubert M, Grondin V, Jouet P, Bouhassira D, Seksik P, Sokol H, Coffin B, Sabaté JM. 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