《肿瘤生物学》（供生物信息学专业使用）教学大纲基础医学院生物化学与分子生物学教研室编写2021年9月
《肿瘤生物学》 （供生物信息学专业使用） 教 学 大 纲 基础医学院生物化学与分子生物学教研室编写 2021 年 9 月
前言一、 基本信息课程名称：肿瘤生物学学时学分：总学时：48学时（理论），总学分：3学分。适用专业：生物信息学。先修课程：生物化学、分子生物学、细胞学、遗传学。二、课程简介肿瘤是威胁全球人类健康的一大类疾病，近年来肿瘤学领域发展迅速，分子生物学和组学研究为整个领域带来了巨大的变化，靶向治疗、个体精准化治疗和免疫治疗成为当前研究的热点，非编码RNA、代谢和肿瘤微环境的研究使我们更加全面和立体的了解肿瘤，将为肿瘤治疗带来新的认识。肿瘤学研究突飞猛进，只有紧跟最新的科学进展，才有可能走向科学研究的前沿。本课程主要内容包括分子肿瘤学研究的主要领域、肿瘤学的诊断与治疗、以及肿瘤预防等。三、课程目标本大纲主要依据生物信息学专业的特点，以及学校的教学计划和学时安排而制订，主要供生物信息学专业教学使用。肿瘤的大规模组学测序及相关生物信息学分析在当前肿瘤的基础研究、肿瘤的分子诊断与靶向治疗中发挥重要作用。生物信息学专业毕业生的后续工作和学习不可避免将接触到肿瘤的大规模组学测序及相关生物信息学分析。该课程的开设将有助于拓展生物信息学专业学生的理论知识以及日后的专业发展。通过本课程的学习有助于学生了解我国在我党的领导下在医疗卫生特别是肿瘤诊断治疗和科研领域取得的重大进展，树立民族自信心和自豪感。四、教学要求通过学习本课程，学生应熟悉肿瘤学的历史、现状和发展趋势，掌握肿瘤发生发展各个阶段的主要生物学特征和分子生物学事件，掌握现阶段肿瘤分子诊断的现状，适当了解肿瘤治疗的一些新进展和新技术。掌握一些通用的肿瘤学专业英语词汇，为阅读英文专业文献作一些准备。五、教学方法教师必须认真地研究教材，按照本大纲的要求进行教学。教师应掌握好课堂教学的难点和重点，在做好基本知识讲授的同时，与临床方面作一些必要的联系，并适当
前 言 一、 基本信息 课程名称：肿瘤生物学 学时学分：总学时：48 学时（理论），总学分：3 学分。 适用专业：生物信息学。 先修课程：生物化学、分子生物学、细胞学、遗传学。 二、课程简介 肿瘤是威胁全球人类健康的一大类疾病，近年来肿瘤学领域发展迅速，分子生物 学和组学研究为整个领域带来了巨大的变化，靶向治疗、个体精准化治疗和免疫治疗 成为当前研究的热点，非编码 RNA、代谢和肿瘤微环境的研究使我们更加全面和立体 的了解肿瘤，将为肿瘤治疗带来新的认识。肿瘤学研究突飞猛进，只有紧跟最新的科 学进展，才有可能走向科学研究的前沿。本课程主要内容包括分子肿瘤学研究的主要 领域、肿瘤学的诊断与治疗、以及肿瘤预防等。 三、课程目标 本大纲主要依据生物信息学专业的特点，以及学校的教学计划和学时安排而制 订，主要供生物信息学专业教学使用。肿瘤的大规模组学测序及相关生物信息学分析 在当前肿瘤的基础研究、肿瘤的分子诊断与靶向治疗中发挥重要作用。生物信息学专 业毕业生的后续工作和学习不可避免将接触到肿瘤的大规模组学测序及相关生物信息 学分析。该课程的开设将有助于拓展生物信息学专业学生的理论知识以及日后的专业 发展。通过本课程的学习有助于学生了解我国在我党的领导下在医疗卫生特别是肿瘤 诊断治疗和科研领域取得的重大进展，树立民族自信心和自豪感。 四、教学要求 通过学习本课程，学生应熟悉肿瘤学的历史、现状和发展趋势，掌握肿瘤发生发 展各个阶段的主要生物学特征和分子生物学事件，掌握现阶段肿瘤分子诊断的现状， 适当了解肿瘤治疗的一些新进展和新技术。掌握一些通用的肿瘤学专业英语词汇，为 阅读英文专业文献作一些准备。 五、教学方法 教师必须认真地研究教材，按照本大纲的要求进行教学。教师应掌握好课堂教学 的难点和重点，在做好基本知识讲授的同时，与临床方面作一些必要的联系，并适当
