新冠病毒奥密克戎(0 micron,B.1.1.529) 变异株对 我市影响的风险评估及防控建议 广州市疾病预防控制中心 新冠专班风评组 郑志伟 2021.12.17
新冠病毒奥密克戎 （Omicron，B.1.1.529）变异株对 我市影响的风险评估及防控建议 广州市疾病预防控制中心 新冠专班风评组 郑志伟 2021.12.17
主要内容 山 岂 01 奥密克戎变异株概况及进展 02 各国奥密克戎变异株流行情况及管控 03 风险研判及防控建议
03 01 主要内容 奥密克戎变异株概况及进展 风险研判及防控建议 02 各国奥密克戎变异株流行情况及管控
山 堂 01 奥密克戎变异株概况及进展
01 奥密克戎变异株概况及进展
>>>Omicron (（B.1.1.529)变异株关键节点 CDC 奥密克戎关键节点时间轴：20天历程 南非从病例样本 南非向世卫组织WHO WHO命名为Omicron,中译名” WHO研判该毒株 首次检出 报告该变异株 奥密克戎”，VOC毒株（关切 风险非常高， B.1.1.529变异株 变异株，与德尔塔毒株同水平) 可能传播广泛 11月9日 11月24日 11月26日 11月29日 15天 2天 3天 唐南 Worid Health Organization 4
4 Omicron（B.1.1.529）变异株关键节点 11月9日 南非从病例样本 首次检出 B.1.1.529变异株 11月24日 南非向世卫组织WHO 报告该变异株 11月26日 WHO命名为Omicron，中译名” 奥密克戎”，VOC毒株（关切 变异株，与德尔塔毒株同水平） 11月29日 WHO研判该毒株 风险非常高， 可能传播广泛 15天 2天 3天 奥密克戎关键节点时间轴：20天历程
>>Omicron (B.1.1.529)变异株出现原因 CDC 特点：变异株突变位点多，>50个。 ·Omicron变异株突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株，尤其在病毒刺突(Spike)蛋白突变较多 Omicron变异株同时具有前4个关切变异株Alpha(阿尔法)、Beta(贝塔)、Gamma(伽玛)和Delta(德尔塔)刺突 蛋白的重要氨基酸突变位点。 可能原因： (1)在人体内进化：免疫缺陷患者感染新冠病毒后，在体内经历了较长时间的进化累 积了大量突变，通过偶然机会传播： (2)在动物体内进化：某种动物群体感染新冠病毒，病毒在动物群体传播过程中发生 适应性进化，突变速率高于人类，随后溢出传染到人类； (3)未被及时发现：该变异株在新冠病毒基因组变异监测落后的国家或地区持续流行 了很长时间，由于监测能力不足，其进化的中间代次病毒未能被及时发现。 奥密克戎(Omicron)刺突3D图 5
5 Omicron（B.1.1.529）变异株出现原因 特点：变异株突变位点多，>50个。 • Omicron变异株突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株，尤其在病毒刺突（Spike）蛋白突变较多 奥密克戎（Omicron）刺突3D图 可能原因： （1）在人体内进化：免疫缺陷患者感染新冠病毒后，在体内经历了较长时间的进化累 积了大量突变，通过偶然机会传播； （2）在动物体内进化：某种动物群体感染新冠病毒，病毒在动物群体传播过程中发生 适应性进化，突变速率高于人类，随后溢出传染到人类； （3）未被及时发现：该变异株在新冠病毒基因组变异监测落后的国家或地区持续流行 了很长时间，由于监测能力不足，其进化的中间代次病毒未能被及时发现。 • Omicron变异株同时具有前4个关切变异株Alpha（阿尔法）、Beta（贝塔）、Gamma（伽玛）和Delta（德尔塔）刺突 蛋白的重要氨基酸突变位点
>0 micron（B.1.1.529)变异株：进一步适应人体 CDC ·意大利研究团队发现：与德尔塔毒株相比，奥密克戎毒株拥有更多的刺突蛋白突变。这些变异多样化， 且大部分位于与人体细胞相互作用的区域。研究人员表示，新冠病毒通过变异进一步适应人体，但并不 一定意味着变得更加危险。 Delta Omicron 18 aa mutated residues in the Spike protein 43 aa mutated residues in the Spike protein 8 residues in >60%of available sequences 34 residues in >60%of available sequences 44料 ● >70% 40-70% 1540% 515% 1.5% The structuore of SARS-CoV-2 6
