上海交通大学：农业资源与环境专业《分子生态学》课程教学大纲.pdf_大学文库

《分子生态学》课程教学大纲(2020版) 课程基本信息(Course Information) 4学时课程代码 ECOL4405 (Credit 32 学纷 (Course Code Hours) (Credits) 课程名称 (中文)分子生态学 (Course Name) (英文)Molecular Ecology 课程类型 (Course Type 专业类选修课授课对象 (Target 农业资源与环境专业本科生 Audience) 授课语言 (Language o 双语 Instruction) 开课院系 (School) 农业与生物学院先修课程分子生物学，生态学，橱后续课程 (Prerequisite)率与数理统计 (post】课程负责人课程网址 (Instructor) (Course Webpage) (中文300-500字，含课程性质、主要教学内容、课程教学目标等) 《分子生态学》是衣业资源与环境专业的专业限选课，本课程设置在大四第一学期，以学案例分析和应用技术为主，助力学生完成本科半业论文。分子生态学是利用分子选传工具研究生。重点讲授如何利用微芯片和DNA标记技术研究自然生态群落相作用和多样性，学生以小组为单位(2-4人组)分析微生物I6sRNA和TS数据，利用R 课程简介（中语言进行统计分析，掌握高性能计算方法，学习论文撰写的方法。在课程的最后一节是研文) 过会，学生将利用本课程所学案例和方法，结合作业内容进行汇报，最终提交课程论文本课理老核方式是出作和程论文村学习学生将了望公子生态学发展历与电理论了解分子生态学在多种领域（如：士壤、微生物环境修复)的应用案例握分子生态学中的分子生物学和概率统计基本技术。学生将获得在多种领域利用分子生态学知识分桥、思考、发现并解决问题的能力：团队协作申报和承担科研项目的能力：多学科交叉的科研素质. 课程简介（英Resources and Environments..This cours addresses case studies and applied techniques inth front of molecular ecology,which may benefit preparation of graduation thesis.Molecula (Description)ecoloy is the use of molecular genetic tools to study ecological questions.Techniques sucha microarrays and DNA markers are used to study the interactions and diversity of natura

《分子生态学》课程教学大纲（2020 版）课程基本信息（Course Information）课程代码（Course Code） ECOL4405 *学时（Credit Hours） 32 *学分（Credits） 2 *课程名称（Course Name）（中文）分子生态学（英文）Molecular Ecology 课程类型 (Course Type) 专业类选修课授课对象（Target Audience）农业资源与环境专业本科生授课语言 (Language of Instruction) 双语 *开课院系（School）农业与生物学院先修课程（Prerequisite）分子生物学，生态学，概率与数理统计后续课程 (post） *课程负责人（Instructor）惠楠课程网址 (Course Webpage) *课程简介（中文）（Description）（中文 300-500 字，含课程性质、主要教学内容、课程教学目标等）《分子生态学》是农业资源与环境专业的专业限选课。本课程设置在大四第一学期，以学习案例分析和应用技术为主，助力学生完成本科毕业论文。分子生态学是利用分子遗传学工具研究生态学问题。重点讲授如何利用微芯片和 DNA 标记技术研究自然生态群落相互作用和多样性。学生以小组为单位（2-4 人/组）分析微生物 16s rRNA 和 ITS 数据，利用 R 语言进行统计分析，掌握高性能计算方法，学习论文撰写的方法。在课程的最后一节是研讨会，学生将利用本课程所学案例和方法，结合作业内容进行 ppt 汇报，最终提交课程论文。本课程考核方式是出勤、作业和课程论文。通过学习学生将了解分子生态学发展历程与经典理论；了解分子生态学在多种领域（如：土壤、微生物、环境修复）的应用案例；掌握分子生态学中的分子生物学和概率统计基本技术。学生将获得在多种领域利用分子生态学知识分析、思考、发现并解决问题的能力；团队协作申报和承担科研项目的能力；多学科交叉的科研素质。 *课程简介（英文）（Description） Molecular ecology an elective course for senior students (autumn semester) major in Agricultural Resources and Environments. This course addresses case studies and applied techniques in the front of molecular ecology, which may benefit preparation of graduation thesis. Molecular ecology is the use of molecular genetic tools to study ecological questions. Techniques such as microarrays and DNA markers are used to study the interactions and diversity of natural