反映学科的新进展、新动向。在教学过程中，除了传统的教学手段与方法之外，教师也应灵活并适当地引入PBL、TBL等小组讨论式教学方法，注意培养学生的自学能力、口头表达能力、文字表达能力、观察能力、批判性思维等，以全面提高学生的综合素质。六、考核方式因为本教材为研究生教材，知识点繁多，我们授课方式是多教师以专题讨论的形式进行教学，旨在开拓学生知识范围和自主思考能力，所以本课程最终考核成绩以平时考核成绩和期末课程论文结合，各占50%。其中平时成绩是对包括课堂考勤、在线学习时长、课后作业完成情况、专题问题的讨论情况进行综合评分，期末课程论文多以考察学生文献查阅和阅读理解能力、语言组织能力和问题延伸拓展分析能力来进行评价。参与人：雷云龙、王义涛、张春冬、李轶执笔人：雷云龙审定人：卜友泉
反映学科的新进展、新动向。在教学过程中，除了传统的教学手段与方法之外，教师 也应灵活并适当地引入 PBL、TBL 等小组讨论式教学方法，注意培养学生的自学能力、 口头表达能力、文字表达能力、观察能力、批判性思维等，以全面提高学生的综合素 质。 六、考核方式 因为本教材为研究生教材，知识点繁多，我们授课方式是多教师以专题讨论的形 式进行教学，旨在开拓学生知识范围和自主思考能力，所以本课程最终考核成绩以平 时考核成绩和期末课程论文结合，各占 50%。其中平时成绩是对包括课堂考勤、在线 学习时长、课后作业完成情况、专题问题的讨论情况进行综合评分，期末课程论文多 以考察学生文献查阅和阅读理解能力、语言组织能力和问题延伸拓展分析能力来进行 评价。 参与人：雷云龙、王义涛、张春冬、李轶 执笔人：雷云龙 审定人：卜友泉
教材、教辅用书与参考书目教研室和课程组对国内外主流教材和教辅用书进行了详细的调研论证和分析比较，结合我校实际教学情况，决定采用以下教材和教辅用书。我们选用了肿瘤学第5版-徐瑞华-研究生2020作为授课教材，因为该教材有最新研究进展和生物信息学研究方法，适用于基础医学和生物信息学专业教学（选取部分内容），也适于研究生教学（选取部分内容），此外该教材有大量我国肿瘤诊断治疗进展历史和科研最新前沿介绍，适合开展课程思政。在参考书方面，我们选用了赫捷主编的《肿瘤学概论》和Weinberg主编的英文教材“ThebiologyofCancer,SecondEdition.”供学生进行拓展阅读。教材和教辅用书均价值取向正确，无危害国家安全、涉密及其他不适宜公开传播的内容，思想导向正确，不存在思想性问题。一、教材1.徐瑞华、陈国强.国家卫生健康委员会十三五规划教材《肿瘤学》第五版.北京：人民卫生出版社，2020。二、参考书目1.赫捷，十三五本科规划教材临床医学第九轮五年制《肿瘤学概论》第二版.北京人民卫生出版社，2018。2. Robert A.Weinberg.The biology of Cancer, Second Edition.Garland Science,Taylor&FrancisGroup,LLC,2014
