上海交通大学：《生物技术与人类》通识课程教学资源（阅读理解）生物技术与人类 娜则古丽

上海交通大学通识教育立项核心课程 课程名称：生物技术与人类课程编号： BI913姓名： 娜则古丽 班级：F1216102学号：5121619045专业：环境科学与工程学院 阅读与理解 题目编号 4 得分 序 阅读文章名称 1 A new hominin foot from Ethiopia shows multiple Pliocene bipedal adaptations 2 Additive threats from pathogens,climate and land-use change for global amphibian diversity 3 Causes,consequences and ethics 4 Changing Arctic Ocean freshwater pathways 5 Clonal evolution in relapsed acute myeloid leukaemia revealed by whole-genome sequencing 6 Comparing the yields of organic and conventional agriculture 7 Consequences of changing 8 Ecology drives a global network of gene exchange connecting the human microbiome 9 Emerging fungal threats to animal,plant and ecosystem health 10 Evolution of increased complexity in a molecular machine 11 Genetic contribution to stability and change in intelligence from childhood to old age 12 Getting the measure of biodiversity 13 Global patterns in biodiversity 14 Global warming preceded by increasing carbon dioxide concentrations during the last deglaciation 15 Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence 16 Prediction mutation outcome from early stochastic variation in genetic interaction partners 17 Rapid evolutionary divergence and ecotypic diversification of germination behavior in weedy rice populations 18 Recent contribution of glaciers and ice caps to sea level rise 19 Regeneration of whole fertile plants from 30000-y-old fruit tissue buried in Siberian permafrost 20 Reversal of cocaine-evoked synaptic potentiation resets drug-induced adaptive behavior 21 Stability and complexity in model ecosystems 22 Stability criteria for complex ecosystems 23 Systematic conservation planning 24 The diversity-stability debate 25 The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses 26 Twenty-first-century warming of a large Antarctic ice-shelf cavity by a redirected coastal current 27 Will a Large Complex System be Stable

上海交通大学通识教育立项核心课程 课程名称： 生物技术与人类 课程编号： BI 913 姓名： 娜则古丽 班级： F1216102 学号： 5121619045 专业： 环境科学与工程学院 阅读与理解 题目编号 4 得分 序 号 阅读文章名称 1 A new hominin foot from Ethiopia shows multiple Pliocene bipedal adaptations 2 Additive threats from pathogens, climate and land-use change for global amphibian diversity 3 Causes, consequences and ethics 4 Changing Arctic Ocean freshwater pathways 5 Clonal evolution in relapsed acute myeloid leukaemia revealed by whole-genome sequencing 6 Comparing the yields of organic and conventional agriculture 7 Consequences of changing 8 Ecology drives a global network of gene exchange connecting the human microbiome 9 Emerging fungal threats to animal,plant and ecosystem health 10 Evolution of increased complexity in a molecular machine 11 Genetic contribution to stability and change in intelligence from childhood to old age 12 Getting the measure of biodiversity 13 Global patterns in biodiversity 14 Global warming preceded by increasing carbon dioxide concentrations during the last deglaciation 15 Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence 16 Prediction mutation outcome from early stochastic variation in genetic interaction partners 17 Rapid evolutionary divergence and ecotypic diversification of germination behavior in weedy rice populations 18 Recent contribution of glaciers and ice caps to sea level rise 19 Regeneration of whole fertile plants from 30000-y-old fruit tissue buried in Siberian permafrost 20 Reversal of cocaine-evoked synaptic potentiation resets drug-induced adaptive behavior 21 Stability and complexity in model ecosystems 22 Stability criteria for complex ecosystems 23 Systematic conservation planning 24 The diversity–stability debate 25 The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses 26 Twenty-first-century warming of a large Antarctic ice-shelf cavity by a redirected coastal current 27 Will a Large Complex System be Stable

