第八章DNA或蛋白质的化学修 饰与基因表达
第八章DNA或蛋白质的化学修 饰与基因表达
▪ 一、 DNA甲基化与基因表达 ▪ 二、 蛋白质磷酸化与基因表达 ▪ 三、 基因重排的分子机制
▪ 一、 DNA甲基化与基因表达 ▪ 二、 蛋白质磷酸化与基因表达 ▪ 三、 基因重排的分子机制
一、 DNA甲基化与基因表达 DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一， 可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化 能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导 了基因的重新活化和表达。 1．DNA甲基化的主要形式 5-甲基胞嘧啶，N6-甲基腺嘌呤和7-甲基 鸟嘌呤。在真核生物中，5-甲基胞嘧啶主要 出现在CpG和CpXpG中，原核生物中 CCA/TGG和GATC也常被甲基化
一、 DNA甲基化与基因表达 DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一， 可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化 能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导 了基因的重新活化和表达。 1．DNA甲基化的主要形式 5-甲基胞嘧啶，N6-甲基腺嘌呤和7-甲基 鸟嘌呤。在真核生物中，5-甲基胞嘧啶主要 出现在CpG和CpXpG中，原核生物中 CCA/TGG和GATC也常被甲基化
NH NH H,C 甲基化 胞壁啶 5-甲基胞密啶 NH: HN-CH, 甲基化 腺隳玲 N,甲基腺隳岭 甲化一 鸟嘌岭 7-甲基鸟骠吟 图7-15-甲基胞嘧啶、N·-甲基腺票岭和7-甲基鸟骠岭结构图
表71不同生物DNA甲基化的特征比较 特征 脊 椎动物 植物 大肠杆菌 甲基化的碱基 m'Cyt m'Cyt m'Cyt,m'Ade 甲基化序列 CpG CpG,CpXpG CCA/TGG,GATC 甲基化程度 ≤90% ≤90% 约100% 甲基化对称性 + + + 甲基化酶的种类 1 多个 DNA底物特异性 半甲基化DNA优先 半甲基化和无甲基化DNA
真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性：一 种被称为日常型（mainte-nance）甲基转移酶， 另一种是 从头合成（denovo synthesis）甲基转 移酶。前者主要在甲基化母链（模板链）指导下 使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶 相对应的胞嘧啶甲基化。日常型甲基转移酶常常 与DNA内切酶活性相耦联，有3种类型。II类酶活 性包括内切酶和甲基化酶两种成分，而I类和III类 都是双功能酶，既能将半甲基化DNA甲基化，又 能降解外源无甲基化DNA
真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性：一 种被称为日常型（mainte-nance）甲基转移酶， 另一种是 从头合成（denovo synthesis）甲基转 移酶。前者主要在甲基化母链（模板链）指导下 使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶 相对应的胞嘧啶甲基化。日常型甲基转移酶常常 与DNA内切酶活性相耦联，有3种类型。II类酶活 性包括内切酶和甲基化酶两种成分，而I类和III类 都是双功能酶，既能将半甲基化DNA甲基化，又 能降解外源无甲基化DNA
CH3 ACGTATCGT ACGTATE methylated cytosine mthated ii田 me助ation i cytosine % TGCATAGCA TGCATA阳 ACGTATCGT oreced by 3 DNA y mainteance maintenan图 TGCATAGCA fepleation methe m凸蜓 CH ACGTATCGT ACGTATC iiH methylation ii讯 TGCATAGCA TGCATA 9-68 CH
表7-2细胞内3类日常型甲基转移酶活性分析 特性 1类 1类 1类 蛋白质结构 甲基化与内切酶功能 双功能醇，2个亚基 双功能酶，3个亚基 由不同蛋白质执行 识别位点 4~6bp,常为回文结构 5~1bp,常为不对称序列由两个不对称序列构成 酶切位点 同识别位点或非常靠 识别位点下游24~25bp 非特异性，可在距识别 近该位点 位点>1000bp处 内切/甲基化相互独立 同时进行 不能同时进行 其他 不需要ATP水解 需要ATP水解 需要ATP水解
由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失，所以，高等 真核生物中CG序列远远低于其理论值。哺乳类基因组 中约存在4万个CG islands，大多位于转录单元的5‘区。 没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用，就可能被氧 化成为U，被DNA修复系统所识别和切除，恢复成C。 已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法 被区分。因此, CpG序列极易丢失
由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失，所以，高等 真核生物中CG序列远远低于其理论值。哺乳类基因组 中约存在4万个CG islands，大多位于转录单元的5‘区。 没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用，就可能被氧 化成为U，被DNA修复系统所识别和切除，恢复成C。 已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法 被区分。因此, CpG序列极易丢失
CG island introns exons dihydrofolate reductase gene DNA RNA 5= >3 hypoxanthine phosphoribosyl transferase gene DNA RNA 51 3 ribosomal protein gene DNA RNA 5 10,000 nucleotide pairs