教材、教辅用书与参考书目 教研室和课程组对国内外主流教材和教辅用书进行了详细的调研论证和分析比 较，结合我校实际教学情况，决定采用以下教材和教辅用书。我们选用了肿瘤学第 5 版-徐瑞华-研究生 2020 作为授课教材，因为该教材有最新研究进展和生物信息学研究 方法，适用于基础医学和生物信息学专业教学（选取部分内容），也适于研究生教学 （选取部分内容），此外该教材有大量我国肿瘤诊断治疗进展历史和科研最新前沿介 绍，适合开展课程思政。在参考书方面，我们选用了赫捷主编的《肿瘤学概论》和 Weinberg 主编的英文教材“The biology of Cancer, Second Edition.”供学生进行拓展阅 读。教材和教辅用书均价值取向正确，无危害国家安全、涉密及其他不适宜公开传播 的内容，思想导向正确，不存在思想性问题。 一、教材 1.徐瑞华、陈国强. 国家卫生健康委员会十三五规划教材《肿瘤学》第五版. 北京: 人民卫生出版社，2020。 二、参考书目 1. 赫捷. 十三五本科规划教材临床医学第九轮五年制《肿瘤学概论》第二版.北京: 人民卫生出版社，2018。 2. Robert A.Weinberg. The biology of Cancer, Second Edition. Garland Science, Taylor & Francis Group, LLC，2014
目录教学时数分配表（共48学时）第一章绪论第二章基因-环境交互作用与肿瘤2第三章癌基因与抑癌基因3第四章肿瘤表观遗传学5第五章非编码RNA和肿瘤.6第六章信号转导与肿瘤：.7第七章细胞周期与肿瘤..9第八章细胞分化和死亡与肿瘤10第九章能量代谢异常和肿瘤.11第十章肿瘤干细胞.12第十一章肿瘤侵袭与转移13第十二章肿瘤免疫，.14第十三章肿瘤分子病理诊断.15第十四章抗肿瘤药物发展.16第十五章肿瘤免疫治疗.16第十六章肿瘤研究方法学17
目 录 教学时数分配表（共 48 学时） .1 第一章 绪论 .2 第二章 基因-环境交互作用与肿瘤 .2 第三章 癌基因与抑癌基因 .3 第四章 肿瘤表观遗传学 .5 第五章 非编码 RNA 和肿瘤 .6 第六章 信号转导与肿瘤 .7 第七章 细胞周期与肿瘤 .9 第八章 细胞分化和死亡与肿瘤 .10 第九章 能量代谢异常和肿瘤 .11 第十章 肿瘤干细胞 .12 第十一章 肿瘤侵袭与转移 .13 第十二章 肿瘤免疫 .14 第十三章 肿瘤分子病理诊断 .15 第十四章 抗肿瘤药物发展 .16 第十五章 肿瘤免疫治疗 .16 第十六章 肿瘤研究方法学 .17
教学时数分配表48学时）(共示教理论自学实验备注教学内容0100第一章绪论0200第二章基因-环境交互作用与肿瘤0300第三章癌基因与抑癌基因4000第四章肿瘤表观遗传学0040第五章非编码RNA和肿瘤0040第六章信号转导与肿瘤3000第七章细胞周期与肿瘤4000第八章细胞分化和死亡与肿瘤0300第九章能量代谢异常和肿瘤2000第十章肿瘤干细胞3000第十一章肿瘤侵袭与转移3000第十二章肿瘤免疫5000第十三章肿瘤分子病理诊断2000第十四章抗肿瘤药物发展2000第十五章肿瘤免疫治疗3000第十六章肿瘤研究方法学合计481
1 教学时数分配表（共 48 学时） 教学内容 理论 自学 实验 示教 备注 第一章 绪论 1 0 0 0 第二章 基因-环境交互作用与肿瘤 2 0 0 0 第三章 癌基因与抑癌基因 3 0 0 0 第四章 肿瘤表观遗传学 4 0 0 0 第五章 非编码 RNA 和肿瘤 4 0 0 0 第六章 信号转导与肿瘤 4 0 0 0 第七章 细胞周期与肿瘤 3 0 0 0 第八章 细胞分化和死亡与肿瘤 4 0 0 0 第九章 能量代谢异常和肿瘤 3 0 0 0 第十章 肿瘤干细胞 2 0 0 0 第十一章 肿瘤侵袭与转移 3 0 0 0 第十二章 肿瘤免疫 3 0 0 0 第十三章 肿瘤分子病理诊断 5 0 0 0 第十四章 抗肿瘤药物发展 2 0 0 0 第十五章 肿瘤免疫治疗 2 0 0 0 第十六章 肿瘤研究方法学 3 0 0 0 合 计 48