6 Omicron（B.1.1.529）变异株：进一步适应人体 意大利研究团队发现：与德尔塔毒株相比，奥密克戎毒株拥有更多的刺突蛋白突变。这些变异多样化， 且大部分位于与人体细胞相互作用的区域。研究人员表示，新冠病毒通过变异进一步适应人体，但并不 一定意味着变得更加危险
>0 micron（B.1.1.529)变异株：持续变异 CDC ●2021年12月7日，澳大利亚昆士兰州报告全球首例新冠变异株奥密克戎变种亚型的感染病例，该奥密克 戎变种亚型难以被PCR核酸检测（目前主流检测方法，与抗原检测相比精度更高）识别，且更具传染性。 ·2021年12月9日，英国研究发现，奥密克戎已出现变种，存在两种谱系，分为普通奥密克戎变异株BA.1 和新变体BA.2,BA.2缺乏一种特殊的基因变异，导致在常规PCR中无法检出。 7
7 Omicron（B.1.1.529）变异株：持续变异 2021年12月7日，澳大利亚昆士兰州报告全球首例新冠变异株奥密克戎变种亚型的感染病例，该奥密克 戎变种亚型难以被PCR核酸检测（目前主流检测方法，与抗原检测相比精度更高）识别，且更具传染性。 2021年12月9日，英国研究发现，奥密克戎已出现变种，存在两种谱系，分为普通奥密克戎变异株BA.1 和新变体BA.2，BA.2缺乏一种特殊的基因变异，导致在常规PCR中无法检出
>>Omicron (B.1.1.529)变异株传播力：可能强于德尔塔 CDC 全球尚无关于奥密克戎传播力、致病力和免疫逃逸能力等方面的系统研究数据。 分子角度：核衣壳蛋白(N蛋白)有2个变异可以增加感染(R203K和G204R);病毒膜蛋白(M蛋白)中NSP6蛋白缺失， 可以增加传染性。 病例数量角度：(1)南开大学黄森忠团队通过建模分析发现，奥密克戎的传染力比新冠变异株德尔塔的传染力增加37.5%。 (2)日本研究：200个病例样本，奥密克戎在早期阶段传染性比德尔塔高4.2倍 传播速度迅速 逐步成为优势株 南非疫情受Delta变异株影响后近期疫情走势比较平缓，但 >11月24日，南非卫生官员表示南非豪登省新增1100例病例中 Omicron出现以来，非洲第四轮疫情已出现！(14日世卫组织) 90%为奥密克戎，远超Delta等前期变异株同期水平。 非洲一周(12月6日-12日)新增确诊病例较上周增加83%，是 12月14日，美国疾控表示：上一周新增确诊病例中奥密克戎占 2020年5月以来最大增幅。 2.9%,而上上周奥密克戎仅占0.4%，逐渐占优势！ A new variant is spreading rapidly in South Africa,and appears to be out- There are signs that B.1.1.529 may be triggering a new wave in South Africa competing other variants much faster than previous variants of concern did 20,000 daily cases in South Africa 南非近指日病例趋的图 Share of all sequenced cases'in South Africa accounted for by each variant. 7da￥en0aOe by number of days since it passed 1% 出 100% 15.000 ●B.11529 Delta 80 10.000 60 5,000 40 Other yaint 0 4B.1.1.529 20 May Jun Jut Aug Sep Oct Nov Dec Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sep Oct Nov Dec 2020 02 2行g 50 100
