上海交通大学通识教育立项核心课程 课程名称:生物技术与人类课程号:BI913 班级号:一 2018-2019-2-BI913-397833 姓名:屠一昕 学号:515015910001 专业:建筑系 阅读与理解 阅读文章名称 Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp:Current status and potential applications 得分 Zhou X W,Cong WR,Su K Q,et al.Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp: Current status and potential applications[J].CRC Critical Reviews in Microbiology,2013,39(4):11. 中文题目:来自灵芝的木质素降解酶:现状和潜在的应用 姓名:屠一昕 学院:设计学院 一,背景知识 灵芝属于白腐菌担子菌灵芝属,是一种在中国、日本、韩国和其它亚洲国家 很流行的药用植物。在中国的古书中最早被称为“瑞草”或“芝”,从汉代开始, “灵芝”这个名字开始在古籍中出现。然而现代灵芝分类中的灵芝和中国古籍中 的灵芝并不是同一种东西,后者的范围更大一些,还包括了多孔菌和本目菌中的 其它菌种四。 在过去的30年,科学家们不断地研究它的生物活性成分和药理作用,发现灵 芝对于很多疾病的预防和治疗都有很大帮助。灵芝中有很多生物活性成分,包括 小分子化合物,多糖,蛋白质,酶,多糖一蛋白质复合物。由于它独特的药理作 用,它被列入了中国药典和美国草药药典。以往有大量文献侧重研究灵芝的药理 作用,而这些药理作用也已经被现代实验所证实。包括抗癌、保肝解毒、治疗心
上海交通大学通识教育立项核心课程 课程名称: 生物技术与人类 课程号: BI913 班级号: 2018-2019-2-BI913-397833 姓名: 屠一昕 学号: 515015910001 专业: 建筑系 阅读与理解 阅读文章名称 Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp: Current status and potential applications 得分 Zhou X W , Cong W R , Su K Q , et al. Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp: Current status and potential applications[J]. CRC Critical Reviews in Microbiology, 2013, 39(4):11. 中文题目:来自灵芝的木质素降解酶:现状和潜在的应用 姓名:屠一昕 学院:设计学院 一.背景知识 灵芝属于白腐菌担子菌灵芝属,是一种在中国、日本、韩国和其它亚洲国家 很流行的药用植物。在中国的古书中最早被称为“瑞草”或“芝”,从汉代开始, “灵芝”这个名字开始在古籍中出现。然而现代灵芝分类中的灵芝和中国古籍中 的灵芝并不是同一种东西,后者的范围更大一些,还包括了多孔菌和本目菌中的 其它菌种 [2]。 在过去的 30 年,科学家们不断地研究它的生物活性成分和药理作用,发现灵 芝对于很多疾病的预防和治疗都有很大帮助。灵芝中有很多生物活性成分,包括 小分子化合物,多糖,蛋白质,酶,多糖 - 蛋白质复合物。由于它独特的药理作 用,它被列入了中国药典和美国草药药典 [2]。以往有大量文献侧重研究灵芝的药理 作用,而这些药理作用也已经被现代实验所证实。包括抗癌、保肝解毒、治疗心