第一章绪论一、目的要求1.向学生简要介绍中国肿瘤预防、诊断和治疗发展史，培养学生爱国情怀，培养学生探索未知、追求真理、勇攀科学高峰的责任感和使命感。2.掌握肿瘤的定义。3.了解肿瘤的十大特征。4.熟悉恶性肿瘤的分类。5.了解肿瘤发病机制研究发展史。6.了解常见肿瘤。7.了解肿瘤常见诊断技术。8.了解肿瘤主要治疗手段。二、主要内容1.对肿瘤认识发展的历史。2.肿瘤学的现状与发展趋势。3.肿瘤生物学的主要学习内容及教学安排。三、学时安排共1学时，含理论课1学时，实验课0学时，临床示教0学时。四、教学方法讲授法为主，采用线上教学和多媒体教学。五、重点、难点肿瘤的定义和恶性肿瘤的分类。六、授课语言汉语。第二章基因-环境交互作用与肿瘤一、目的要求1.简要向学生介绍HPV介导的宫颈癌从发现到能被预防的过程以及HBV介导的肝癌在我国的危害以及在防治方面取得的重大进展和不足，激发学生爱国情怀，激发学生学习老一辈科学家团结协作、艰苦奋斗、勇攀科学高峰的伟大精神。2
2 第一章 绪论 一、目的要求 1.向学生简要介绍中国肿瘤预防、诊断和治疗发展史，培养学生爱国情怀，培 养学生探索未知、追求真理、勇攀科学高峰的责任感和使命感。 2.掌握肿瘤的定义。 3.了解肿瘤的十大特征。 4. 熟悉恶性肿瘤的分类。 5.了解肿瘤发病机制研究发展史。 6.了解常见肿瘤。 7.了解肿瘤常见诊断技术。 8.了解肿瘤主要治疗手段。 二、主要内容 1．对肿瘤认识发展的历史。 2．肿瘤学的现状与发展趋势。 3．肿瘤生物学的主要学习内容及教学安排。 三、学时安排 共 1 学时，含理论课 1 学时，实验课 0 学时，临床示教 0 学时。 四、教学方法 讲授法为主，采用线上教学和多媒体教学。 五、重点、难点 肿瘤的定义和恶性肿瘤的分类。 六、授课语言 汉语。 第二章 基因-环境交互作用与肿瘤 一、目的要求 1. 简要向学生介绍HPV介导的宫颈癌从发现到能被预防的过程以及HBV介导的 肝癌在我国的危害以及在防治方面取得的重大进展和不足，激发学生爱国情怀，激 发学生学习老一辈科学家团结协作、艰苦奋斗、勇攀科学高峰的伟大精神
2.拓展生物信息学专业学生的基因-环境交互作用在肿瘤发生发展中的相关理论知识。3.熟悉常见致癌因素，包括外源性因素：化学因素、物理因素、致瘤性病毒、霉菌毒素等：内源性因素：机体免疫状态、遗传素质、激素水平和DNA损伤修复能力等。重点掌握外源致癌因素。4.了解化学致癌因素的作用方式分类，了解直接致癌物、间接致癌物、促癌物三大类。5.熟悉常见致癌病毒及其介导的肿瘤，重点熟悉乳头状瘤病毒、乙型肝炎病毒、EB病毒介导的肿瘤及其分子机制。6.了解癌变多阶段的分子基础及人类肿瘤的多阶段模型，重点了解胃癌和结直肠癌发生发展过程中的分子学事件。二、主要内容1.环境致癌因素。2.遗传易敏因素。3.存在的问题与展望。三、学时安排共2学时，含理论课2学时，实验课0学时，临床示教0学时。四、教学方法讲授法为主，采用线上教学和多媒体教学。五、重点、难点1.化学致癌因素的作用方式。2.常见致癌病毒及其介导的肿瘤。3．癌变多阶段的分子基础。六、授课语言汉语。第三章癌基因与抑癌基因3