James Morison1,Ron Kwok2,Cecilia Peralta-Ferriz1,Matt Alkire1,Ignatius Rigor1,Roger Andersen1 Mike Steele Nature(10705):10.1038 Changing Arctic Ocean freshwater pathways 更改北冰洋淡水的途径 【背景知识】 L.北极涛动指数(Arctic Oscillation index):指北半球中纬度地区（约北纬 45度)与北极地区气压形势差别的变化。它是一个代表北极地区大气环流的重 要气候指数，可分为正位相和负位相。 北极通常受低气压系统支配，而高气压系统则位于中纬度地区。当北极涛动处 于正位相时，这些系统的气压差较正常强，限制了极区冷空气向南扩展：当北 极涛动处于负位相时，这些系统的气压差较正常弱，冷空气较易向南侵袭。北 大西洋涛动和北极涛动二者有相似之处。于是有争论关于哪一个更符合空气动 力学的基本原理。Ambaum et al.称北大西洋涛动应该用更好的物理学的理论 加以定义。在过去的半个世纪，北极涛动指数在正值和负值之间转换。1970年 开始，指数开始趋向正值，北极气压低于平均气压，引起欧亚北部和美国大部 分地区的相对高温。2010年伊始，北半球经历了似乎比往年冷许多的冬季，科 学家认为是北极涛动引起的。北极的气压高于平均气压，将更多的冷空气挤向 中纬度地区。 2.A0指数：指北极震荡指数

James Morison1, Ron Kwok2, Cecilia Peralta-Ferriz1, Matt Alkire1, Ignatius Rigor1, Roger Andersen1 & Mike Steele Nature (10705):10.1038 Changing Arctic Ocean freshwater pathways 更改北冰洋淡水的途径 【背景知识】 1. 北极涛动指数（Arctic Oscillation index）：指北半球中纬度地区（约北纬 45 度）与北极地区气压形势差别的变化。它是一个代表北极地区大气环流的重 要气候指数，可分为正位相和负位相。 北极通常受低气压系统支配，而高气压系统则位于中纬度地区。当北极涛动处 于正位相时，这些系统的气压差较正常强，限制了极区冷空气向南扩展；当北 极涛动处于负位相时，这些系统的气压差较正常弱，冷空气较易向南侵袭。 北 大西洋涛动和北极涛动二者有相似之处。于是有争论关于哪一个更符合空气动 力学的基本原理。Ambaum et al.称北大西洋涛动应该用更好的物理学的理论 加以定义。在过去的半个世纪，北极涛动指数在正值和负值之间转换。1970 年 开始，指数开始趋向正值，北极气压低于平均气压，引起欧亚北部和美国大部 分地区的相对高温。2010 年伊始，北半球经历了似乎比往年冷许多的冬季，科 学家认为是北极涛动引起的。北极的气压高于平均气压，将更多的冷空气挤向 中纬度地区。 2. AO 指数：指北极震荡指数

AO:Observed ENSM forecasts 1000mbZ(0bs:21Nov2012-20Mar2013) A0 index mean=-1.3578 1DEC 160EC 1JAN 16JAN 1FEB 18FEB 1WAR 16MAR 1AP限 2012 2013 1000mb Z (7day Forecast) AO index mean=-1.0849 cor(w/obs)=0.7925 1DEC 160EC 1JAN 16JAN 1FEB 16FEB 1AR 16HAR 1APR 2012 2013 1000mb Z (10day Forecast) A0 index mean=-1.0905 cor(w/obs)=0.5643 班 16DEC 16JAN 1FEB 16FEB 1WAR 16MAR 1APR 1000mb Z (14day Forecast) A0 index mean=-0.9233 cor(w/obs)-0.3849 1DEC 160EC 16JAN 1FEB 16FEB 1WAR 16MAR 1APR 2012 2013 【创新点】 1.从时间上，研究的时间比较长，从1990年到2009年。1990s1,2并持续3到 2008年，至少年底届时，北冰洋可能已经获得了四倍多，新鲜的水由大盐度异 常4,50f20世纪70年代，提高减缓全球海洋环流6幽灵清新一直归因于增加 的海冰融化1和贡献径流7，但一个主要的解释已经加强的博福特高一海平面 大气的特征峰压力-2,8-其趋向于加速的反气旋（顺时针）风模式引起的地表 淡水汇合。观测表明，在一个时间 2.从内容来说，分析得很清晰，包括了所有的可能性。记录减少海冰范围2005