血管疾病、治疗神经衰弱,治疗慢性支气管炎、支气管哮喘,还可以对抗过敏、 抗氧化、抗炎、抗寄生虫、美容等。总之,灵芝对于心血管系统,呼吸系统,内 分泌和代谢系统等都有益处。 但是本文并没有研究灵芝的药理学性质,而是研究了它另一方面潜在的特性 一一木质素降解酶。文章研究了目前关于来自灵芝属的木质素修饰酶的文献,分 析和探讨了该酶的潜在用途以及木质纤维素降解的组分,结构和过程,也总结了 参与木质素降解的其他酶的数量。灵芝的这一特性具有很大的非药理学价值,比 如木质素降解酶在环境保护上具有潜在作用。这篇文章可作为这方面的一个有用 参考。 二.文章亮点(创新点) 木质纤维素是植物的主要结构组分之一,也是可再生有机材料的来源。它有 三个主要成分:纤维素,半纤维素和木质素。木质纤维素在自然界中含量丰富, 却只有少数被人类利用,会造成环境负担。而灵芝作为白腐真菌的一种,能够释 放木质素降解酶包括LiP、MnP、Lac和一些其它的酶,能分解木质纤维素,拥有 很好的发展前景。本文有以下亮点: 1.文章逻辑严谨,写作顺序清晰。总体上采用了从特点到用途,从大到小, 从一般到特殊的写作顺序。前半部分讲了白腐真菌中的木质纤维素降解酶还原降 解木质素的原理,而在白腐真菌这一大类中,“灵芝具有最强的分解木质素的能 力”,从而具体介绍对于灵芝的降解木质素的研究。而在文章局部采用了由定性 到定量、由现象到本质的顺序,如首先介绍不同种类的灵芝具有不同的产生木质 素降解酶的能力后又定量地介绍三种最大酶活性的数据:如首先介绍白腐真菌还 原木质素成为C02和H20的现象,后介绍白腐真菌的酶和待降解的底物关系和其 中的深层原理。这样的写作顺序循序渐进,符合认知事物的过程,易于让读者接 受。 2.文章论述语言严谨,具有很高的科学性。在论述白腐真菌的降解过程和特 点时,通过引用前人的实验,介绍了“并非所有的白腐真菌都可以同时分泌LP, MnP和Lac,一些白腐真菌只能分泌其中一两个;酶的产生与培养条件密切相关。” 而在论述灵芝的降解过程和特点时,又讲到了类似的结论:由灵芝产生的酶被称 为木质素修饰酶(LME)包括LiP,MnP和Lac:并非所有灵芝菌株都能同时产生这
血管疾病、治疗神经衰弱,治疗慢性支气管炎、支气管哮喘,还可以对抗过敏、 抗氧化、抗炎、抗寄生虫、美容等 [3]。总之,灵芝对于心血管系统,呼吸系统,内 分泌和代谢系统等都有益处。 但是本文并没有研究灵芝的药理学性质,而是研究了它另一方面潜在的特性 ——木质素降解酶。文章研究了目前关于来自灵芝属的木质素修饰酶的文献,分 析和探讨了该酶的潜在用途以及木质纤维素降解的组分,结构和过程,也总结了 参与木质素降解的其他酶的数量。灵芝的这一特性具有很大的非药理学价值,比 如木质素降解酶在环境保护上具有潜在作用。这篇文章可作为这方面的一个有用 参考。 二.文章亮点(创新点) 木质纤维素是植物的主要结构组分之一,也是可再生有机材料的来源。它有 三个主要成分:纤维素,半纤维素和木质素。木质纤维素在自然界中含量丰富, 却只有少数被人类利用,会造成环境负担。而灵芝作为白腐真菌的一种,能够释 放木质素降解酶包括 LiP、MnP、Lac 和一些其它的酶,能分解木质纤维素,拥有 很好的发展前景。本文有以下亮点: 1. 文章逻辑严谨,写作顺序清晰。总体上采用了从特点到用途,从大到小, 从一般到特殊的写作顺序。前半部分讲了白腐真菌中的木质纤维素降解酶还原降 解木质素的原理,而在白腐真菌这一大类中,“灵芝具有最强的分解木质素的能 力”,从而具体介绍对于灵芝的降解木质素的研究。而在文章局部采用了由定性 到定量、由现象到本质的顺序,如首先介绍不同种类的灵芝具有不同的产生木质 素降解酶的能力后又定量地介绍三种最大酶活性的数据;如首先介绍白腐真菌还 原木质素成为 CO2 和 H2O 的现象,后介绍白腐真菌的酶和待降解的底物关系和其 中的深层原理。这样的写作顺序循序渐进,符合认知事物的过程,易于让读者接 受。 2. 文章论述语言严谨,具有很高的科学性。在论述白腐真菌的降解过程和特 点时,通过引用前人的实验,介绍了“并非所有的白腐真菌都可以同时分泌 LiP, MnP 和 Lac,一些白腐真菌只能分泌其中一两个;酶的产生与培养条件密切相关。” 而在论述灵芝的降解过程和特点时,又讲到了类似的结论:由灵芝产生的酶被称 为木质素修饰酶(LME)包括 LiP,MnP 和 Lac;并非所有灵芝菌株都能同时产生这
