第二节蛋白质的共价结构 蛋白质通论 肽 三、蛋自质一级结构 四、蛋白质的一级结构与生物功能 五、肽与蛋白质的人工合成 ■本节小结
第二节 蛋白质的共价结构 一、蛋白质通论 二、肽 三、蛋白质一级结构 四、蛋白质的一级结构与生物功能 五、肽与蛋白质的人工合成 本节小结
一、蛋白质通论 (一)蛋白质的化学组成与分类 元素特点：蛋白质的含氮量接近于16%。 蛋白质系数：1克氮所代表的蛋白质质量（克数）。即6.25 凯氏定氮法测定蛋白质含量：（参看实验讲义) 粗蛋白含量=样品含氮量×6.25 蛋白质含量=样品蛋白氮×6.25 ·单纯（简单）蛋白质与缀合（结合）蛋白质及分类158页 缀合（结合）蛋白质：共价键结合；非共价键结合 ·蛋白质按生物学功能分类
一 、蛋白质通论 （一）蛋白质的化学组成与分类 § 元素特点：蛋白质的含氮量接近于16%。 § 蛋白质系数：1克氮所代表的蛋白质质量(克数)。即6.25 § 凯氏定氮法测定蛋白质含量： （参看实验讲义） 粗蛋白含量 ＝样品含氮量 6.25 蛋白质含量 = 样品蛋白氮 6.25 § 单纯(简单)蛋白质与缀合（结合）蛋白质及分类 158页 缀合（结合）蛋白质：共价键结合；非共价键结合 § 蛋白质按生物学功能分类
(二)蛋白质的形状和大小 N-terminus C-terminus 1.根据形状和溶解度分三类 纤维状蛋白质：球状蛋白质： 膜蛋白质： 2.单体蛋白质与寡聚蛋白质 3.蛋白质的相对分子质量 简单蛋白质的 蛋白质的相对分子质量 亚基之间通过非 氨基酸残基数 共价键相互缔合 110
（二）蛋白质的形状和大小 1.根据形状和溶解度分三类 纤维状蛋白质： 球状蛋白质： 膜蛋白质： 2.单体蛋白质与寡聚蛋白质 3.蛋白质的相对分子质量 亚基之间通过非 共价键相互缔合 简单蛋白质的 氨基酸残基数 = 蛋白质的相对分子质量 110
(三)蛋白质构象和蛋白质结构 1.构象(conformation) HN-CGVPAIQPVLISGLISRJIVNGEEAVPGSWPWQ DQ K YWGTKIKDAMIOICAGASGVSS]CMGDSGGPLVCKKNGAWTLV2IGIVSWGSSTC AAN-COOH b) Chymotrypsin tertiary structure Chymotrypsin space-filling model Chymotrypsin ribbon
（三）蛋白质构象和蛋白质结构 1.构象（conformation）
2.蛋白质结构的不同组织层次 ● 结构组织层次：一、二、 三、四级结构。 ● 介于二和三级结构之间：超二级结构和结构域 Primary Secondary Tertiary Quaternary structure structure structure structure Amino acid residues a Helix Polypeptide chain Assembled subunits
2. 蛋白质结构的不同组织层次 • 结构组织层次：一、二、三、四级结构。 • 介于二和三级结构之间：超二级结构和结构域
(四)蛋白质功能的多样性 1.蛋白质是构成生物体的基本成分 2.蛋白质具有多样性的生物学功能 催化、调节、转运、贮存、运动、结构成分、 支架作用、防御和进攻、其它。 摊大解 3
（四）蛋白质功能的多样性 1.蛋白质是构成生物体的基本成分 2.蛋白质具有多样性的生物学功能 催化、调节、转运、贮存、运动、结构成分、 支架作用、防御和进攻、其它
