基因定位gene location 连锁分析(linkage analysis) 体细胞杂交法(somatic cell hybridization) 克隆嵌板法(clone panel method) 原位杂交(in situ hybridization) 荧光原位杂交(florescence in-situ hybridization,FISH) 基因定位的应用 连锁分析检测基因突变指导遗传病的诊断 促进对癌基因和瘤抑制基因的定位与克隆 致病基因克隆：一功能克隆，二位置克隆 人类基因组计划
基因定位 gene location 连锁分析(linkage analysis) 体细胞杂交法（somatic cell hybridization） 克隆嵌板法（clone panel method） 原位杂交（in situ hybridization） 荧光原位杂交（florescence in-situ hybridization,FISH） 基因定位的应用 连锁分析检测基因突变指导遗传病的诊断 促进对癌基因和瘤抑制基因的定位与克隆 致病基因克隆：一功能克隆，二位置克隆 人类基因组计划
连锁分析 1911 X 1968 1 Y+ W+ Y+Wt Recombination Cross Over Homologous Chromosomes Pair Recombinant W+ Chromatids
连锁分析 1911 x 1968 1
Recomnbination fraction- Y+ W+ W+ W Cross Over Homologous Y+ W+ cM Chromosomes Pair
Recomnbination fraction cM
连锁分析 100/50 60/40 50/60 100/60 100/40 50/40 100/40 50/60 100/40 1、标记位点必须与致病 100白白50 60 中40 基因连锁。 2、标记位点必须具有 多态性。 单基因分析、多基因分析 父 母
连锁分析—— 100/50 60/40 50/60 100/60 100/40 50/40 100/40 50/60 100/40 父 母 100 50 60 40 1、标记位点必须与致病 基因连锁。 2、标记位点必须具有 多态性。 单基因分析、多基因分析
遗传标记 1、第一代遗传标记一限制性酶切片段长度 多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP) 8kb 5kb 3kb 在个体和群体中，片段长度表现出多态性。 如3kb,5kb,7kb,8kb. RFLP呈现孟德尔式遗传。 常用检查方法：核酸杂交；PCR-酶切等
遗传标记 1、第一代遗传标记—限制性酶切片段长度 多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP) 8kb 5kb 3kb 在个体和群体中，片段长度表现出多态性。 如3kb, 5kb, 7kb, 8kb… RFLP呈现孟德尔式遗传。 常用检查方法：核酸杂交；PCR-酶切等
产生多态性的原因是内切酶位点的变化。 原位点的消失；新位点的产生。 GAATTC GATTTC CTTAAG CTAAAG 2 3kb 2kb
产生多态性的原因是内切酶位点的变化。 原位点的消失；新位点的产生。 GAATTC CTTAAG GATTTC CTAAAG 1 2 1 2 I II 2kb 3kb 5kb 7kb
2、第二代遗传标记一微卫星DNA(Micro- satellite DNA) 属高度重复序列，重复单元2~6bp, 重复区大多几十~几百bp,分散在基因组 中，大多不存在于编码序列内，具有较高 的多态性。呈现孟德尔式遗传。目前微卫 星DNA已经发现了2万余个位点。 TTCAGCTAGCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGCTTGC AAGTCGATCGAGTCGTCGTCGTCGTCGTCTCGAACG 常用检查方法：PCR等
2、第二代遗传标记—微卫星DNA(Microsatellite DNA) 属高度重复序列，重复单元2~6bp， 重复区大多几十~几百bp，分散在基因组 中，大多不存在于编码序列内，具有较高 的多态性。呈现孟德尔式遗传。目前微卫 星DNA已经发现了２万余个位点。 TTCAGCTAGCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGCTTGC AAGTCGATCGAGTCGTCGTCGTCGTCGTCTCGAACG 常用检查方法：PCR等
微卫星DNA PCR扩增结果（示例）： 500bp 400bp 300bp 240bp 该结果显示在所检查的人群中，该位点多 态性有4种。 微卫星DNA差异最小只相差2个碱基（重 复片段只有2个碱基)
微卫星DNA PCR扩增结果（示例）： 500bp 400bp 300bp 240bp 该结果显示在所检查的人群中，该位点多 态性有4种。 微卫星DNA差异最小只相差2个碱基（重 复片段只有2个碱基）
2、第三代遗传标记一单核苷酸多态性 (SNP) 某些DNA位点上，单个碱基存在着变化。 如： AATGGCGTAAGTCCGACCGTTCAGACTTGCCAGCT 个体A AATGGCCTAAGTCCGACCGTTCAGACTTGCCTGCT 个体B AATGGCATAAGTCCGACCGTTCAGACTTGCCGGCT 个体C SNP分布于整个基因组，可在基因内， 也可在基因间。估计每1000个bp存在一个。 在人类DNA序列变异中，SNP占90%. 单个碱基的插入和缺失不认为是SNP。 目前已知基因组中含有150万个SNP
2、第三代遗传标记—单核苷酸多态性 (SNP) 某些DNA位点上，单个碱基存在着变化。 如： AATGGCGTAAGTCCGACCGTTCAGACTTGCCAGCT AATGGCCTAAGTCCGACCGTTCAGACTTGCCTGCT AATGGCATAAGTCCGACCGTTCAGACTTGCCGGCT 个体A 个体B 个体C SNP分布于整个基因组，可在基因内， 也可在基因间。估计每1000个bp存在一个。 在人类DNA序列变异中，SNP占90%。 单个碱基的插入和缺失不认为是SNP。 目前已知基因组中含有150万个SNP
RFLP法诊断苯丙酮尿症 Sph Sph1 SphI PH -11.0kb —9.7kb SphI SphI Sph I SphI PH -11.0kb +7.0kb 1 kb ⑦2 11.0 9.717.0 9.7/7.0 9.7 7.0 9.7/9.7 7.07.0 A B 图9-19SMI酶对PKU患者的RFLP分析 A,系谱：B.RFLP图
RFLP法诊断苯丙酮尿症