【创新点】 1. 从时间上，研究的时间比较长，从 1990 年到 2009 年。1990s1,2 并持续 3 到 2008 年，至少年底届时，北冰洋可能已经获得了四倍多，新鲜的水由大盐度异 常 4,5of 20 世纪 70 年代，提高减缓全球海洋环流 6 幽灵清新一直归因于增加 的海冰融化 1 和贡献径流 7，但一个主要的解释已经加强的博福特高一海平面 大气的特征峰压力-2,8-其趋向于加速的反气旋（顺时针）风模式引起的地表 淡水汇合。观测表明，在一个时间 2. 从内容来说，分析得很清晰，包括了所有的可能性。记录减少海冰范围 2005

至2008年的，占主导地位淡水含量的变化是增加了加拿大海盆在欧亚海盆下 降平衡。 淡水的变化是由于一气旋（逆时针）转变的欧亚海洋途径径流强行通过加强西 向东北部北半球大气环流特征是增加北极涛动指数。 从2005年到2008年，增加的A0指数造成流通变得困难，气旋和欧亚河川径 流量将越来越多地转移向东在欧亚海盆牺牲的加拿大海盆，在平均北冰洋淡水 几乎可以忽略不计的增长。 2008年水化学取样表明，相对于34.87PSU,太平洋水和欧亚径流参考盐度提 供淡水的主导部分中的上部200个米博福特Sea16。海冰融化比例相对较小， 几乎总是负的，表明海冰生产的主导地位出口超过融化。 【读后感】 作为一个英语水平不大好的学生，平时很怕接触这类英语的自然科学类的文 献。乍一看英文文献，我有一种眼花缭乱，一头雾水的感觉。这可能是由于语言 的障碍、对专业词汇及研究技术方法的不了解所致。但在借助词典和互联网理解 了一些专业术语和研究技术后，阅读文献就变得非常有趣，并且带来一种探究新 事物的快乐，感谢老师为我带来了这样一次机会。当然，在这种自学文献的过程 中，我也学到了一些研究的基本流程和注意的方面。 从方法上来说，我了解到：展开一项研究，可以是选取前人未探索过的主题， 也可以在别人探索过的主题上，对研究方法或研究范围有新的拓展。从该篇文献 中我学习到主要的研究过程有：提出假设、选取研究的对象、回收并筛选研究数 据、确定分析数据的方法、检验方法的合理性、误差分析、得出结论、阐明研究 的局限性以及未来可以探索的方向。这些过程每一步都需要严谨的思维及缜密的 逻辑，以不断推动科学技术的进步。 举例而言，研究人员总是致力于缩小误差。研究结果证实，径流量是在北冰 洋重要的影响，树立了径流途径的空间和时间表现是由北极涛动调制，而不是实 力风力驱动的波弗特涡流循环。观察表明理想化北冰洋(Inthelow-AO-indexmode 环流模式，anexpanded highinSLP驱动一个反气旋环流面超极本流域。 而且每个研究也有它自身的局限，在解决旧问题的过程中甚至会带来一系列 的新问题。气候模型表明温室越来越A0升温，但一般使用的大气模型产生集中在 中央北冰洋28-30或显示低压异常负A0偏置。气候模型需要捕获A0的非对称效 应对SLP在北极预测我们的气候变化对北冰洋的作用。 【参考文献】 1.McPhee,M.G.,Stanton,T.P.,Morison,J.H.Martinson,D.G