些酶,而一些灵芝菌株只能分泌其中的一种或两种;产生的酶类型受灵芝菌株类 型,培养基组成和培养条件影响。这并非是写作上的冗余重复,而是讲了灵芝作 为白腐真菌的一种,所具有的白腐真菌的共性特点。进而作者又补充了灵芝的个 性特点:不同种类的灵芝具有不同的产生木质素降解酶的能力:灵芝产生酶的能 力受发育阶段的影响。在描述一个事物时,先写共性再写个性,有利于更全面地 了解到它的特征。 3.文章运用了大量举例论证、对比论证,内容详实,有说服力。比如在论述 木质纤维素酶的作用时,先写了传统造纸行业用强酸强碱来处理木质素的方法, 通过对比突显出微生物预处理的生物制浆方法的优越性。再比如在探讨了灵芝的 特点之后,补充介绍了关于Lac的深入研究结果:试图提高灵芝菌株中Lac产生 的水平的研究:Lac在摇瓶中的最佳培养基和条件的研究:关于Lac的基因克隆和 基因序列的研究…进而说明这些对Lc的深入研究为环境管理和修复的应用奠 定了坚实的基础,为后文探讨灵芝的应用做铺垫。 三.读后感 木质纤维素是地球上最丰富的可再生生物质资源,蕴藏量和产量巨大,具有广 阔的开发利用前景。同时,大量的工业和农业活动产生了大量木质纤维素残留物, 例如林业,纸浆和造纸,农业,食品制备,以及城市固体废物。在过去几年中, 这些具有潜在价值的材料在许多国家被视为废物。这不仅是资源的浪费,还会导 致一系列环境污染。根据网上的资料,现在科学家们已经找到了很多木质纤维素 的分解方法,物理方法如蒸汽爆碎、热液分解、微波处理,化学方法如酸处理、 碱处理,物理化学结合法如氨纤维爆破,还有生物方法,即文章中提到的木质素 降解酶降解法。科学家们也已经研发出了如热化学转化、生物催化转化、化学催 化转化,及其协同催化转化等的高值化利用转化途径田。 这周另一门选修课恰好去参观了梦清园环保主题公园,了解到苏州河的历史, 也知道了造纸厂排放的酸性废液对环境的破坏。我想,如果在将来,在造纸业中 能将真菌降解取代传统的强酸强碱溶解木质素,对于环境保护将是一项有巨大潜 力的工程。 然而,生物降解法任重而道远。正如文中所说,到1976年,超过14,000种 真菌被分离并鉴定为具有降解纤维素的能力,但只有少数真菌得到了深入研究
些酶,而一些灵芝菌株只能分泌其中的一种或两种;产生的酶类型受灵芝菌株类 型,培养基组成和培养条件影响。这并非是写作上的冗余重复,而是讲了灵芝作 为白腐真菌的一种,所具有的白腐真菌的共性特点。进而作者又补充了灵芝的个 性特点:不同种类的灵芝具有不同的产生木质素降解酶的能力;灵芝产生酶的能 力受发育阶段的影响。在描述一个事物时,先写共性再写个性,有利于更全面地 了解到它的特征。 3. 文章运用了大量举例论证、对比论证,内容详实,有说服力。比如在论述 木质纤维素酶的作用时,先写了传统造纸行业用强酸强碱来处理木质素的方法, 通过对比突显出微生物预处理的生物制浆方法的优越性。再比如在探讨了灵芝的 特点之后,补充介绍了关于 Lac 的深入研究结果:试图提高灵芝菌株中 Lac 产生 的水平的研究;Lac 在摇瓶中的最佳培养基和条件的研究;关于 Lac 的基因克隆和 基因序列的研究……进而说明这些对 Lac 的深入研究为环境管理和修复的应用奠 定了坚实的基础,为后文探讨灵芝的应用做铺垫。 三.读后感 木质纤维素是地球上最丰富的可再生生物质资源,蕴藏量和产量巨大,具有广 阔的开发利用前景 [4]。同时,大量的工业和农业活动产生了大量木质纤维素残留物, 例如林业,纸浆和造纸,农业,食品制备,以及城市固体废物 [1]。在过去几年中, 这些具有潜在价值的材料在许多国家被视为废物。这不仅是资源的浪费,还会导 致一系列环境污染。根据网上的资料,现在科学家们已经找到了很多木质纤维素 的分解方法,物理方法如蒸汽爆碎、热液分解、微波处理,化学方法如酸处理、 碱处理,物理化学结合法如氨纤维爆破,还有生物方法,即文章中提到的木质素 降解酶降解法。科学家们也已经研发出了如热化学转化、生物催化转化、化学催 化转化,及其协同催化转化等的高值化利用转化途径 [4]。 这周另一门选修课恰好去参观了梦清园环保主题公园,了解到苏州河的历史, 也知道了造纸厂排放的酸性废液对环境的破坏。我想,如果在将来,在造纸业中 能将真菌降解取代传统的强酸强碱溶解木质素,对于环境保护将是一项有巨大潜 力的工程。 然而,生物降解法任重而道远。正如文中所说,到 1976 年,超过 14,000 种 真菌被分离并鉴定为具有降解纤维素的能力,但只有少数真菌得到了深入研究 [1]
在对生物燃料研发生产的过程中,遇到的第一个难题就是成本问题。生物燃料生 产和化石燃料成本的竞争是主要反对驱动因素。第二个便是效率问题。在传统方 法中,高温和高浓度的酸预处理植物生物质具有高成本,低速度和低效率的缺点。 但目前为止,生物降解还没能很好地解决这一问题。生物技术需要解决在降低成 本的同时提高其有效性的问题。按照文中所讲,虽然一些真菌可以产生多种酶来 降解木质纤维素,但产生的量是有限的,而将木质纤维素残基有效转化为糖所需 的是非常高浓度的木质素分解酶。再者,木质纤维素转化为乙醇的限速步骤仍然 是生产过程中最困难的步骤。 对此,作者也指出了未来科学家们的研究方向一一改善真菌水解和筛选具有 良好稳定性和耐受极端条件的菌株已成为优先研究课题。真菌的进一步基因组测 序可以最终鉴定哪些过氧化物酶可以缺失而不损害木质素降解,为利用木质纤维 素残基奠定基础。我也希望,通过科学家们对自然本质的更深入研究,有朝一日 这种新型灵芝菌株将可以在环保事业中占有一席之地。 读完文章,有三个地方并不是很理解,想提出一点小意见。一个是在论述白 腐真菌降解木质素的过程时,提到“白腐真菌的酶与到降解的底物的关系不像典 型酶和底物的关系一样”。但文中对这种关系和典型的酶和底物的关系具体有何 不同并没有阐释,给我造成了一些迷惑。第二个是在论述将木质纤维素生物质转 化为高价值动物饲料时,先论述了“木质素是影响饲料中粗纤维消化率的主要限 制因素,为了提高作物秸秆的营养价值,我们必须开发降低木质素含量和破坏结 构单元之间共价键的方法。”但是后面紧接着引用Béguin,Lin和Asgher的研究 成果,论述了证明了灵芝在降解木质素中的潜在应用,并且它可以受到不同培养 条件和培养基类型的影响。我认为这跟高价值动物饲料好像关系并不密切,并且 前文讲灵芝的木质素酶的特点已经将这两点讲到过了,在这里重申一遍,不知道 是否有冗余之嫌。第三个是对于造纸的论述。木质素是人们提取和利用纤维素时 的副产品同。造纸的过程是提取纤维素,去除木质素,然而灵芝菌中的木质纤维素 酶能否在去除木质素时保留纤维素,这在文章中似乎没有讲述清楚。 最后,感谢老师给了我们这样一个机会,第一次读这样的论文,我也感到任 重而道远。我才读了一篇英文文献就头昏脑涨,而这篇文章旁征博引,站在了很 多很多前人的肩膀上,学习了很多科学家的研究成果,才有了很全面很科学的论 述
在对生物燃料研发生产的过程中,遇到的第一个难题就是成本问题。生物燃料生 产和化石燃料成本的竞争是主要反对驱动因素。第二个便是效率问题。在传统方 法中,高温和高浓度的酸预处理植物生物质具有高成本,低速度和低效率的缺点 [1]。 但目前为止,生物降解还没能很好地解决这一问题。生物技术需要解决在降低成 本的同时提高其有效性的问题。按照文中所讲, 虽然一些真菌可以产生多种酶来 降解木质纤维素,但产生的量是有限的,而将木质纤维素残基有效转化为糖所需 的是非常高浓度的木质素分解酶。再者,木质纤维素转化为乙醇的限速步骤仍然 是生产过程中最困难的步骤 [1]。 对此,作者也指出了未来科学家们的研究方向——改善真菌水解和筛选具有 良好稳定性和耐受极端条件的菌株已成为优先研究课题 [1]。真菌的进一步基因组测 序可以最终鉴定哪些过氧化物酶可以缺失而不损害木质素降解,为利用木质纤维 素残基奠定基础。我也希望,通过科学家们对自然本质的更深入研究,有朝一日 这种新型灵芝菌株将可以在环保事业中占有一席之地。 读完文章,有三个地方并不是很理解,想提出一点小意见。一个是在论述白 腐真菌降解木质素的过程时,提到“白腐真菌的酶与到降解的底物的关系不像典 型酶和底物的关系一样”。但文中对这种关系和典型的酶和底物的关系具体有何 不同并没有阐释,给我造成了一些迷惑。第二个是在论述将木质纤维素生物质转 化为高价值动物饲料时,先论述了“木质素是影响饲料中粗纤维消化率的主要限 制因素,为了提高作物秸秆的营养价值,我们必须开发降低木质素含量和破坏结 构单元之间共价键的方法。”但是后面紧接着引用 Béguin,Lin 和 Asgher 的研究 成果,论述了证明了灵芝在降解木质素中的潜在应用,并且它可以受到不同培养 条件和培养基类型的影响。我认为这跟高价值动物饲料好像关系并不密切,并且 前文讲灵芝的木质素酶的特点已经将这两点讲到过了,在这里重申一遍,不知道 是否有冗余之嫌。第三个是对于造纸的论述。木质素是人们提取和利用纤维素时 的副产品 [5]。造纸的过程是提取纤维素,去除木质素,然而灵芝菌中的木质纤维素 酶能否在去除木质素时保留纤维素,这在文章中似乎没有讲述清楚。 最后,感谢老师给了我们这样一个机会,第一次读这样的论文,我也感到任 重而道远。我才读了一篇英文文献就头昏脑涨,而这篇文章旁征博引,站在了很 多很多前人的肩膀上,学习了很多科学家的研究成果,才有了很全面很科学的论 述
【参考文献】 [1]Zhou X W,Cong WR,Su K Q,et al.Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp:Current status and potential applications[J].CRC Critical Reviews in Microbiology,2013,39(4):11. [2]Zhou X W,Su K Q,Zhang Y M.Applied modern biotechnology for cultivation of Ganoderma and development of their products[J].Applied Microbiology and Biotechnology,2012,93(3):941-963. [3]薛佳辉.中药灵芝的作用[J].中国医药指南,2011,09(29):149-149. [4]朱晨杰,张会岩,肖睿,etal.木质纤维素高值化利用的研究进展[J].中国 科学:化学,2015,45(5):454-478. [5]曾育才,张学先,刘小玲.造纸黑液木质素及其综合利用[J].广东化工, 2005,32(10):11-14
【参考文献】 [1]Zhou X W , Cong W R , Su K Q , et al. Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp: Current status and potential applications[J]. CRC Critical Reviews in Microbiology, 2013, 39(4):11. [2]Zhou X W , Su K Q , Zhang Y M . Applied modern biotechnology for cultivation of Ganoderma and development of their products[J]. Applied Microbiology and Biotechnology, 2012, 93(3):941-963. [3]薛佳辉. 中药灵芝的作用[J]. 中国医药指南, 2011, 09(29):149-149. [4]朱晨杰, 张会岩, 肖睿, et al. 木质纤维素高值化利用的研究进展[J]. 中国 科学:化学, 2015, 45(5):454-478. [5]曾育才, 张学先, 刘小玲. 造纸黑液木质素及其综合利用[J]. 广东化工, 2005, 32(10):11-14