● 第二章 临床分子生物学检验标志物 临床生物化学检验教研室 肖代敏 2018.03.09 1
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学习目的及要求。 分子生物标志物的概念及分类 掌握 基因突变及类型 。 基因多态性、DNA甲基化的概念, 转录产物标志物的类型,循环核酸应用 生物标志物概念及分类 熟悉 病毒、原核生物、真核生物及人类基 因组的结构及特点
2 熟悉
第一节 分子生物标志物的概念与分类
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生物标志物的概念与分类 生物标志物(biomarker):可测定并定量的生物学参数 是指可以标记系统、器官、组织、细胞及亚细胞结构或功能 的改变或可能发生的改变的生物学指标;生物标志物可用于 疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标 人群中的安全性及有效性
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NIH认为biomarker的特征:可以客观的测量和评价作为 正常的生理过程、疾病过程或药物对治疗干预的反应指标 0 依据来源分类: 生物样本(血样、尿样、组织)、记录值(体温、血压、心电 图)以及影像学检查 (超声、CT或MRI等); 依据用途分类: 预测性生物标志物、筛查性生物标志物、诊断性生物标志物、 分级型生物标志物、预后性生物标志物及替代终点。 85
5 NIH认为biomarker的特征:可以客观的测量和评价作为 正常的生理过程、疾病过程或药物对治疗干预的反应指标 。 依据来源分类: 生物样本(血样、尿样、组织)、记录值(体温、血压、心电 图)以及影像学检查(超声、CT或MRI等); 依据用途分类: 预测性生物标志物、筛查性生物标志物、诊断性生物标志物、 分级型生物标志物、预后性生物标志物及替代终点
三、分子生物标志物的概念与分类 ·分子生物标志物*(molecular biomarkers): 是生物标志物的一种类型,是指可以反映机体生理、 病理状态的核酸、蛋白质、代谢 产物等生物分子。因此,可分为核酸、 蛋白质和代谢产物等生物标志物。 6
6 二、分子生物标志物的概念与分类
(一)DNA生物标志物* ·是最主要的分子生物标志物,序列或含量变化与疾病关系密切。 突变时各种单基因遗传病产生的原因。 ·肿瘤癌基因(K-raS)、抑癌基因(p53)的突变可作为DNA生物标志物 ·表观遗传调控在疾病过程中起重要作用,Eg:DNA甲基化。 ·其他类型DNA分子生物标志物… 甲基化 给DNA戴上帽子
7 • 是最主要的分子生物标志物,序列或含量变化与疾病关系密切。 • 突变时各种单基因遗传病产生的原因。 • 肿瘤癌基因(K-ras)、抑癌基因(p53)的突变可作为DNA生物标志物。 • 表观遗传调控在疾病过程中起重要作用,Eg:DNA甲基化。 • 其他类型DNA分子生物标志物……
replication (二) RNA生物标志物* (DNA->DNA) DNA Polymerase D DNA ·为转录产物。 transcription (DNA->RNA) RNA Polymerase ·包括mRNA、异常剪接转录本、mi croRNA、长链 非编码RNA(IncRNA:长度在200-100000nt之间的 translation (RNA->Protein) RNA分子;不编码蛋白;参与细胞内多种过程调控;种 Ribosome 00000 Protein 类、数量、功能都不明确)。 ·RNA表达谱比单分子标志物更加精确。 ●0● 8 ●●
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蛋白质生物标志物 > 临床使用主要为单一蛋白质,用于免疫学方法较为常见: > 基于蛋白"指纹图谱"分析更优; > 高通量分析技术结合其他新兴技术会更加灵敏; > 蛋白的修饰使用蛋白芯片技术分析 计甜于 9
9 Ø 临床使用主要为单一蛋白质,用于免疫学方法较为常见; Ø 基于蛋白”指纹图谱”分析更优; Ø 高通量分析技术结合其他新兴技术会更加灵敏; Ø 蛋白的修饰使用蛋白芯片技术分析
(四)代谢产物生物标志物等 高通量技术发展,促进各类组学研究运用,小分子代谢产物等 都成为新的分子生物标志物;这是对核酸与蛋白分子标志物不 足的补充。 810
10 u 高通量技术发展,促进各类组学研究运用,小分子代谢产物等 都成为新的分子生物标志物;这是对核酸与蛋白分子标志物不 足的补充