至 2008 年的，占主导地位淡水含量的变化是增加了加拿大海盆在欧亚海盆下 降平衡。 淡水的变化是由于一气旋（逆时针）转变的欧亚海洋途径径流强行通过加强西 向东北部北半球大气环流特征是增加北极涛动指数。 从 2005 年到 2008 年，增加的 AO 指数造成流通变得困难，气旋和欧亚河川径 流量将越来越多地转移向东在欧亚海盆牺牲的加拿大海盆，在平均北冰洋淡水 几乎可以忽略不计的增长。 2008 年水化学取样表明，相对于 34.87 PSU，太平洋水和欧亚径流参考盐度提 供淡水的主导部分中的上部 200 个米博福特 Sea16。海冰融化比例相对较小， 几乎总是负的，表明海冰生产的主导地位出口超过融化。 【读后感】 作为一个英语水平不大好的学生，平时很怕接触这类英语的自然科学类的文 献。乍一看英文文献，我有一种眼花缭乱，一头雾水的感觉。这可能是由于语言 的障碍、对专业词汇及研究技术方法的不了解所致。但在借助词典和互联网理解 了一些专业术语和研究技术后，阅读文献就变得非常有趣，并且带来一种探究新 事物的快乐，感谢老师为我带来了这样一次机会。当然，在这种自学文献的过程 中，我也学到了一些研究的基本流程和注意的方面。 从方法上来说，我了解到：展开一项研究，可以是选取前人未探索过的主题， 也可以在别人探索过的主题上，对研究方法或研究范围有新的拓展。从该篇文献 中我学习到主要的研究过程有：提出假设、选取研究的对象、回收并筛选研究数 据、确定分析数据的方法、检验方法的合理性、误差分析、得出结论、阐明研究 的局限性以及未来可以探索的方向。这些过程每一步都需要严谨的思维及缜密的 逻辑，以不断推动科学技术的进步。 举例而言，研究人员总是致力于缩小误差。研究结果证实，径流量是在北冰 洋重要的影响，树立了径流途径的空间和时间表现是由北极涛动调制，而不是实 力风力驱动的波弗特涡流循环。观察表明理想化北冰洋（Inthelow-AO-indexmode 环流模式，anexpanded highinSLP 驱动一个反气旋环流面超极本流域。 而且每个研究也有它自身的局限，在解决旧问题的过程中甚至会带来一系列 的新问题。气候模型表明温室越来越 AO 升温，但一般使用的大气模型产生集中在 中央北冰洋 28-30 或显示低压异常负 AO 偏置。气候模型需要捕获 AO 的非对称效 应对 SLP 在北极预测我们的气候变化对北冰洋的作用。 【参考文献】 1. McPhee, M. G., Stanton, T. P., Morison, J. H. & Martinson, D. G

Freshening of the upperocean inthe Arctic:isperennialsea ice disappearing?Geophys.Res. Lett.25, 1729-1732(1998). 2.Proshutinsky,A.et al.Beaufort Gyre freshwater reservoir:state and variability from observations.J.Geophys.Res.114,C00A10,http://dx.doi.org/10.1029/ 2008JC005104(2009). 3.Rabe,B.et al.An assessment of Arctic Ocean freshwater content changes from the 1990s to the 2006-2008 period.Deep Sea Res.I 58,173-185 (2011). 4.McPhee,M.G.,Proshutinsky,A.,Morison,J.,Steele,M.Alkire,M. Rapid change in freshwater content of the Arctic Ocean.Geophys.Res.Lett.36,L10602, http:/ dx.doi.org/10.1029/2009GL037525(2009). 5.Dickson,R.R.,Meincke,J.,Malmberg,S.A.&Lee,A.J.The 'Great Salinity Anomaly' in the northern North Atlantic 1968-1982.Prog.Oceanogr.20,103-151 (1988)

Freshening of the upperocean inthe Arctic: isperennialsea ice disappearing? Geophys. Res. Lett. 25, 1729–1732 (1998). 2. Proshutinsky, A. et al. Beaufort Gyre freshwater reservoir: state and variability from observations. J. Geophys. Res. 114, C00A10, http://dx.doi.org/10.1029/ 2008JC005104 (2009). 3. Rabe, B. et al. An assessment of Arctic Ocean freshwater content changes from the 1990s to the 2006–2008 period. Deep Sea Res. I 58, 173–185 (2011). 4. McPhee, M. G., Proshutinsky, A., Morison, J., Steele, M. & Alkire, M. Rapid change in freshwater content of the Arctic Ocean. Geophys. Res. Lett. 36, L10602, http:// dx.doi.org/10.1029/2009GL037525 (2009). 5. Dickson, R. R., Meincke, J., Malmberg, S. A. & Lee, A. J. The ‘Great Salinity Anomaly’ in the northern North Atlantic 1968–1982. Prog. Oceanogr. 20, 103–151 (1988)