8 Omicron（B.1.1.529）变异株传播力：可能强于德尔塔 病例数量角度：（1）南开大学黄森忠团队通过建模分析发现，奥密克戎的传染力比新冠变异株德尔塔的传染力增加37.5%。 （2）日本研究：200个病例样本，奥密克戎在早期阶段传染性比德尔塔高4.2倍 全球尚无关于奥密克戎传播力、致病力和免疫逃逸能力等方面的系统研究数据。 逐步成为优势株 11月24日，南非卫生官员表示南非豪登省新增1100例病例中 90%为奥密克戎，远超Delta等前期变异株同期水平。 12月14日，美国疾控表示：上一周新增确诊病例中奥密克戎占 2.9%，而上上周奥密克戎仅占0.4%，逐渐占优势！ 传播速度迅速 南非疫情受Delta 变异株影响后近期疫情走势比较平缓，但 Omicron 出现以来，非洲第四轮疫情已出现！（14日世卫组织） 非洲一周（12月6日-12日）新增确诊病例较上周增加83%，是 2020年5月以来最大增幅。 南非近期日病例趋势图 分子角度：核衣壳蛋白（N蛋白）有2个变异可以增加感染(R203K和 G204R)；病毒膜蛋白（M蛋白）中NSP6蛋白缺失，可以增加传染性
>》》0 micron（(B.1.1.529)变异株致病力：以轻微症状或无症状为主 DC 症状轻微，五大症状：疲劳乏力、夜间盗汗、喉咙痒、干咳、轻微肌肉酸痛。 住院时间缩短，重症率下降，死亡率下降。 相关报道对奥密克戎患者症状严重程度的描述： ●12月14日，世卫表示：南非近一周报告入院率大幅上升，但重症监护病床占用率较低(7.5%)，死亡病例他 保持在较低水平。 ●南非传染病研究所报告：在近几周住院的新冠患者中，平均住院时间从8天缩短为2.8天。30%为严重病例，是 前一波疫情重症的一半；近期死亡率3%，而南非早期暴发病例中，死亡率达20%。 ●11月28日，南非医学协会主席库切表示，患者大多因“极度疲劳”就诊，还出现了轻微的肌肉酸痛、喉咙痒 和干咳等症状，只有少数人出现发烧。这些轻微症状与其他变异株导致的更严重症状有所不同。 ●据欧洲疾控介绍，到目前为止，所有奥密克戎感染者都只表现了轻微症状或为无症状，没有重症和死亡病例。 ●但并无证据表明未来不会有“更严重”的症状出现，尤其老年群体及未接种疫苗的群体出现重症的可能仍然存 在。 ●英国已至少有1例因奥密克戎死亡病例 9
9 Omicron（B.1.1.529）变异株致病力：以轻微症状或无症状为主 相关报道对奥密克戎患者症状严重程度的描述： 12月14日，世卫表示：南非近一周报告入院率大幅上升，但重症监护病床占用率较低（7.5%），死亡病例也 保持在较低水平。 南非传染病研究所报告：在近几周住院的新冠患者中，平均住院时间从8天缩短为2.8天。30%为严重病例，是 前一波疫情重症的一半；近期死亡率3%，而南非早期暴发病例中，死亡率达20%。 11月28日，南非医学协会主席库切表示，患者大多因“极度疲劳”就诊，还出现了轻微的肌肉酸痛、喉咙痒 和干咳等症状，只有少数人出现发烧。这些轻微症状与其他变异株导致的更严重症状有所不同。 据欧洲疾控介绍，到目前为止，所有奥密克戎感染者都只表现了轻微症状或为无症状，没有重症和死亡病例。 但并无证据表明未来不会有“更严重”的症状出现，尤其老年群体及未接种疫苗的群体出现重症的可能仍然存 在。 英国已至少有1例因奥密克戎死亡病例。 症状轻微，五大症状：疲劳乏力、夜间盗汗、喉咙痒、干咳、轻微肌肉酸痛。 住院时间缩短，重症率下降，死亡率下降
>0 micron(B.1.1.529)变异株：再次感染风险增加 CDC 定义：二次感染指患者两次新冠病毒检测呈阳性且相隔至少90天。 研究1：初步证据表明，与其他4个VOC相比(alpha、beta、gamma和delta),Omicron变异株再次 感染的风险增加。在南非几乎所有省份，感染Omicron变异株的病例数量都在增加。 研究2：12月2日，南非卫生专家初步研究结果显示，新型新冠变异病毒奥密克戎毒株引发二次感染的风 险是德尔塔毒株和贝塔毒株的三倍。 南非近期新增病例趋势图 。Confirmed .Deaths.Vaccinations 12/152021 40000 New confirmed 23,857 。7-d8 y average23.043 3000 10.00 /2四 1a/28 11/17 127 10
10 Omicron（B.1.1.529）变异株：再次感染风险增加 研究1：初步证据表明，与其他4个VOC相比（alpha、beta、gamma和delta），Omicron变异株再次 感染的风险增加。在南非几乎所有省份，感染Omicron变异株的病例数量都在增加。 南非近期新增病例趋势图 研究2：12月2日，南非卫生专家初步研究结果显示，新型新冠变异病毒奥密克戎毒株引发二次感染的风 险是德尔塔毒株和贝塔毒株的三倍。 定义：二次感染指患者两次新冠病毒检测呈阳性且相隔至少90天