3 2. 拓展生物信息学专业学生的基因-环境交互作用在肿瘤发生发展中的相关理 论知识。 3. 熟悉常见致癌因素，包括外源性因素：化学因素、物理因素、致瘤性病毒、 霉菌毒素等；内源性因素：机体免疫状态、遗传素质、激素水平和 DNA 损伤修复能 力等。重点掌握外源致癌因素。 4. 了解化学致癌因素的作用方式分类，了解直接致癌物、间接致癌物、促癌物 三大类。 5. 熟悉常见致癌病毒及其介导的肿瘤，重点熟悉乳头状瘤病毒、乙型肝炎病毒、 EB 病毒介导的肿瘤及其分子机制。 6. 了解癌变多阶段的分子基础及人类肿瘤的多阶段模型，重点了解胃癌和结直 肠癌发生发展过程中的分子学事件。 二、主要内容 1．环境致癌因素。 2．遗传易敏因素。 3．存在的问题与展望。 三、学时安排 共 2 学时，含理论课 2 学时，实验课 0 学时，临床示教 0 学时。 四、教学方法 讲授法为主，采用线上教学和多媒体教学。 五、重点、难点 1．化学致癌因素的作用方式。 2．常见致癌病毒及其介导的肿瘤。 3. 癌变多阶段的分子基础。 六、授课语言 汉语。 第三章 癌基因与抑癌基因
一、目的要求1.向学生介绍对癌基因研究的瓶颈开启了从人类基因组计划到ICGC到TCGA再到CCGC，人类生物信息大爆炸的时代已经来临，培养学生科学精神和团结协作精神，使学生体会到取得重大科学发现所需要的天时地利人和等因素，激发学生珍惜大好青年时光、勤奋学习、锐意进取、勇于创新、不负韶华。2.加强生物信息学专业学生对癌基因和抑癌基因的认识。3.熟悉癌基因和抑癌基因的定义。4.了解国际癌症基因组计划ICGP。5.熟悉逆转录病毒活化癌基因的机制。了解转导性逆转录病毒，顺式激活逆转录病毒和反式激活逆转录病毒。6.了解癌基因的分类。根据基因产物在细胞内的定位和生物学功能可分为：生长因子、生长因子受体、信号传导分子、转录因子、细胞程序性死亡及凋亡基因、细胞周期蛋白等。7.熟悉癌基因活化的主要方式，包括点突变、扩增、过度表达、重排和甲基化状态。8.了解常见蛋白质癌基因和抑癌基因在肿瘤发生发展中的作用。熟悉常见的癌基因家族（ras和myc）和抑癌基因家族（端粒酶、p53和PTEN）及其功能。9.了解非可控炎症的定义。10.了解肿瘤生物学行为的复杂性。二、主要内容1.癌基因研究的发展历史。2.RNA肿瘤病毒与病毒癌基因：癌基因的分类和功能；基因变异方式和癌基因活化：基因变异方式和抑癌基因失活。3.癌基因和抑癌基因与人类肿瘤：蛋白质类癌基因与抑癌基因和肿瘤生物学行为；miRNA类癌基因和抑癌基因与人类肿瘤（自主学习）：非编码RNA类癌基因和抑癌基因与肿瘤（自主学习）。4.癌基因和抑癌基因与肿瘤的靶向治疗。5.癌基因与肿瘤生物学的关键科学问题三、学时安排共3学时，含理论课3学时，实验课0学时，临床示教0学时。4
4 一、目的要求 1.向学生介绍对癌基因研究的瓶颈开启了从人类基因组计划到 ICGC 到 TCGA 再到 CCGC，人类生物信息大爆炸的时代已经来临，培养学生科学精神和团结协作 精神，使学生体会到取得重大科学发现所需要的天时地利人和等因素，激发学生珍 惜大好青年时光、勤奋学习、锐意进取、勇于创新、不负韶华。 2.加强生物信息学专业学生对癌基因和抑癌基因的认识。 3.熟悉癌基因和抑癌基因的定义。 4.了解国际癌症基因组计划 ICGP。 5.熟悉逆转录病毒活化癌基因的机制。了解转导性逆转录病毒，顺式激活逆转 录病毒和反式激活逆转录病毒。 6.了解癌基因的分类。根据基因产物在细胞内的定位和生物学功能可分为： 生 长因子、生长因子受体、信号传导分子、转录因子、细胞程序性死亡及凋亡基因、 细胞周期蛋白等。 7.熟悉癌基因活化的主要方式，包括点突变、扩增、过度表达、重排和甲基化 状态。 8.了解常见蛋白质癌基因和抑癌基因在肿瘤发生发展中的作用。熟悉常见的癌 基因家族（ras 和 myc）和抑癌基因家族（端粒酶、p53 和 PTEN）及其功能。 9.了解非可控炎症的定义。 10.了解肿瘤生物学行为的复杂性。 二、主要内容 1．癌基因研究的发展历史。 2．RNA 肿瘤病毒与病毒癌基因：癌基因的分类和功能；基因变异方式和癌基因 活化；基因变异方式和抑癌基因失活。 3．癌基因和抑癌基因与人类肿瘤：蛋白质类癌基因与抑癌基因和肿瘤生物学行 为；miRNA 类癌基因和抑癌基因与人类肿瘤（自主学习）；非编码 RNA 类癌基因和 抑癌基因与肿瘤（自主学习）。 4.癌基因和抑癌基因与肿瘤的靶向治疗。 5.癌基因与肿瘤生物学的关键科学问题 三、学时安排 共 3 学时，含理论课 3 学时，实验课 0 学时，临床示教 0 学时
四、教学方法讲授法为主，采用线上教学和多媒体教学。五、重点、难点1.癌基因的概念及癌基因活化的机制。2.蛋白质癌基因和抑癌基因在肿瘤发生发展中的作用。六、授课语言汉语。第四章肿瘤表观遗传学一、目的要求1.拓展生物信息学专业学生的肿瘤表观遗传学相关理论知识。2.了解表观遗传学的发展历史。掌握表观遗传学的概念，掌握肿瘤表观遗传学的概念。3.熟悉CpG岛的概念，熟悉DNA甲基化体系，及DNA甲基转移酶与甲基化CpG结合蛋白。了解启动子异常甲基化抑制基因转录的途径。了解抑癌基因甲基化与肿瘤发生。了解启动子异常甲基化所致肿瘤细胞信号转导紊乱。4.了解染色质的基本结构，熟悉组蛋白的修饰与基因转录活性的关系。熟悉组蛋白乙酰化的概念，及组蛋白乙酰化的过程。了解组蛋白乙酰化在肿瘤发生发展中的作用。掌握组蛋白甲基化的概念，及组蛋白甲基化的过程。了解PcG蛋白复合体，熟悉染色质重塑。5.了解表观遗传治疗法的策略，了解组蛋白甲基转移酶抑制剂的作用机制，了解组蛋白乙酰化酶抑制剂的策略。6.了解启动子的异常甲基化作为肿瘤分子标记物的优势，熟悉DNA甲基化检测技术：重亚硫酸钠预处理法，重亚硫酸盐-基因组测序法，甲基化特异性PCR。了解高通量DNA甲基化分析方法。二、主要内容1.表观遗传学。2.DNA甲基化。3.组蛋白甲基化。5
5 四、教学方法 讲授法为主，采用线上教学和多媒体教学。 五、重点、难点 1．癌基因的概念及癌基因活化的机制。 2．蛋白质癌基因和抑癌基因在肿瘤发生发展中的作用。 六、授课语言 汉语。 第四章 肿瘤表观遗传学 一、目的要求 1.拓展生物信息学专业学生的肿瘤表观遗传学相关理论知识。 2.了解表观遗传学的发展历史。掌握表观遗传学的概念，掌握肿瘤表观遗传学 的概念。 3.熟悉 CpG 岛的概念，熟悉 DNA 甲基化体系，及 DNA 甲基转移酶与甲基化 CpG 结合蛋白。了解启动子异常甲基化抑制基因转录的途径。了解抑癌基因甲基化与肿 瘤发生。了解启动子异常甲基化所致肿瘤细胞信号转导紊乱。 4.了解染色质的基本结构，熟悉组蛋白的修饰与基因转录活性的关系。熟悉组 蛋白乙酰化的概念，及组蛋白乙酰化的过程。了解组蛋白乙酰化在肿瘤发生发展中 的作用。掌握组蛋白甲基化的概念，及组蛋白甲基化的过程。了解 PcG 蛋白复合体， 熟悉染色质重塑。 5.了解表观遗传治疗法的策略，了解组蛋白甲基转移酶抑制剂的作用机制，了 解组蛋白乙酰化酶抑制剂的策略。 6.了解启动子的异常甲基化作为肿瘤分子标记物的优势，熟悉 DNA 甲基化检测 技术：重亚硫酸钠预处理法，重亚硫酸盐-基因组测序法，甲基化特异性 PCR。了解 高通量 DNA 甲基化分析方法。 二、主要内容 1．表观遗传学。 2．DNA 甲基化。 3．组蛋白甲基化