生物信息学 普通高等教育 “十二五”规划教材 生物信息学 Bioinformatics e00 第六章：蛋白质组学
第六章：蛋白质组学 普通高等教育 “十二五”规划教材 生物信息学 Bioinformatics
第一节蛋白质组学概述 一、蛋白质组学的产生 (一)基因组学研究的成就 (二)基因组学研究的局限与蛋白质组学的 产生
第一节 蛋白质组学概述 一、蛋白质组学的产生 （一）基因组学研究的成就 （二）基因组学研究的局限与蛋白质组学的 产生
二、蛋白质组学研究的新进展 1、蛋白质的分离与鉴定 二维凝胶电泳技术 2、蛋白质互作或蛋白质复合体研究 3、蛋白质翻译后修饰分析 4、蛋白质功能鉴定研究 5、蛋白质复合体整体结构分析
二、蛋白质组学研究的新进展 1、蛋白质的分离与鉴定 二维凝胶电泳技术 2、蛋白质互作或蛋白质复合体研究 3、蛋白质翻译后修饰分析 4、蛋白质功能鉴定研究 5、蛋白质复合体整体结构分析
第二节蛋白质的大规模分离鉴定技术 一、蛋白质二维电泳-质谱技术 (一)蛋白质二维电泳技术 二维电泳和质谱技术联用已成为近年最流行、最可 靠的蛋白质分离与鉴定技术平台。 (二)质谱技术
第二节 蛋白质的大规模分离鉴定技术 一、蛋白质二维电泳-质谱技术 （一）蛋白质二维电泳技术 二维电泳和质谱技术联用已成为近年最流行、最可 靠的蛋白质分离与鉴定技术平台。 （二）质谱技术
二、一维（二维）色谱质朴技术 (一)一维电泳（色谱)-质谱技术(HPLC-MS) 1、一维SDS-PAGE电泳（色谱）-质谱技术 2、一维EF电泳-质谱技术
二、一维（二维）色谱-质朴技术 （一）一维电泳（色谱）-质谱技术（HPLC-MS） 1、一维SDS-PAGE电泳（色谱）-质谱技术 2、一维IEF电泳-质谱技术
(二)二维色谱-质谱技术(2-DE-HPLC、MS) 蛋白质多肽复合物 进样 强离子交换柱(SCX) 盐浓度梯度洗脱 组分1 组分2 组分3 组分n 反相柱 反相柱 反相柱 反相柱 质谱分析
（二）二维色谱-质谱技术（2-DE-HPLC、MS）
三、荧光差异凝胶电泳技术 四、同位素亲和标签技术 、表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技 术 六、蛋白质芯片技术 与DNA芯片(DNA微阵列)的原理相类似，蛋白质 芯片在固体支持物上采用了高密度的网格来固定整 个蛋白质组，从而得以对特定样品中的表达蛋白进 行大规模的分析
三、荧光差异凝胶电泳技术 四、同位素亲和标签技术 五、表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技 术 六、蛋白质芯片技术 与DNA芯片（DNA微阵列）的原理相类似，蛋白质 芯片在固体支持物上采用了高密度的网格来固定整 个蛋白质组，从而得以对特定样品中的表达蛋白进 行大规模的分析
七、通过数据库搜索鉴定蛋白质 ExPASY-expert protein analysis system 是由瑞士生物信息研究中心维护的一个整合 全面的蛋白质组学信息的网络服务器，提供 了众多的蛋白质序列、序列特征、结构、功 能注释等方面信息与分析工具，在其蛋白质 组学工具中就包含了Mascot、ProFound等多 种与质谱数据相关的肽段质量指纹数据分析 工具
七、通过数据库搜索鉴定蛋白质 ExPASY—expert protein analysis system 是由瑞士生物信息研究中心维护的一个整合 全面的蛋白质组学信息的网络服务器，提供 了众多的蛋白质序列、序列特征、结构、功 能注释等方面信息与分析工具，在其蛋白质 组学工具中就包含了Mascot、ProFound等多 种与质谱数据相关的肽段质量指纹数据分析 工具
第三节蛋白质的翻译后修饰 常见的蛋白质翻译后修饰类型 磷酸化、糖基化、泛素化、乙酰化和硫酸盐 化 蛋白质的翻译后修饰通过改变分子大小、疏 水性及蛋白质的整体构象等对蛋白质生物学 功能的正常行使产生影响
第三节 蛋白质的翻译后修饰 常见的蛋白质翻译后修饰类型 磷酸化、糖基化、泛素化、乙酰化和硫酸盐 化 蛋白质的翻译后修饰通过改变分子大小、疏 水性及蛋白质的整体构象等对蛋白质生物学 功能的正常行使产生影响
一、基于序列的蛋白质翻译后修饰预测 二、在蛋白质组学分析中鉴定翻译后修饰
一、基于序列的蛋白质翻译后修饰预测 二、在蛋白质组学分析中鉴定翻译后修饰