二、肽（是氨基酸的线性聚合物） (一)肽键、二疏键、活性肽、 R H R2 H3N-CH-C-OH +H-N-CH-COO 1.肽键 0 ·具有部分双键特性，不能自由旋 转，呈现相对的刚性和平面化。 H.O ·肽键的亚氨基没有明显的解离和 R HaN-CH-C-N CH-COO 质子化。 除脯氨酸外多以反式结构存在
二、肽（是氨基酸的线性聚合物） （一）肽键、二硫键、活性肽、 1. 肽键 §具有部分双键特性，不能自由旋 转,呈现相对的刚性和平面化。 §肽键的亚氨基没有明显的解离和 质子化。 §除脯氨酸外多以反式结构存在
肽 OH C端 N端 CHs CH3 CH CH2OH CH2 HaN Amino- Carboxyl- terminal end terminal end ■ N一端与C-端 ■ 二肽、. .12肽 寡肽：25(10个)个氨基酸残基以下。 多肽：多于25个（10个)氨基酸残基的肽链。 氨基酸的顺序：是从N-端至C-端氨基酸残基。 ■ 肽的命名： 环状肽：
N 端 C 端 § N-端与C-端 § 二肽、. . 12肽 § 寡肽：25（10个）个氨基酸残基以下。 § 多肽：多于25个（10个）氨基酸残基的肽链。 § 氨基酸的顺序：是从N-端至C-端氨基酸残基。 § 肽的命名： § 环状肽： 肽
肽平面、肽单位、二面角 Carboxyl 124A terminus 163A 146A 132A Amino terminus (b) ● 肽平面：连接在肽键上的六个原子共处于一个平面上。 ● 肽单位：肽链主链上的重复结构，Ca-C0-NH-Ca。 ● 二面角：在多肽链里，C。碳原子刚好位于互相连接的两个 肽平面的交线上。Ca碳原子上的Ca-C和Ca-N可以 绕轴旋转，角度为业和中，这就是α-碳原子上的一对二面 角。它决定了由α-碳原子连接的两个肽单位的相对位置
肽平面、肽单位、二面角 l 肽平面：连接在肽键上的六个原子共处于一个平面上。 l 肽单位：肽链主链上的重复结构，Cα- CO – NH – Cα。 l 二面角：在多肽链里， Cα碳原子刚好位于互相连接的两个 肽平面的交线上。 Cα碳原子上的 Cα- C 和 Cα– N 可以 绕轴旋转，角度为ψ和φ，这就是α-碳原子上的一对二面 角。它决定了由α-碳原子连接的两个肽单位的相对位置
肽的物理和化学性质 肽的晶体是离子晶格，溶点高。 。具有两性解离和等电点：肽的酸碱性质一一决定于末端α一 氨基和a-羧基及R基。 pH>R基pKa [HA]〈[A-] pH〈R基pKa [HA]>[A-] 多肽链中可解离功能团的pKa值（记） 例：G1y-G1u-Lys-Ala 。具有旋光性： 茚三酮反应、a-氨基和a-羧基及R基的反应. 注：茚三酮反应不是肽的特有反应。 N端是脯氨酸或焦谷氨酸时无α-氨基试剂的反应 具有双缩脲反应：（参看实验讲义） ?具紫外吸收：在280nm处有最大吸收峰，可进行肽类定量测 定（原因是：含色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸)
肽的物理和化学性质 v肽的晶体是离子晶格，溶点高。 v具有两性解离和等电点：肽的酸碱性质－－决定于末端α- 氨基和α-羧基及R基。 pH > R基pKa [HA] [A -] 多肽链中可解离功能团的pKa值（记） 例：Gly – Glu – Lys – Ala v具有旋光性： v茚三酮反应、 α-氨基和α-羧基及R基的反应. 注：茚三酮反应不是肽的特有反应。 N端是脯氨酸或焦谷氨酸时无α-氨基试剂的反应 具有双缩脲反应：（参看实验讲义） v具紫外吸收：在280nm处有最大吸收峰，可进行肽类定量测 定（原因是：含色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸 ）