《生物信息学(A类)》课程教学大纲(2020版) 课程基本信息(Course Information) 课程代码 ·学时 HORT3407 学分 (Credits Hours) *课程名称 (中文)生物信息学(A类) (Course Name) (英文)Bioinformatics 课程类型 (Course Type) 专业选修课 授课对嫁 (Target 植物科学与技术、动物科学专业本科生 Audience) 授课语言 (Language of 中文 Instruction) 开课院系 农业与生物学院 (School) 先修课程生物化学，遗传学，分后续课程 (Prerequisite)子生物学 (nost) 课程负责人 课程网址 张利达 (Course (Instructor) Webpage) 中文300.500字，含课程性质。主要教学内容、课程教学目标等) 《生物信息学》是一门面向生物学相关专业的选修课程 士要进生物 息学的概念和方法，以及如何应用生物信息学手段解决生 科学问题。授课 容包括生物信息学数据库、序列比对、基因预测、分子进化、生物网络建模 课程简介（中 新一代测序及应用等内容。在讲解基本原理同时，介绍相应的生物信息分析载 件，并通过实例使大家熟悉如何使用这些软件来分析生物数据。此外，进一步 通过进解且体的研究案例，使大家了解如何用生物信息学的方法及研究里路来 解决生命科学中的问题 本课程不仅为学生提供必要的基础理论知识的同时 重点培养学生利用专业技能分析解决问题的能力，为学生从事与生物学相关 业技术工作、科学研究工作等打下坚实的基础。 “课程简介（英 (英文30-500字) 文) Bioinformatics generally applies computer science to solve biological questions. (Deseription) This course introduces some important concepts and tools in bioinformatics field. The topicsare related to online resoures,sequence alignment,gene prediction
《生物信息学（A 类）》课程教学大纲（2020 版） 课程基本信息（Course Information） 课程代码 （Course Code） HORT3407 *学时 （Credit Hours） 32 *学分 （Credits） 2 *课程名称 （Course Name） （中文）生物信息学（A 类） （英文）Bioinformatics 课程类型 (Course Type) 专业选修课 授课对象 （Target Audience） 植物科学与技术、动物科学专业本科生 授课语言 (Language of Instruction) 中文 *开课院系 （School） 农业与生物学院 先修课程 （Prerequisite） 生物化学，遗传学，分 子生物学 后续课程 (post） / *课程负责人 （Instructor） 张利达 课程网址 (Course Webpage) / *课程简介（中 文） （Description） （中文 300-500 字，含课程性质、主要教学内容、课程教学目标等） 《生物信息学》是一门面向生物学相关专业的选修课程，主要讲授生物信 息学的概念和方法，以及如何应用生物信息学手段解决生命科学问题。授课内 容包括生物信息学数据库、序列比对、基因预测、分子进化、生物网络建模、 新一代测序及应用等内容。在讲解基本原理同时，介绍相应的生物信息分析软 件，并通过实例使大家熟悉如何使用这些软件来分析生物数据。此外，进一步 通过讲解具体的研究案例，使大家了解如何用生物信息学的方法及研究思路来 解决生命科学中的问题。本课程不仅为学生提供必要的基础理论知识的同时， 重点培养学生利用专业技能分析解决问题的能力，为学生从事与生物学相关专 业技术工作、科学研究工作等打下坚实的基础。 *课程简介（英 文） （Description） （英文 300-500 字） Bioinformatics generally applies computer science to solve biological questions. This course introduces some important concepts and tools in bioinformatics field. The topics are related to online resources, sequence alignment, gene prediction
sequencing data.Both lecture and practice on computer are integrated in the cous The lecture part is mainly involved with bioinformatics concepts and current trends.The hand-on experiences are enable students to use bioinformatics methods to solve biological questions and to develop creative and critical thinking in biology. 课程目标与内容(Course objectives and contents) 课程目标1了解信息学与生物科学的关系(A3) 课程目标2.了解生物信息学基本理论和掌握基本技能(B3,B4) 课程目标 Course Obje 课程目标3.培有认识和发现问题的能力和利用学科交叉解决生物学问题的能 (B3,C5,D1 作业及考 章节教学内容（要点） 学时 学形式 核要求 标 绪论，了解生物 培苏学生认直 第一信息学学科的发 2 章展历史与研究内 讲授/讨论 严谨的工作作 1 风 *教学内容进度 掌握生信培养学生认真 安排及对应课 第二生物信总数据库 讲授/讨论 数据库检严译的工作作 2.3 音 及其应用 程目标(Cas 操作 风 Schedule& 第三 讲授/讨论 掌握序列 傍养学生认真 序列比对原理 相似性比严谨的工作作 2,3 Course 章 妈作 对方法 风 Objectives) 第四基因识别与基因 4 讲授/讨论 掌握基铟 养学生认真 严谨的工作作 2.3 章 组分析 操作 预测方法 风 掌据分子培养学生认直 第五分子讲化与系统 进授/讨论 章 发有 6 操作 进化分析严谨的工作作 2,3 方法 风 掌握蛋白培养学生认真 第六蛋白质功能与结 讲授/讨论 质同源建严译的工作作 2,3 章 构分析 操作 模方法 风 第 高通量测序技 讲授/讨论/ 陪养学生认真 量测序数严谨的工作作 2,3 术与数据处理 操作
molecular evolution, biological network modeling, and analysis of next-generation sequencing data. Both lecture and practice on computer are integrated in the course. The lecture part is mainly involved with bioinformatics concepts and current trends. The hand-on experiences are enable students to use bioinformatics methods to solve biological questions and to develop creative and critical thinking in biology. 课程目标与内容（Course objectives and contents） *课程目标 (Course Object) 课程目标 1. 了解信息学与生物科学的关系（A3） 课程目标 2. 了解生物信息学基本理论和掌握基本技能（B3,B4） 课程目标 3. 培育认识和发现问题的能力和利用学科交叉解决生物学问题的能 力（B3,C5,D1） *教学内容进度 安排及对应课 程目标 (Class Schedule & Requirements & Course Objectives) 章节 教学内容（要点） 学时 教学形式 作业及考 核要求 课程思政融入 点 对应课程目 标 第一 章 绪论，了解生物 信息学学科的发 展历史与研究内 容 2 讲授/讨论 培养学生认真 严谨的工作作 风 1 第二 章 生物信息数据库 及其应用 6 讲授/讨论/ 操作 掌握生信 数据库检 索 培养学生认真 严谨的工作作 风 2，3 第三 章 序列比对原理 6 讲授/讨论/ 操作 掌握序列 相似性比 对方法 培养学生认真 严谨的工作作 风 2，3 第四 章 基因识别与基因 组分析 4 讲授/讨论/ 操作 掌握基因 预测方法 培养学生认真 严谨的工作作 风 2，3 第五 章 分子进化与系统 发育 6 讲授/讨论/ 操作 掌握分子 进化分析 方法 培养学生认真 严谨的工作作 风 2，3 第六 章 蛋白质功能与结 构分析 4 讲授/讨论/ 操作 掌握蛋白 质同源建 模方法 培养学生认真 严谨的工作作 风 2，3 第七 章 高通量测序技 术与数据处理 4 讲授/讨论/ 操作 掌握高通 量测序数 培养学生认真 严谨的工作作 2，3
据份析方 风 法 注1：建议按照教学周周学时编排。 注2：相应章节的课程思政融入点根据实际情况填写. 示： 考核方式 (1)平时成绩（出勤+课堂表现+实验报告），占总成绩的40%. (Grading) (2)期末考试，占总成绩的60%。 敦材或参考资 料(Textbooks《生物信息学》，主编陈铭，科学出版社，2018年6月，第三版，ISBN: &Other 978-7-03-057681-1 Materials) 它(More) 备注(Notes) 备注说明： 1.带*内容为必填项。 2.课程简介字数为300500字：课程大纲以表述清楚教学安排为宜，字数不限
据分析方 法 风 注 1：建议按照教学周周学时编排。 注 2：相应章节的课程思政融入点根据实际情况填写。 *考核方式 (Grading) 示例： （1）平时成绩（出勤+课堂表现+实验报告），占总成绩的 40％。 （2）期末考试，占总成绩的 60％。 *教材或参考资 料 (Textbooks & Other Materials) 《生物信息学》， 主编 陈铭， 科学出版社，2018 年 6 月，第三版，ISBN: 978‐7‐03‐057681‐1 其它（More） 备注（Notes） 备注说明： 1．带*内容为必填项。 2．课程简介字数为 300-500 字；课程大纲以表述清楚教学安排为宜，字数不限