Based n student group (students per group)the microbial DN matics (16s rRNA and ITS genes).R andst atistics,application of high-performa computing,and scientific writing.The last lesson of this course is a mini-seminar,where eroup makes a PowerPoint presentation about their course works.The final grade of the course evaluated based on attendances.home works and final reports.By attending this course,studen will leamn the development history and classic theory of molecular ecology:understand th applied cases of molecular ccology in various fields (such as soil,microorgar nmental resto )the basic tchniques of molecular biology.an master statistics.Students will be capable of analyzing.thinking.finding and oving probler using molecular eoloy knowledge in a variety of fields Students will also gain team-w experiences in reporting scientific research results.and the scientifie quality of interdiscipling 课程目标与内容(Course objectives and contents) 1.了解分子生态学发展历程与经典理论(A3,A5):了解分子生态学在多种领域（如：土壤、微生物、环境修复)的应用案例(A5,B4,C1) *课程目标掌握分子生态学中的分子生物学和概率统计基本技术(B5.C3) Course Object) 过本程的学习，学生将获得在多种领域利用盼子生态学知识分析、思考、发现解决问题的能力(B5,C3),团队协作申报和承担科研项目的能力(C5),多学科交叉的科研素质(D2), 章节教学内容（要点）教学形式作业及课程思政融对应课程目核要求点标掌握分子生表精读一篇学的概念。研分子生态究对像：了解第分子生态学的基本 4 课堂教学学sC研生态生态 “教学内容进度草理论和应用案例究论文，究的最新动安及过应注归纳出要态：理解分程且标(C 点进化的中性沙 Schedule 和选择论： Requirements 学握云计算云 Course 存储平台的格 0 bjectives))第二高性能i计算生态信设计并招 4 课堂教学+计算建云计道健方法：了解息技术理论与案例机操作高性能计算在平台分子生态学域的应用掌握16s 在云平台 rRNA其因数筑三微生物姓装高通量练习微生 4 计算机操作据的基本结数据分析(1) 物辉活量控制构。质量控方法

populations. Based on student groups (2-4 students per group), the course teaches microbial DNA bioinformatics (16s rRNA and ITS genes), R and statistics, application of high-performance computing, and scientific writing. The last lesson of this course is a mini-seminar, where each group makes a PowerPoint presentation about their course works. The final grade of the course is evaluated based on attendances, home works and final reports. By attending this course, students will learn the development history and classic theory of molecular ecology; understand the applied cases of molecular ecology in various fields (such as soil, microorganisms, and environmental restoration); be acquainted with the basic techniques of molecular biology, and master statistics. Students will be capable of analyzing, thinking, finding and solving problems using molecular ecology knowledge in a variety of fields. Students will also gain team-work experiences in reporting scientific research results, and the scientific quality of interdisciplinary research. 课程目标与内容（Course objectives and contents） *课程目标 (Course Object) 1. 了解分子生态学发展历程与经典理论（A3, A5）；了解分子生态学在多种领域（如：土壤、微生物、环境修复）的应用案例（A5，B4, C1） 2. 掌握分子生态学中的分子生物学和概率统计基本技术（B5, C3） 3. 通过本课程的学习，学生将获得在多种领域利用分子生态学知识分析、思考、发现并解决问题的能力（B5, C3），团队协作申报和承担科研项目的能力（C5），多学科交叉的科研素质（D2）。 *教学内容进度安排及对应课程目标 (Class Schedule & Requirements & Course Objectives) 章节教学内容（要点）学时教学形式作业及考核要求课程思政融入点对应课程目标第一章分子生态学的基本理论和应用案例 4 课堂教学精读一篇分子生态学 SCI 研究论文，并归纳出要点掌握分子生态学的概念、研究对象；了解生态生态学研究的最新动态；理解分子进化的中性论和选择论； 1 第二章高性能计算生态信息技术理论与案例 4 课堂教学+计算机操作设计并搭建云计算平台掌握云计算云存储平台的搭建方法；了解高性能计算在分子生态学领域的应用 2 第三章微生物群落高通量数据分析（1） 4 计算机操作在云平台练习微生物数据质量控制掌握 16s rRNA 基因数据的基本结构，质量控制方法 2